RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491064.5

CTDSP1-210, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSP1, Length 786 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-210ENST00000491064 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDSP1-210ENST00000491064 ATOH7Q8N100 152 aa7.53□□□□□ -1.2
CTDSP1-210ENST00000491064 ERG28Q9UKR5 140 aa7.53□□□□□ -1.2
CTDSP1-210ENST00000491064 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CTDSP1-210ENST00000491064 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CTDSP1-210ENST00000491064 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.51□□□□□ -1.21
CTDSP1-210ENST00000491064 E9PLD3 99 aa7.51□□□□□ -1.21
CTDSP1-210ENST00000491064 H3BRM9 83 aa7.51□□□□□ -1.21
CTDSP1-210ENST00000491064 DLEU1O43261 78 aa7.51□□□□□ -1.21
CTDSP1-210ENST00000491064 COX17Q14061 63 aa7.51□□□□□ -1.21
CTDSP1-210ENST00000491064 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.51□□□□□ -1.21
CTDSP1-210ENST00000491064 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.5□□□□□ -1.21
CTDSP1-210ENST00000491064 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CTDSP1-210ENST00000491064 COX8AP10176 69 aa7.49□□□□□ -1.21
CTDSP1-210ENST00000491064 LINC00483Q53H64 154 aa7.49□□□□□ -1.21
CTDSP1-210ENST00000491064 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.49□□□□□ -1.21
CTDSP1-210ENST00000491064 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.49□□□□□ -1.21
CTDSP1-210ENST00000491064 TMEM223A0PJW6 202 aa7.48□□□□□ -1.21
CTDSP1-210ENST00000491064 SLC25A20O43772 301 aa7.48□□□□□ -1.21
CTDSP1-210ENST00000491064 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CTDSP1-210ENST00000491064 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.48□□□□□ -1.21
CTDSP1-210ENST00000491064 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CTDSP1-210ENST00000491064 MOBPQ13875 183 aa7.47□□□□□ -1.21
CTDSP1-210ENST00000491064 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.47□□□□□ -1.21
CTDSP1-210ENST00000491064 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.47□□□□□ -1.21
CTDSP1-210ENST00000491064 PRYO14603 147 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP1-210ENST00000491064 LEPROTO15243 131 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP1-210ENST00000491064 DDTP30046 118 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP1-210ENST00000491064 SPRR1AP35321 89 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP1-210ENST00000491064 PCOTHQ58A44 107 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP1-210ENST00000491064 PRO1933Q9H354 126 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP1-210ENST00000491064 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP1-210ENST00000491064 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP1-210ENST00000491064 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP1-210ENST00000491064 NMUP48645 174 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP1-210ENST00000491064 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP1-210ENST00000491064 SFTA2Q6UW10 78 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP1-210ENST00000491064 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP1-210ENST00000491064 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CTDSP1-210ENST00000491064 C14orf144Q96I85 54 aa7.44□□□□□ -1.22
CTDSP1-210ENST00000491064 HIGD1BQ9P298 99 aa7.44□□□□□ -1.22
CTDSP1-210ENST00000491064 J3QQQ9 107 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP1-210ENST00000491064 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CTDSP1-210ENST00000491064 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP1-210ENST00000491064 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP1-210ENST00000491064 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP1-210ENST00000491064 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.41□□□□□ -1.22
CTDSP1-210ENST00000491064 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CTDSP1-210ENST00000491064 LINC00158P58513 81 aa7.41□□□□□ -1.22
CTDSP1-210ENST00000491064 M0R2T5 61 aa7.4□□□□□ -1.22
CTDSP1-210ENST00000491064 ERC2-IT1O76042 136 aa7.4□□□□□ -1.22
CTDSP1-210ENST00000491064 PCP2Q8IVA1 136 aa7.4□□□□□ -1.22
CTDSP1-210ENST00000491064 A0A0U1RRA0 63 aa7.39□□□□□ -1.23
CTDSP1-210ENST00000491064 ZNF815PA8K554 130 aa7.39□□□□□ -1.23
CTDSP1-210ENST00000491064 LINC00587B1AMM8 73 aa7.39□□□□□ -1.23
CTDSP1-210ENST00000491064 NCR3O14931 201 aa7.39□□□□□ -1.23
CTDSP1-210ENST00000491064 HERV-K104P63124 156 aa7.39□□□□□ -1.23
CTDSP1-210ENST00000491064 TAL2Q16559 108 aa7.39□□□□□ -1.23
CTDSP1-210ENST00000491064 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.37□□□□□ -1.23
CTDSP1-210ENST00000491064 B5MCH6 92 aa7.37□□□□□ -1.23
CTDSP1-210ENST00000491064 M0R143 59 aa7.37□□□□□ -1.23
CTDSP1-210ENST00000491064 TIMM17BO60830 172 aa7.37□□□□□ -1.23
CTDSP1-210ENST00000491064 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.37□□□□□ -1.23
CTDSP1-210ENST00000491064 Q6ZVH6 145 aa7.37□□□□□ -1.23
CTDSP1-210ENST00000491064 HSD52Q0P140 79 aa7.36□□□□□ -1.23
CTDSP1-210ENST00000491064 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.36□□□□□ -1.23
CTDSP1-210ENST00000491064 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CTDSP1-210ENST00000491064 C9orf92A6NGG3 77 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSP1-210ENST00000491064 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSP1-210ENST00000491064 COPS9Q8WXC6 57 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSP1-210ENST00000491064 Q9BRP9 147 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSP1-210ENST00000491064 A0A0J9YXY3 114 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSP1-210ENST00000491064 SMIM13P0DJ93 91 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSP1-210ENST00000491064 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSP1-210ENST00000491064 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.33□□□□□ -1.24
CTDSP1-210ENST00000491064 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.33□□□□□ -1.24
CTDSP1-210ENST00000491064 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.32□□□□□ -1.24
CTDSP1-210ENST00000491064 SPANXCQ9NY87 97 aa7.32□□□□□ -1.24
CTDSP1-210ENST00000491064 SSPOA2VEC9 5147 aa7.32□□□□□ -1.24
CTDSP1-210ENST00000491064 IFITM1P13164 125 aa7.31□□□□□ -1.24
CTDSP1-210ENST00000491064 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.31□□□□□ -1.24
CTDSP1-210ENST00000491064 Q6ZRX8 168 aa7.31□□□□□ -1.24
CTDSP1-210ENST00000491064 HIST1H4GQ99525 98 aa7.31□□□□□ -1.24
CTDSP1-210ENST00000491064 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDSP1-210ENST00000491064 A6NJY4 79 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDSP1-210ENST00000491064 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDSP1-210ENST00000491064 CEND1Q8N111 149 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDSP1-210ENST00000491064 A6NDN8 102 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDSP1-210ENST00000491064 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDSP1-210ENST00000491064 IGLV6-57P01721 117 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDSP1-210ENST00000491064 LIMD2Q9BT23 127 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDSP1-210ENST00000491064 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDSP1-210ENST00000491064 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CTDSP1-210ENST00000491064 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDSP1-210ENST00000491064 LITAFQ99732 161 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDSP1-210ENST00000491064 USH2AO75445 5202 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDSP1-210ENST00000491064 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.25□□□□□ -1.25
CTDSP1-210ENST00000491064 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.25□□□□□ -1.25
CTDSP1-210ENST00000491064 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.24□□□□□ -1.25
CTDSP1-210ENST00000491064 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.23□□□□□ -1.25
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