RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436289.6

NELFE-204, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 906 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-204ENST00000436289 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.83□□□□□ -1.16
NELFE-204ENST00000436289 SPRR1BP22528 89 aa7.83□□□□□ -1.16
NELFE-204ENST00000436289 BAGE3Q86Y29 109 aa7.83□□□□□ -1.16
NELFE-204ENST00000436289 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.83□□□□□ -1.16
NELFE-204ENST00000436289 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.83□□□□□ -1.16
NELFE-204ENST00000436289 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
NELFE-204ENST00000436289 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.8□□□□□ -1.16
NELFE-204ENST00000436289 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.8□□□□□ -1.16
NELFE-204ENST00000436289 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
NELFE-204ENST00000436289 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.8□□□□□ -1.16
NELFE-204ENST00000436289 TMEM223A0PJW6 202 aa7.79□□□□□ -1.16
NELFE-204ENST00000436289 C1orf195Q5TG92 126 aa7.79□□□□□ -1.16
NELFE-204ENST00000436289 PRO1933Q9H354 126 aa7.79□□□□□ -1.16
NELFE-204ENST00000436289 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.78□□□□□ -1.16
NELFE-204ENST00000436289 H7C2G1 150 aa7.78□□□□□ -1.16
NELFE-204ENST00000436289 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.77□□□□□ -1.17
NELFE-204ENST00000436289 C20orf202A1L168 122 aa7.77□□□□□ -1.17
NELFE-204ENST00000436289 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
NELFE-204ENST00000436289 HBDP02042 147 aa7.77□□□□□ -1.17
NELFE-204ENST00000436289 COX19Q49B96 90 aa7.77□□□□□ -1.17
NELFE-204ENST00000436289 NDUFC2O95298 119 aa7.76□□□□□ -1.17
NELFE-204ENST00000436289 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.76□□□□□ -1.17
NELFE-204ENST00000436289 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
NELFE-204ENST00000436289 A0A096LNJ9 63 aa7.75□□□□□ -1.17
NELFE-204ENST00000436289 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.75□□□□□ -1.17
NELFE-204ENST00000436289 LINC00614P0C842 121 aa7.74□□□□□ -1.17
NELFE-204ENST00000436289 SMIM6P0DI80 62 aa7.74□□□□□ -1.17
NELFE-204ENST00000436289 AKR1D1P51857 326 aa7.74□□□□□ -1.17
NELFE-204ENST00000436289 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.74□□□□□ -1.17
NELFE-204ENST00000436289 C12orf57Q99622 126 aa7.74□□□□□ -1.17
NELFE-204ENST00000436289 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.74□□□□□ -1.17
NELFE-204ENST00000436289 COLCA2A8K830 154 aa7.73□□□□□ -1.17
NELFE-204ENST00000436289 LCE2BO14633 110 aa7.73□□□□□ -1.17
NELFE-204ENST00000436289 RHEBQ15382 184 aa7.73□□□□□ -1.17
NELFE-204ENST00000436289 SMIM29Q86T20 159 aa7.73□□□□□ -1.17
NELFE-204ENST00000436289 S100A6P06703 90 aa7.71□□□□□ -1.18
NELFE-204ENST00000436289 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.71□□□□□ -1.18
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.71□□□□□ -1.18
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.71□□□□□ -1.18
NELFE-204ENST00000436289 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.7□□□□□ -1.18
NELFE-204ENST00000436289 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.69□□□□□ -1.18
NELFE-204ENST00000436289 TCL1BO95988 128 aa7.69□□□□□ -1.18
NELFE-204ENST00000436289 S100PP25815 95 aa7.69□□□□□ -1.18
NELFE-204ENST00000436289 MT2AP02795 61 aa7.68□□□□□ -1.18
NELFE-204ENST00000436289 TAL2Q16559 108 aa7.68□□□□□ -1.18
NELFE-204ENST00000436289 Q75L30 129 aa7.68□□□□□ -1.18
NELFE-204ENST00000436289 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.68□□□□□ -1.18
NELFE-204ENST00000436289 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.67□□□□□ -1.18
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.67□□□□□ -1.18
NELFE-204ENST00000436289 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.66□□□□□ -1.18
NELFE-204ENST00000436289 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.66□□□□□ -1.18
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.66□□□□□ -1.18
NELFE-204ENST00000436289 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
NELFE-204ENST00000436289 PMCHL1Q16048 86 aa7.65□□□□□ -1.18
NELFE-204ENST00000436289 Q1RN00 199 aa7.65□□□□□ -1.18
NELFE-204ENST00000436289 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.63□□□□□ -1.19
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP10-10P60014 251 aa7.62□□□□□ -1.19
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa7.62□□□□□ -1.19
NELFE-204ENST00000436289 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.62□□□□□ -1.19
NELFE-204ENST00000436289 YPEL4Q96NS1 127 aa7.62□□□□□ -1.19
NELFE-204ENST00000436289 MT1FP04733 61 aa7.61□□□□□ -1.19
NELFE-204ENST00000436289 NMUP48645 174 aa7.61□□□□□ -1.19
NELFE-204ENST00000436289 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.61□□□□□ -1.19
NELFE-204ENST00000436289 LEPROTO15243 131 aa7.6□□□□□ -1.19
NELFE-204ENST00000436289 S100A2P29034 98 aa7.59□□□□□ -1.19
NELFE-204ENST00000436289 PCP2Q8IVA1 136 aa7.59□□□□□ -1.19
NELFE-204ENST00000436289 COX7BP24311 80 aa7.58□□□□□ -1.2
NELFE-204ENST00000436289 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
NELFE-204ENST00000436289 C6orf99Q4VX62 202 aa7.57□□□□□ -1.2
NELFE-204ENST00000436289 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.57□□□□□ -1.2
NELFE-204ENST00000436289 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.57□□□□□ -1.2
NELFE-204ENST00000436289 J3QQQ9 107 aa7.56□□□□□ -1.2
NELFE-204ENST00000436289 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.55□□□□□ -1.2
NELFE-204ENST00000436289 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.54□□□□□ -1.2
NELFE-204ENST00000436289 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
NELFE-204ENST00000436289 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.54□□□□□ -1.2
NELFE-204ENST00000436289 SPANXCQ9NY87 97 aa7.54□□□□□ -1.2
NELFE-204ENST00000436289 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.53□□□□□ -1.2
NELFE-204ENST00000436289 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.53□□□□□ -1.2
NELFE-204ENST00000436289 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
NELFE-204ENST00000436289 HERVK_113P61574 105 aa7.53□□□□□ -1.2
NELFE-204ENST00000436289 PLNP26678 52 aa7.52□□□□□ -1.21
NELFE-204ENST00000436289 A0A0G2JQZ4 141 aa7.51□□□□□ -1.21
NELFE-204ENST00000436289 HIST1H2BKO60814 126 aa7.51□□□□□ -1.21
NELFE-204ENST00000436289 HIST1H2BJP06899 126 aa7.51□□□□□ -1.21
NELFE-204ENST00000436289 HIST1H2BOP23527 126 aa7.51□□□□□ -1.21
NELFE-204ENST00000436289 HIST1H2BBP33778 126 aa7.51□□□□□ -1.21
NELFE-204ENST00000436289 HIST1H2BDP58876 126 aa7.51□□□□□ -1.21
NELFE-204ENST00000436289 NPC2P61916 151 aa7.51□□□□□ -1.21
NELFE-204ENST00000436289 HIST1H2BCP62807 126 aa7.51□□□□□ -1.21
NELFE-204ENST00000436289 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.51□□□□□ -1.21
NELFE-204ENST00000436289 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
NELFE-204ENST00000436289 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.51□□□□□ -1.21
NELFE-204ENST00000436289 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.51□□□□□ -1.21
NELFE-204ENST00000436289 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.51□□□□□ -1.21
NELFE-204ENST00000436289 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
NELFE-204ENST00000436289 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.5□□□□□ -1.21
NELFE-204ENST00000436289 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.5□□□□□ -1.21
NELFE-204ENST00000436289 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.49□□□□□ -1.21
NELFE-204ENST00000436289 FAM236CP0DP71 79 aa7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.4 ms