RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480380.1

EMC1-208, Transcript of ER membrane protein complex subunit 1, human

TSL 2

Gene EMC1, Length 3,892 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EMC1-208	ENST00000480380	NDUFC1	O43677	76 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	HIVEP1	P15822	2718 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380		A0A0A0MQY5	61 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	XCL1	P47992	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	SPRR1B	P22528	89 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	COX7B	P24311	80 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	LINC00158	P58513	81 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380		M0R378	163 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	RMI2	Q96E14	147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	C20orf197	Q8N268	126 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	ACAN	P16112	2415 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380		Q8N377	158 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380		Q9BRP9	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380		H0Y9J4	135 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380		Q6ZRU5	148 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	HIVEP2	P31629	2446 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	SNURF	Q9Y675	71 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	PRY	O14603	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	IGF2R	P11717	2491 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380		Q6ZRP5	223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	TENM2	Q9NT68	2774 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EMC1-208	ENST00000480380	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
EMC1-208	ENST00000480380	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EMC1-208	ENST00000480380	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EMC1-208	ENST00000480380	HTN1	P15515	57 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EMC1-208	ENST00000480380		Q6ZRX8	168 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EMC1-208	ENST00000480380	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EMC1-208	ENST00000480380		A0A1W2PNM2	257 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EMC1-208	ENST00000480380	NDUFS5	O43920	106 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EMC1-208	ENST00000480380	UBL5	Q9BZL1	73 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EMC1-208	ENST00000480380	DSCR10	P59022	87 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EMC1-208	ENST00000480380	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EMC1-208	ENST00000480380	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EMC1-208	ENST00000480380	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EMC1-208	ENST00000480380		J3QL48	77 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EMC1-208	ENST00000480380		Q6ZQY7	126 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EMC1-208	ENST00000480380	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EMC1-208	ENST00000480380	POLQ	O75417	2590 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EMC1-208	ENST00000480380	PRR15	Q8IV56	129 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EMC1-208	ENST00000480380	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EMC1-208	ENST00000480380	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EMC1-208	ENST00000480380		F8WEM9	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EMC1-208	ENST00000480380		Q1T7F1	81 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EMC1-208	ENST00000480380	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EMC1-208	ENST00000480380	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EMC1-208	ENST00000480380	CD164	Q04900	197 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EMC1-208	ENST00000480380	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.84	□□□□□ -1.64
EMC1-208	ENST00000480380		Q8NBF4	154 aa		4.84	□□□□□ -1.64
EMC1-208	ENST00000480380	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EMC1-208	ENST00000480380	KMT2A	Q03164	3969 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EMC1-208	ENST00000480380	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EMC1-208	ENST00000480380	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EMC1-208	ENST00000480380	ESRG	Q1W209	222 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EMC1-208	ENST00000480380	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EMC1-208	ENST00000480380	hDV103S1	A0JD37	113 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EMC1-208	ENST00000480380	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EMC1-208	ENST00000480380	COL7A1	Q02388	2944 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EMC1-208	ENST00000480380	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
EMC1-208	ENST00000480380	NREP	Q16612	68 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EMC1-208	ENST00000480380	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EMC1-208	ENST00000480380	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EMC1-208	ENST00000480380	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EMC1-208	ENST00000480380	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EMC1-208	ENST00000480380	CENPE	Q02224	2701 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EMC1-208	ENST00000480380	HSPG2	P98160	4391 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EMC1-208	ENST00000480380	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EMC1-208	ENST00000480380		Q96NJ1	140 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EMC1-208	ENST00000480380	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EMC1-208	ENST00000480380	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EMC1-208	ENST00000480380	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EMC1-208	ENST00000480380	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EMC1-208	ENST00000480380		K7ERS5	55 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EMC1-208	ENST00000480380	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EMC1-208	ENST00000480380	DEFB130B	P0DP73	79 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EMC1-208	ENST00000480380	DEFB130A	P0DP74	79 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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