RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa11.78□□□□□ -0.52
LIMS1-208ENST00000428064 HIST1H2BKO60814 126 aa11.76□□□□□ -0.53
LIMS1-208ENST00000428064 HIST1H2BJP06899 126 aa11.76□□□□□ -0.53
LIMS1-208ENST00000428064 HIST1H2BOP23527 126 aa11.76□□□□□ -0.53
LIMS1-208ENST00000428064 HIST1H2BBP33778 126 aa11.76□□□□□ -0.53
LIMS1-208ENST00000428064 HIST1H2BDP58876 126 aa11.76□□□□□ -0.53
LIMS1-208ENST00000428064 HIST1H2BCP62807 126 aa11.76□□□□□ -0.53
LIMS1-208ENST00000428064 HIST2H2BEQ16778 126 aa11.76□□□□□ -0.53
LIMS1-208ENST00000428064 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
LIMS1-208ENST00000428064 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa11.76□□□□□ -0.53
LIMS1-208ENST00000428064 HIST1H2BHQ93079 126 aa11.76□□□□□ -0.53
LIMS1-208ENST00000428064 HIST1H2BNQ99877 126 aa11.76□□□□□ -0.53
LIMS1-208ENST00000428064 HIST1H2BMQ99879 126 aa11.76□□□□□ -0.53
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0J9YXY3 114 aa11.75□□□□□ -0.53
LIMS1-208ENST00000428064 C5orf52A6NGY3 159 aa11.75□□□□□ -0.53
LIMS1-208ENST00000428064 E9PLD3 99 aa11.75□□□□□ -0.53
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
LIMS1-208ENST00000428064 CBY1Q9Y3M2 126 aa11.75□□□□□ -0.53
LIMS1-208ENST00000428064 SLC25A20O43772 301 aa11.74□□□□□ -0.53
LIMS1-208ENST00000428064 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa11.73□□□□□ -0.53
LIMS1-208ENST00000428064 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
LIMS1-208ENST00000428064 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa11.71□□□□□ -0.53
LIMS1-208ENST00000428064 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
LIMS1-208ENST00000428064 NPC2P61916 151 aa11.71□□□□□ -0.53
LIMS1-208ENST00000428064 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
LIMS1-208ENST00000428064 C9orf153Q5TBE3 101 aa11.68□□□□□ -0.54
LIMS1-208ENST00000428064 LITAFQ99732 161 aa11.68□□□□□ -0.54
LIMS1-208ENST00000428064 SPANXCQ9NY87 97 aa11.68□□□□□ -0.54
LIMS1-208ENST00000428064 TIMM17BO60830 172 aa11.67□□□□□ -0.54
LIMS1-208ENST00000428064 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa11.66□□□□□ -0.54
LIMS1-208ENST00000428064 SPRR1BP22528 89 aa11.65□□□□□ -0.54
LIMS1-208ENST00000428064 XP32Q5T750 250 aa11.65□□□□□ -0.54
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00308Q8TCZ7 52 aa11.65□□□□□ -0.54
LIMS1-208ENST00000428064 LINC01545Q5VT33 79 aa11.64□□□□□ -0.55
LIMS1-208ENST00000428064 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa11.64□□□□□ -0.55
LIMS1-208ENST00000428064 PET117Q6UWS5 81 aa11.63□□□□□ -0.55
LIMS1-208ENST00000428064 SLC25A34Q6PIV7 304 aa11.62□□□□□ -0.55
LIMS1-208ENST00000428064 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa11.62□□□□□ -0.55
LIMS1-208ENST00000428064 SPANXDQ9BXN6 97 aa11.61□□□□□ -0.55
LIMS1-208ENST00000428064 C3orf79P0CE67 100 aa11.6□□□□□ -0.55
LIMS1-208ENST00000428064 KRTDAPP60985 99 aa11.6□□□□□ -0.55
LIMS1-208ENST00000428064 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
LIMS1-208ENST00000428064 OR13C6PQ8NH95 151 aa11.59□□□□□ -0.55
LIMS1-208ENST00000428064 LIMD2Q9BT23 127 aa11.59□□□□□ -0.55
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF815PA8K554 130 aa11.58□□□□□ -0.56
LIMS1-208ENST00000428064 TTTY13Q9BZ97 58 aa11.58□□□□□ -0.56
LIMS1-208ENST00000428064 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00518Q8N0U6 118 aa11.56□□□□□ -0.56
LIMS1-208ENST00000428064 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
LIMS1-208ENST00000428064 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa11.55□□□□□ -0.56
LIMS1-208ENST00000428064 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa11.52□□□□□ -0.57
LIMS1-208ENST00000428064 C20orf202A1L168 122 aa11.52□□□□□ -0.57
LIMS1-208ENST00000428064 COX7BP24311 80 aa11.52□□□□□ -0.57
LIMS1-208ENST00000428064 C6orf99Q4VX62 202 aa11.52□□□□□ -0.57
LIMS1-208ENST00000428064 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa11.5□□□□□ -0.57
LIMS1-208ENST00000428064 CD164Q04900 197 aa11.5□□□□□ -0.57
LIMS1-208ENST00000428064 ATOH7Q8N100 152 aa11.5□□□□□ -0.57
LIMS1-208ENST00000428064 SCGB1D4Q6XE38 83 aa11.49□□□□□ -0.57
LIMS1-208ENST00000428064 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa11.47□□□□□ -0.57
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD39Q53RE8 183 aa11.47□□□□□ -0.57
LIMS1-208ENST00000428064 HRCT1Q6UXD1 115 aa11.47□□□□□ -0.57
LIMS1-208ENST00000428064 COPS9Q8WXC6 57 aa11.47□□□□□ -0.57
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1B0GWB2 263 aa11.45□□□□□ -0.58
LIMS1-208ENST00000428064 TAL2Q16559 108 aa11.45□□□□□ -0.58
LIMS1-208ENST00000428064 PRO1933Q9H354 126 aa11.45□□□□□ -0.58
LIMS1-208ENST00000428064 IFITM1P13164 125 aa11.44□□□□□ -0.58
LIMS1-208ENST00000428064 Q5XG85 94 aa11.44□□□□□ -0.58
LIMS1-208ENST00000428064 Q6ZVH6 145 aa11.44□□□□□ -0.58
LIMS1-208ENST00000428064 Q1RN00 199 aa11.43□□□□□ -0.58
LIMS1-208ENST00000428064 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa11.42□□□□□ -0.58
LIMS1-208ENST00000428064 LCE2CQ5TA81 110 aa11.42□□□□□ -0.58
LIMS1-208ENST00000428064 DEFB105AQ8NG35 78 aa11.42□□□□□ -0.58
LIMS1-208ENST00000428064 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
LIMS1-208ENST00000428064 SMIM29Q86T20 159 aa11.41□□□□□ -0.58
LIMS1-208ENST00000428064 H7C2G1 150 aa11.4□□□□□ -0.58
LIMS1-208ENST00000428064 PCP2Q8IVA1 136 aa11.4□□□□□ -0.58
LIMS1-208ENST00000428064 A4D1N5 150 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMS1-208ENST00000428064 C9orf92A6NGG3 77 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMS1-208ENST00000428064 AKR1D1P51857 326 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMS1-208ENST00000428064 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMS1-208ENST00000428064 PCOTHQ58A44 107 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMS1-208ENST00000428064 A6NDN8 102 aa11.37□□□□□ -0.59
LIMS1-208ENST00000428064 S100A2P29034 98 aa11.36□□□□□ -0.59
LIMS1-208ENST00000428064 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa11.35□□□□□ -0.59
LIMS1-208ENST00000428064 HIST3H2BBQ8N257 126 aa11.35□□□□□ -0.59
LIMS1-208ENST00000428064 MUSTN1Q8IVN3 82 aa11.34□□□□□ -0.59
LIMS1-208ENST00000428064 HIST1H2BLQ99880 126 aa11.34□□□□□ -0.59
LIMS1-208ENST00000428064 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
LIMS1-208ENST00000428064 C1orf195Q5TG92 126 aa11.33□□□□□ -0.6
LIMS1-208ENST00000428064 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa11.32□□□□□ -0.6
LIMS1-208ENST00000428064 S100A1P23297 94 aa11.32□□□□□ -0.6
LIMS1-208ENST00000428064 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
LIMS1-208ENST00000428064 S100A6P06703 90 aa11.29□□□□□ -0.6
LIMS1-208ENST00000428064 MT1HP80294 61 aa11.29□□□□□ -0.6
LIMS1-208ENST00000428064 SMIM11BQ8TCY0 68 aa11.29□□□□□ -0.6
LIMS1-208ENST00000428064 HSBP1L1C9JCN9 74 aa11.28□□□□□ -0.6
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0G2JQZ4 141 aa11.25□□□□□ -0.61
LIMS1-208ENST00000428064 CFC1BP0CG36 223 aa11.25□□□□□ -0.61
LIMS1-208ENST00000428064 RPL37P61927 97 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
LIMS1-208ENST00000428064 TCL1BO95988 128 aa11.24□□□□□ -0.61
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