RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455953.1

NCBP2-208, Transcript of nuclear cap binding protein subunit 2, human

TSL 5

Gene NCBP2, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCBP2-208	ENST00000455953	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NCBP2-208	ENST00000455953	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NCBP2-208	ENST00000455953	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NCBP2-208	ENST00000455953	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NCBP2-208	ENST00000455953	DPM2	O94777	84 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NCBP2-208	ENST00000455953	NMU	P48645	174 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NCBP2-208	ENST00000455953	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
NCBP2-208	ENST00000455953		A0A0A0MQY5	61 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NCBP2-208	ENST00000455953	LEPROT	O15243	131 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NCBP2-208	ENST00000455953	DDT	P30046	118 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NCBP2-208	ENST00000455953	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NCBP2-208	ENST00000455953	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NCBP2-208	ENST00000455953	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953		J3QQQ9	107 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	IGKC	P01834	107 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	FABP4	P15090	132 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	SPINK1	P00995	79 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	TRGC2	P03986	189 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	PCP4	P48539	62 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953		Q8NBF4	154 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	SERF1A	O75920	110 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	DAND5	Q8N907	189 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	NPC2	P61916	151 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	MOBP	Q13875	183 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	SLC25A20	O43772	301 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	NDUFC2	O95298	119 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953		Q6ZRX8	168 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	LPA	P08519	4548 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	C20orf202	A1L168	122 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	LIMD2	Q9BT23	127 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	SPRR1A	P35321	89 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953		Q8NDZ9	215 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NCBP2-208	ENST00000455953	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953		A0A0J9YXY3	114 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953		E9PLD3	99 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953	AKR1D1	P51857	326 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953	TAL2	Q16559	108 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953	YPEL4	Q96NS1	127 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953	TIMM17B	O60830	172 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953	COX7B	P24311	80 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953	KRTDAP	P60985	99 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953		A6NDN8	102 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953		F8WEM9	126 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953		Q9BRP9	147 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953	COLCA2	A8K830	154 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953	VAMP3	Q15836	100 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NCBP2-208	ENST00000455953	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NCBP2-208	ENST00000455953		A0A1B0GWB2	263 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NCBP2-208	ENST00000455953		A4D1N5	150 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NCBP2-208	ENST00000455953		H7C2G1	150 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NCBP2-208	ENST00000455953	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NCBP2-208	ENST00000455953	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NCBP2-208	ENST00000455953	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NCBP2-208	ENST00000455953	LINC01545	Q5VT33	79 aa		4.02	□□□□□ -1.77

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