RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484412.1

HDLBP-240, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 669 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-240ENST00000484412 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
HDLBP-240ENST00000484412 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.33□□□□□ -1.08
HDLBP-240ENST00000484412 HERC1Q15751 4861 aa8.33□□□□□ -1.08
HDLBP-240ENST00000484412 NCR3O14931 201 aa8.32□□□□□ -1.08
HDLBP-240ENST00000484412 CTAG1AP78358 180 aa8.31□□□□□ -1.08
HDLBP-240ENST00000484412 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.31□□□□□ -1.08
HDLBP-240ENST00000484412 TNXBP22105 4242 aa8.3□□□□□ -1.08
HDLBP-240ENST00000484412 B5MCH6 92 aa8.3□□□□□ -1.08
HDLBP-240ENST00000484412 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.3□□□□□ -1.08
HDLBP-240ENST00000484412 COX8AP10176 69 aa8.29□□□□□ -1.08
HDLBP-240ENST00000484412 PRLHP81277 87 aa8.29□□□□□ -1.08
HDLBP-240ENST00000484412 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.29□□□□□ -1.08
HDLBP-240ENST00000484412 CRYGAP11844 174 aa8.28□□□□□ -1.08
HDLBP-240ENST00000484412 NPC2P61916 151 aa8.28□□□□□ -1.08
HDLBP-240ENST00000484412 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.27□□□□□ -1.09
HDLBP-240ENST00000484412 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.27□□□□□ -1.09
HDLBP-240ENST00000484412 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
HDLBP-240ENST00000484412 Q6ZRX8 168 aa8.27□□□□□ -1.09
HDLBP-240ENST00000484412 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.26□□□□□ -1.09
HDLBP-240ENST00000484412 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.26□□□□□ -1.09
HDLBP-240ENST00000484412 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
HDLBP-240ENST00000484412 SPRR4Q96PI1 79 aa8.25□□□□□ -1.09
HDLBP-240ENST00000484412 HIGD1BQ9P298 99 aa8.25□□□□□ -1.09
HDLBP-240ENST00000484412 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
HDLBP-240ENST00000484412 LCE2CQ5TA81 110 aa8.24□□□□□ -1.09
HDLBP-240ENST00000484412 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.24□□□□□ -1.09
HDLBP-240ENST00000484412 A0A087X002 238 aa8.23□□□□□ -1.09
HDLBP-240ENST00000484412 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.23□□□□□ -1.09
HDLBP-240ENST00000484412 LINC00483Q53H64 154 aa8.23□□□□□ -1.09
HDLBP-240ENST00000484412 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
HDLBP-240ENST00000484412 Q9BRP9 147 aa8.23□□□□□ -1.09
HDLBP-240ENST00000484412 PYY3Q5JQD4 70 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-240ENST00000484412 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-240ENST00000484412 SPATA45Q537H7 98 aa8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-240ENST00000484412 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-240ENST00000484412 VAMP8Q9BV40 100 aa8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-240ENST00000484412 A4D1N5 150 aa8.19□□□□□ -1.1
HDLBP-240ENST00000484412 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
HDLBP-240ENST00000484412 SLC25A34Q6PIV7 304 aa8.19□□□□□ -1.1
HDLBP-240ENST00000484412 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.19□□□□□ -1.1
HDLBP-240ENST00000484412 ERC2-IT1O76042 136 aa8.18□□□□□ -1.1
HDLBP-240ENST00000484412 SPRR1BP22528 89 aa8.18□□□□□ -1.1
HDLBP-240ENST00000484412 TAL2Q16559 108 aa8.18□□□□□ -1.1
HDLBP-240ENST00000484412 C14orf144Q96I85 54 aa8.18□□□□□ -1.1
HDLBP-240ENST00000484412 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.18□□□□□ -1.1
HDLBP-240ENST00000484412 A0A1B0GWB2 263 aa8.17□□□□□ -1.1
HDLBP-240ENST00000484412 C6orf99Q4VX62 202 aa8.17□□□□□ -1.1
HDLBP-240ENST00000484412 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.17□□□□□ -1.1
HDLBP-240ENST00000484412 A6NDN8 102 aa8.16□□□□□ -1.1
HDLBP-240ENST00000484412 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.16□□□□□ -1.1
HDLBP-240ENST00000484412 COX7BP24311 80 aa8.15□□□□□ -1.1
HDLBP-240ENST00000484412 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.15□□□□□ -1.1
HDLBP-240ENST00000484412 HIST1H4GQ99525 98 aa8.15□□□□□ -1.1
HDLBP-240ENST00000484412 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.14□□□□□ -1.11
HDLBP-240ENST00000484412 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.13□□□□□ -1.11
HDLBP-240ENST00000484412 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.12□□□□□ -1.11
HDLBP-240ENST00000484412 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.12□□□□□ -1.11
HDLBP-240ENST00000484412 VAMP3Q15836 100 aa8.11□□□□□ -1.11
HDLBP-240ENST00000484412 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.11□□□□□ -1.11
HDLBP-240ENST00000484412 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
HDLBP-240ENST00000484412 CFC1BP0CG36 223 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-240ENST00000484412 CFC1P0CG37 223 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-240ENST00000484412 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-240ENST00000484412 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-240ENST00000484412 A0A0B4J2C4 111 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-240ENST00000484412 CEND1Q8N111 149 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-240ENST00000484412 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.08□□□□□ -1.12
HDLBP-240ENST00000484412 A6NJY4 79 aa8.08□□□□□ -1.12
HDLBP-240ENST00000484412 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
HDLBP-240ENST00000484412 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.07□□□□□ -1.12
HDLBP-240ENST00000484412 SPINK1P00995 79 aa8.07□□□□□ -1.12
HDLBP-240ENST00000484412 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.07□□□□□ -1.12
HDLBP-240ENST00000484412 LINC00575Q6W349 94 aa8.07□□□□□ -1.12
HDLBP-240ENST00000484412 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.07□□□□□ -1.12
HDLBP-240ENST00000484412 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
HDLBP-240ENST00000484412 UQCR10Q9UDW1 63 aa8.06□□□□□ -1.12
HDLBP-240ENST00000484412 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.05□□□□□ -1.12
HDLBP-240ENST00000484412 H0YGX0 51 aa8.04□□□□□ -1.12
HDLBP-240ENST00000484412 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.04□□□□□ -1.12
HDLBP-240ENST00000484412 SLC25A20O43772 301 aa8.03□□□□□ -1.12
HDLBP-240ENST00000484412 HSD52Q0P140 79 aa8.03□□□□□ -1.12
HDLBP-240ENST00000484412 SMIM29Q86T20 159 aa8.03□□□□□ -1.12
HDLBP-240ENST00000484412 Q8NBF4 154 aa8.03□□□□□ -1.12
HDLBP-240ENST00000484412 RAB37Q96AX2 223 aa8.02□□□□□ -1.13
HDLBP-240ENST00000484412 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.02□□□□□ -1.13
HDLBP-240ENST00000484412 A0A1B0GX51 115 aa8.01□□□□□ -1.13
HDLBP-240ENST00000484412 hADV29S1A0JD25 119 aa8.01□□□□□ -1.13
HDLBP-240ENST00000484412 TSPAN13O95857 204 aa8.01□□□□□ -1.13
HDLBP-240ENST00000484412 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
HDLBP-240ENST00000484412 Q8N377 158 aa8.01□□□□□ -1.13
HDLBP-240ENST00000484412 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.01□□□□□ -1.13
HDLBP-240ENST00000484412 FXYD2P54710 66 aa8□□□□□ -1.13
HDLBP-240ENST00000484412 CD164Q04900 197 aa7.99□□□□□ -1.13
HDLBP-240ENST00000484412 MOBPQ13875 183 aa7.99□□□□□ -1.13
HDLBP-240ENST00000484412 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
HDLBP-240ENST00000484412 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.98□□□□□ -1.13
HDLBP-240ENST00000484412 SMIM6P0DI80 62 aa7.98□□□□□ -1.13
HDLBP-240ENST00000484412 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.98□□□□□ -1.13
HDLBP-240ENST00000484412 C12orf57Q99622 126 aa7.98□□□□□ -1.13
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