RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439555.2

IRF1-204, Transcript of interferon regulatory factor 1, humanhuman

TSL 5

Gene IRF1, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1-204ENST00000439555 C5orf52A6NGY3 159 aa6.51□□□□□ -1.37
IRF1-204ENST00000439555 ERC2-IT1O76042 136 aa6.51□□□□□ -1.37
IRF1-204ENST00000439555 Q9BRP9 147 aa6.51□□□□□ -1.37
IRF1-204ENST00000439555 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.5□□□□□ -1.37
IRF1-204ENST00000439555 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.5□□□□□ -1.37
IRF1-204ENST00000439555 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.5□□□□□ -1.37
IRF1-204ENST00000439555 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.5□□□□□ -1.37
IRF1-204ENST00000439555 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
IRF1-204ENST00000439555 TIMM17BO60830 172 aa6.49□□□□□ -1.37
IRF1-204ENST00000439555 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
IRF1-204ENST00000439555 HIST1H2BKO60814 126 aa6.48□□□□□ -1.37
IRF1-204ENST00000439555 HIST1H2BJP06899 126 aa6.48□□□□□ -1.37
IRF1-204ENST00000439555 HIST1H2BOP23527 126 aa6.48□□□□□ -1.37
IRF1-204ENST00000439555 HIST1H2BBP33778 126 aa6.48□□□□□ -1.37
IRF1-204ENST00000439555 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
IRF1-204ENST00000439555 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
IRF1-204ENST00000439555 HIST1H2BDP58876 126 aa6.48□□□□□ -1.37
IRF1-204ENST00000439555 HIST1H2BCP62807 126 aa6.48□□□□□ -1.37
IRF1-204ENST00000439555 MOBPQ13875 183 aa6.48□□□□□ -1.37
IRF1-204ENST00000439555 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.48□□□□□ -1.37
IRF1-204ENST00000439555 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
IRF1-204ENST00000439555 LINC01545Q5VT33 79 aa6.48□□□□□ -1.37
IRF1-204ENST00000439555 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.48□□□□□ -1.37
IRF1-204ENST00000439555 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.48□□□□□ -1.37
IRF1-204ENST00000439555 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.48□□□□□ -1.37
IRF1-204ENST00000439555 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.47□□□□□ -1.37
IRF1-204ENST00000439555 PET117Q6UWS5 81 aa6.47□□□□□ -1.37
IRF1-204ENST00000439555 LITAFQ99732 161 aa6.47□□□□□ -1.37
IRF1-204ENST00000439555 SPANXCQ9NY87 97 aa6.47□□□□□ -1.37
IRF1-204ENST00000439555 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.46□□□□□ -1.38
IRF1-204ENST00000439555 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.46□□□□□ -1.38
IRF1-204ENST00000439555 SLC25A20O43772 301 aa6.45□□□□□ -1.38
IRF1-204ENST00000439555 Q8N377 158 aa6.45□□□□□ -1.38
IRF1-204ENST00000439555 NPC2P61916 151 aa6.44□□□□□ -1.38
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IRF1-204ENST00000439555 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.44□□□□□ -1.38
IRF1-204ENST00000439555 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.44□□□□□ -1.38
IRF1-204ENST00000439555 ZNF815PA8K554 130 aa6.43□□□□□ -1.38
IRF1-204ENST00000439555 SPRR1BP22528 89 aa6.43□□□□□ -1.38
IRF1-204ENST00000439555 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.43□□□□□ -1.38
IRF1-204ENST00000439555 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.43□□□□□ -1.38
IRF1-204ENST00000439555 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.43□□□□□ -1.38
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IRF1-204ENST00000439555 C3orf79P0CE67 100 aa6.41□□□□□ -1.38
IRF1-204ENST00000439555 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.41□□□□□ -1.38
IRF1-204ENST00000439555 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
IRF1-204ENST00000439555 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.4□□□□□ -1.38
IRF1-204ENST00000439555 COPS9Q8WXC6 57 aa6.4□□□□□ -1.38
IRF1-204ENST00000439555 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.39□□□□□ -1.39
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IRF1-204ENST00000439555 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
IRF1-204ENST00000439555 C20orf202A1L168 122 aa6.38□□□□□ -1.39
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IRF1-204ENST00000439555 Q6ZVH6 145 aa6.38□□□□□ -1.39
IRF1-204ENST00000439555 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.38□□□□□ -1.39
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IRF1-204ENST00000439555 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.36□□□□□ -1.39
IRF1-204ENST00000439555 LIMD2Q9BT23 127 aa6.36□□□□□ -1.39
IRF1-204ENST00000439555 CD164Q04900 197 aa6.35□□□□□ -1.39
IRF1-204ENST00000439555 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.34□□□□□ -1.39
IRF1-204ENST00000439555 A0A1B0GWB2 263 aa6.34□□□□□ -1.39
IRF1-204ENST00000439555 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
IRF1-204ENST00000439555 TAL2Q16559 108 aa6.34□□□□□ -1.39
IRF1-204ENST00000439555 A4D1N5 150 aa6.33□□□□□ -1.4
IRF1-204ENST00000439555 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.33□□□□□ -1.4
IRF1-204ENST00000439555 Q5XG85 94 aa6.32□□□□□ -1.4
IRF1-204ENST00000439555 PRO1933Q9H354 126 aa6.32□□□□□ -1.4
IRF1-204ENST00000439555 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.31□□□□□ -1.4
IRF1-204ENST00000439555 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.31□□□□□ -1.4
IRF1-204ENST00000439555 A6NDN8 102 aa6.31□□□□□ -1.4
IRF1-204ENST00000439555 PCP2Q8IVA1 136 aa6.3□□□□□ -1.4
IRF1-204ENST00000439555 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.3□□□□□ -1.4
IRF1-204ENST00000439555 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.3□□□□□ -1.4
IRF1-204ENST00000439555 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.3□□□□□ -1.4
IRF1-204ENST00000439555 CFC1BP0CG36 223 aa6.29□□□□□ -1.4
IRF1-204ENST00000439555 Q1RN00 199 aa6.29□□□□□ -1.4
IRF1-204ENST00000439555 SMIM29Q86T20 159 aa6.29□□□□□ -1.4
IRF1-204ENST00000439555 ATOH7Q8N100 152 aa6.29□□□□□ -1.4
IRF1-204ENST00000439555 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
IRF1-204ENST00000439555 H7C2G1 150 aa6.28□□□□□ -1.4
IRF1-204ENST00000439555 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.28□□□□□ -1.4
IRF1-204ENST00000439555 LCE2CQ5TA81 110 aa6.27□□□□□ -1.41
IRF1-204ENST00000439555 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.26□□□□□ -1.41
IRF1-204ENST00000439555 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.25□□□□□ -1.41
IRF1-204ENST00000439555 VAMP3Q15836 100 aa6.25□□□□□ -1.41
IRF1-204ENST00000439555 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.24□□□□□ -1.41
IRF1-204ENST00000439555 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.24□□□□□ -1.41
IRF1-204ENST00000439555 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.23□□□□□ -1.41
IRF1-204ENST00000439555 S100A2P29034 98 aa6.23□□□□□ -1.41
IRF1-204ENST00000439555 C1orf195Q5TG92 126 aa6.23□□□□□ -1.41
IRF1-204ENST00000439555 LINC00575Q6W349 94 aa6.22□□□□□ -1.41
IRF1-204ENST00000439555 C9orf92A6NGG3 77 aa6.21□□□□□ -1.42
IRF1-204ENST00000439555 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
IRF1-204ENST00000439555 MT1HP80294 61 aa6.21□□□□□ -1.42
IRF1-204ENST00000439555 PCOTHQ58A44 107 aa6.21□□□□□ -1.42
IRF1-204ENST00000439555 TCL1BO95988 128 aa6.2□□□□□ -1.42
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