RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 RETNQ9HD89 108 aa9.9□□□□□ -0.82
TOP3B-206ENST00000436282 PRO0628Q9UI54 55 aa9.9□□□□□ -0.82
TOP3B-206ENST00000436282 IGKV4-1P06312 121 aa9.88□□□□□ -0.83
TOP3B-206ENST00000436282 CAMK2N2Q96S95 79 aa9.88□□□□□ -0.83
TOP3B-206ENST00000436282 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa9.87□□□□□ -0.83
TOP3B-206ENST00000436282 HIGD2BQ4VC39 106 aa9.87□□□□□ -0.83
TOP3B-206ENST00000436282 Q8N9L7 120 aa9.87□□□□□ -0.83
TOP3B-206ENST00000436282 OCR1Q9BZK8 76 aa9.85□□□□□ -0.83
TOP3B-206ENST00000436282 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.85□□□□□ -0.83
TOP3B-206ENST00000436282 STAB1Q9NY15 2570 aa9.84□□□□□ -0.83
TOP3B-206ENST00000436282 Q6ZRU5 148 aa9.84□□□□□ -0.83
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TOP3B-206ENST00000436282 PRYO14603 147 aa9.83□□□□□ -0.84
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP10-11P60412 298 aa9.82□□□□□ -0.84
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa9.81□□□□□ -0.84
TOP3B-206ENST00000436282 C3orf84H3BNL1 204 aa9.8□□□□□ -0.84
TOP3B-206ENST00000436282 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
TOP3B-206ENST00000436282 Q6ZTC4 211 aa9.8□□□□□ -0.84
TOP3B-206ENST00000436282 WFDC10BQ8IUB3 73 aa9.8□□□□□ -0.84
TOP3B-206ENST00000436282 C15orf56Q8N910 161 aa9.8□□□□□ -0.84
TOP3B-206ENST00000436282 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa9.79□□□□□ -0.84
TOP3B-206ENST00000436282 MAST4O15021 2626 aa9.78□□□□□ -0.84
TOP3B-206ENST00000436282 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP9.77□□□□□ -0.841e-7■□□□□ 9.3
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TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa9.77□□□□□ -0.85
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TOP3B-206ENST00000436282 Q8N377 158 aa9.76□□□□□ -0.85
TOP3B-206ENST00000436282 NOTCH1P46531 2555 aa9.76□□□□□ -0.85
TOP3B-206ENST00000436282 KCNQ1DNQ9H478 68 aa9.76□□□□□ -0.85
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TOP3B-206ENST00000436282 F8WDY8 70 aa9.73□□□□□ -0.85
TOP3B-206ENST00000436282 NKAPP1Q8N9T2 125 aa9.73□□□□□ -0.85
TOP3B-206ENST00000436282 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
TOP3B-206ENST00000436282 H3BNG1 76 aa9.72□□□□□ -0.85
TOP3B-206ENST00000436282 SMIM29Q86T20 159 aa9.72□□□□□ -0.85
TOP3B-206ENST00000436282 MPLKIPQ8TAP9 179 aa9.71□□□□□ -0.85
TOP3B-206ENST00000436282 C7orf33Q8WU49 177 aa9.71□□□□□ -0.85
TOP3B-206ENST00000436282 SYCNQ0VAF6 134 aa9.7□□□□□ -0.86
TOP3B-206ENST00000436282 BRK1Q8WUW1 75 aa9.7□□□□□ -0.86
TOP3B-206ENST00000436282 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa9.7□□□□□ -0.86
TOP3B-206ENST00000436282 FAM30AQ9NZY2 134 aa9.7□□□□□ -0.86
TOP3B-206ENST00000436282 LCE6AA0A183 80 aa9.69□□□□□ -0.86
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1W2PNM2 257 aa9.69□□□□□ -0.86
TOP3B-206ENST00000436282 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa9.69□□□□□ -0.86
TOP3B-206ENST00000436282 ANK2Q01484 3957 aa9.69□□□□□ -0.86
TOP3B-206ENST00000436282 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa9.69□□□□□ -0.86
TOP3B-206ENST00000436282 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
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TOP3B-206ENST00000436282 Q6ZRX8 168 aa9.67□□□□□ -0.86
TOP3B-206ENST00000436282 C11orf45Q8TAV5 145 aa9.67□□□□□ -0.86
TOP3B-206ENST00000436282 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa9.67□□□□□ -0.86
TOP3B-206ENST00000436282 COL6A5A8TX70 2615 aa9.67□□□□□ -0.86
TOP3B-206ENST00000436282 C1orf137Q5JT78 98 aa9.66□□□□□ -0.86
TOP3B-206ENST00000436282 PKIGQ9Y2B9 76 aa9.66□□□□□ -0.86
TOP3B-206ENST00000436282 Q8NBF4 154 aa9.66□□□□□ -0.86
TOP3B-206ENST00000436282 Q9BRP9 147 aa9.65□□□□□ -0.86
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
TOP3B-206ENST00000436282 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa9.64□□□□□ -0.87
TOP3B-206ENST00000436282 hDV103S1A0JD37 113 aa9.63□□□□□ -0.87
TOP3B-206ENST00000436282 LINC01556Q5JQF7 62 aa9.63□□□□□ -0.87
TOP3B-206ENST00000436282 SPRR4Q96PI1 79 aa9.63□□□□□ -0.87
TOP3B-206ENST00000436282 TLX1NBP0CAT3 122 aa9.62□□□□□ -0.87
TOP3B-206ENST00000436282 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa9.62□□□□□ -0.87
TOP3B-206ENST00000436282 SPRR1AP35321 89 aa9.62□□□□□ -0.87
TOP3B-206ENST00000436282 DSCR10P59022 87 aa9.62□□□□□ -0.87
TOP3B-206ENST00000436282 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
TOP3B-206ENST00000436282 RPL37AP8A6NKH3 93 aa9.61□□□□□ -0.87
TOP3B-206ENST00000436282 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa9.61□□□□□ -0.87
TOP3B-206ENST00000436282 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa9.61□□□□□ -0.87
TOP3B-206ENST00000436282 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa9.6□□□□□ -0.87
TOP3B-206ENST00000436282 K7EQZ3 153 aa9.59□□□□□ -0.87
TOP3B-206ENST00000436282 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa9.58□□□□□ -0.88
TOP3B-206ENST00000436282 FAM168BA1KXE4 195 aa9.57□□□□□ -0.88
TOP3B-206ENST00000436282 C1orf64Q8NEQ6 169 aa9.57□□□□□ -0.88
TOP3B-206ENST00000436282 CMYA5Q8N3K9 4069 aa9.56□□□□□ -0.88
TOP3B-206ENST00000436282 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TOP3B-206ENST00000436282 C1orf195Q5TG92 126 aa9.55□□□□□ -0.88
TOP3B-206ENST00000436282 Q1T7F1 81 aa9.55□□□□□ -0.88
TOP3B-206ENST00000436282 HCG22E2RYF7 251 aa9.54□□□□□ -0.88
TOP3B-206ENST00000436282 MGAM2Q2M2H8 2515 aa9.54□□□□□ -0.88
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa9.53□□□□□ -0.88
TOP3B-206ENST00000436282 DNAH10OSP0CZ25 163 aa9.53□□□□□ -0.88
TOP3B-206ENST00000436282 UBE2BP63146 152 aa9.53□□□□□ -0.88
TOP3B-206ENST00000436282 LRCOL1A6NCL2 159 aa9.52□□□□□ -0.89
TOP3B-206ENST00000436282 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa9.52□□□□□ -0.89
TOP3B-206ENST00000436282 LINC00588Q9Y4M8 146 aa9.52□□□□□ -0.89
TOP3B-206ENST00000436282 CASC10Q5T4H9 136 aa9.52□□□□□ -0.89
TOP3B-206ENST00000436282 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
TOP3B-206ENST00000436282 LINC00476Q8WZB0 136 aa9.51□□□□□ -0.89
TOP3B-206ENST00000436282 PSCAO43653 123 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-206ENST00000436282 BAHCC1Q9P281 2608 aa9.48□□□□□ -0.89
TOP3B-206ENST00000436282 K7EIL1 84 aa9.48□□□□□ -0.89
TOP3B-206ENST00000436282 NDUFB1O75438 58 aa9.48□□□□□ -0.89
TOP3B-206ENST00000436282 REG3GQ6UW15 175 aa9.47□□□□□ -0.89
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