RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 UPK3BQ9BT76 320 aa6.4□□□□□ -1.39
POLR1A-208ENST00000486964 APLNQ9ULZ1 77 aa6.4□□□□□ -1.39
POLR1A-208ENST00000486964 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.4□□□□□ -1.39
POLR1A-208ENST00000486964 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.4□□□□□ -1.39
POLR1A-208ENST00000486964 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
POLR1A-208ENST00000486964 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.39□□□□□ -1.39
POLR1A-208ENST00000486964 F8WDY8 70 aa6.39□□□□□ -1.39
POLR1A-208ENST00000486964 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
POLR1A-208ENST00000486964 RYR2Q92736 4967 aa6.39□□□□□ -1.39
POLR1A-208ENST00000486964 DSCR8Q96T75 97 aa6.39□□□□□ -1.39
POLR1A-208ENST00000486964 KLK12Q9UKR0 248 aa6.39□□□□□ -1.39
POLR1A-208ENST00000486964 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.38□□□□□ -1.39
POLR1A-208ENST00000486964 Q6ZQT0 140 aa6.38□□□□□ -1.39
POLR1A-208ENST00000486964 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.38□□□□□ -1.39
POLR1A-208ENST00000486964 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
POLR1A-208ENST00000486964 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
POLR1A-208ENST00000486964 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.37□□□□□ -1.39
POLR1A-208ENST00000486964 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.37□□□□□ -1.39
POLR1A-208ENST00000486964 LCE3BQ5TA77 95 aa6.36□□□□□ -1.39
POLR1A-208ENST00000486964 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.36□□□□□ -1.39
POLR1A-208ENST00000486964 A0A087WVE0 104 aa6.35□□□□□ -1.39
POLR1A-208ENST00000486964 COX7BP24311 80 aa6.35□□□□□ -1.39
POLR1A-208ENST00000486964 CXCL6P80162 114 aa6.35□□□□□ -1.39
POLR1A-208ENST00000486964 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.35□□□□□ -1.39
POLR1A-208ENST00000486964 C10orf25Q5T742 122 aa6.34□□□□□ -1.39
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 NUPR2A6NF83 97 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 FAM229AH3BQW9 127 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 M0R378 163 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 Q6ZQY7 126 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 Q8NDZ9 215 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 LCE2CQ5TA81 110 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 TENM2Q9NT68 2774 aa6.32□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.32□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 Q6ZVQ6 151 aa6.32□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.31□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.31□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 VPREB1P12018 145 aa6.31□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.3□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.3□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.3□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 LYSTQ99698 3801 aa6.29□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.29□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.29□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 HAMPP81172 84 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1A-208ENST00000486964 A0A1B0GW54 56 aa6.27□□□□□ -1.41
POLR1A-208ENST00000486964 NDUFC1O43677 76 aa6.27□□□□□ -1.41
POLR1A-208ENST00000486964 C15orf56Q8N910 161 aa6.27□□□□□ -1.41
POLR1A-208ENST00000486964 DPH3Q96FX2 82 aa6.27□□□□□ -1.41
POLR1A-208ENST00000486964 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1A-208ENST00000486964 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1A-208ENST00000486964 FAM236CP0DP71 79 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1A-208ENST00000486964 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
POLR1A-208ENST00000486964 KLKP1Q107X0 134 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1A-208ENST00000486964 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1A-208ENST00000486964 Q6ZRU5 148 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1A-208ENST00000486964 CASC10Q5T4H9 136 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1A-208ENST00000486964 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
POLR1A-208ENST00000486964 C20orf197Q8N268 126 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1A-208ENST00000486964 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1A-208ENST00000486964 RMI2Q96E14 147 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1A-208ENST00000486964 ERC2-IT1O76042 136 aa6.24□□□□□ -1.41
POLR1A-208ENST00000486964 SYCNQ0VAF6 134 aa6.24□□□□□ -1.41
POLR1A-208ENST00000486964 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.24□□□□□ -1.41
POLR1A-208ENST00000486964 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.24□□□□□ -1.41
POLR1A-208ENST00000486964 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.24□□□□□ -1.41
POLR1A-208ENST00000486964 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.23□□□□□ -1.41
POLR1A-208ENST00000486964 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.23□□□□□ -1.41
POLR1A-208ENST00000486964 C5orf47Q569G3 176 aa6.23□□□□□ -1.41
POLR1A-208ENST00000486964 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.23□□□□□ -1.41
POLR1A-208ENST00000486964 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.23□□□□□ -1.41
POLR1A-208ENST00000486964 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.22□□□□□ -1.41
POLR1A-208ENST00000486964 C3orf84H3BNL1 204 aa6.21□□□□□ -1.42
POLR1A-208ENST00000486964 PRYO14603 147 aa6.21□□□□□ -1.42
POLR1A-208ENST00000486964 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.21□□□□□ -1.42
POLR1A-208ENST00000486964 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.2□□□□□ -1.42
POLR1A-208ENST00000486964 M0R2N4 97 aa6.2□□□□□ -1.42
POLR1A-208ENST00000486964 Q6ZR54 194 aa6.2□□□□□ -1.42
POLR1A-208ENST00000486964 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.19□□□□□ -1.42
POLR1A-208ENST00000486964 H7BZZ5 65 aa6.19□□□□□ -1.42
POLR1A-208ENST00000486964 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
POLR1A-208ENST00000486964 NREPQ16612 68 aa6.19□□□□□ -1.42
POLR1A-208ENST00000486964 Q6ZRP5 223 aa6.19□□□□□ -1.42
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.18□□□□□ -1.42
POLR1A-208ENST00000486964 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.18□□□□□ -1.42
POLR1A-208ENST00000486964 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.17□□□□□ -1.42
POLR1A-208ENST00000486964 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.17□□□□□ -1.42
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