RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409251.7

PTPRN-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-202ENST00000409251 DEFB116Q30KQ4 102 aa8.76□□□□□ -1.01
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PTPRN-202ENST00000409251 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRN-202ENST00000409251 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRN-202ENST00000409251 PRO0255Q9UI72 69 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRN-202ENST00000409251 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRN-202ENST00000409251 KLKP1Q107X0 134 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRN-202ENST00000409251 APOC4P55056 127 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRN-202ENST00000409251 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRN-202ENST00000409251 PRYO14603 147 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRN-202ENST00000409251 IL17DQ8TAD2 202 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRN-202ENST00000409251 SEC61GP60059 68 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRN-202ENST00000409251 KIAA0087Q14695 138 aa8.71□□□□□ -1.02
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PTPRN-202ENST00000409251 ESRGQ1W209 222 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRN-202ENST00000409251 A0A0G2JQZ4 141 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRN-202ENST00000409251 A0A1W2PNN7 141 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRN-202ENST00000409251 Q6ZTC4 211 aa8.67□□□□□ -1.02
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PTPRN-202ENST00000409251 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRN-202ENST00000409251 CXCL6P80162 114 aa8.66□□□□□ -1.02
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PTPRN-202ENST00000409251 LINC00167Q96N53 147 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRN-202ENST00000409251 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRN-202ENST00000409251 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRN-202ENST00000409251 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRN-202ENST00000409251 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.62□□□□□ -1.03
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PTPRN-202ENST00000409251 LYRM9A8MSI8 78 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRN-202ENST00000409251 MDFIQ99750 246 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRN-202ENST00000409251 IGKV4-1P06312 121 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRN-202ENST00000409251 A0A096LNI7 61 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRN-202ENST00000409251 IGLV6-57P01721 117 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRN-202ENST00000409251 Q6ZRU5 148 aa8.59□□□□□ -1.04
PTPRN-202ENST00000409251 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRN-202ENST00000409251 UBE2BP63146 152 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRN-202ENST00000409251 C1orf64Q8NEQ6 169 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRN-202ENST00000409251 A8MU10 97 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRN-202ENST00000409251 EPM2AB3EWF7 344 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRN-202ENST00000409251 A8MUN3 132 aa8.56□□□□□ -1.04
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PTPRN-202ENST00000409251 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.56□□□□□ -1.04
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PTPRN-202ENST00000409251 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRN-202ENST00000409251 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
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PTPRN-202ENST00000409251 COL7A1Q02388 2944 aa8.54□□□□□ -1.04
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PTPRN-202ENST00000409251 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.53□□□□□ -1.04
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PTPRN-202ENST00000409251 C1orf137Q5JT78 98 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRN-202ENST00000409251 LINC00208Q96KT6 92 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRN-202ENST00000409251 K7EQZ3 153 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRN-202ENST00000409251 M0R378 163 aa8.52□□□□□ -1.05
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PTPRN-202ENST00000409251 F8WDY8 70 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRN-202ENST00000409251 K7EIL1 84 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRN-202ENST00000409251 BCE1O60756 84 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRN-202ENST00000409251 VPREB1P12018 145 aa8.49□□□□□ -1.05
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PTPRN-202ENST00000409251 Q6ZRP5 223 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRN-202ENST00000409251 FAM168BA1KXE4 195 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRN-202ENST00000409251 TRAV22A0A0B4J277 110 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRN-202ENST00000409251 LELP1Q5T871 98 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRN-202ENST00000409251 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRN-202ENST00000409251 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRN-202ENST00000409251 Q8N377 158 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRN-202ENST00000409251 PRR15LQ9BU68 103 aa8.46□□□□□ -1.05
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PTPRN-202ENST00000409251 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRN-202ENST00000409251 C7orf33Q8WU49 177 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRN-202ENST00000409251 hDV103S1A0JD37 113 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRN-202ENST00000409251 MP68P56378 58 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRN-202ENST00000409251 SYCNQ0VAF6 134 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRN-202ENST00000409251 A0A1W2PNM2 257 aa8.44□□□□□ -1.06
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PTPRN-202ENST00000409251 A6NED7 52 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRN-202ENST00000409251 H3BQ85 93 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRN-202ENST00000409251 PCOTHQ58A44 107 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRN-202ENST00000409251 PSCAO43653 123 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRN-202ENST00000409251 ERC2-IT1O76042 136 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRN-202ENST00000409251 PRLHP81277 87 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRN-202ENST00000409251 DNHD1Q96M86 4753 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRN-202ENST00000409251 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRN-202ENST00000409251 H0Y9J4 135 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRN-202ENST00000409251 HCG22E2RYF7 251 aa8.39□□□□□ -1.07
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