RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C9orf118A6NHY6 69 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DDTP30046 118 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 S100A7L2Q5SY68 101 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGLV6-57P01721 117 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPRR1AP35321 89 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC00518Q8N0U6 118 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC00337Q8N6G1 96 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MT1HL1P0DM35 61 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DLEU1O43261 78 aa9.21□□□□□ -0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COX8AP10176 69 aa9.21□□□□□ -0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HERC1Q15751 4861 aa9.2□□□□□ -0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa9.2□□□□□ -0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa9.2□□□□□ -0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRLHP81277 87 aa9.2□□□□□ -0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VAMP8Q9BV40 100 aa9.2□□□□□ -0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa9.19□□□□□ -0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP10-8P60410 259 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MUSTN1Q8IVN3 82 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PAM16Q9Y3D7 125 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPATA45Q537H7 98 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR13C6PQ8NH95 151 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PYY3Q5JQD4 70 aa9.15□□□□□ -0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HIGD2AQ9BW72 106 aa9.15□□□□□ -0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM229BQ4G0N7 80 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC25A34Q6PIV7 304 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q6ZRX8 168 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRR26Q8N8Z3 221 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CRYGAP11844 174 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C14orf144Q96I85 54 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HIGD1BQ9P298 99 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HIST1H4GQ99525 98 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNXBP22105 4242 aa9.1□□□□□ -0.95
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A6NDN8 102 aa9.1□□□□□ -0.95
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMCR5Q8TEV8 140 aa9.1□□□□□ -0.95
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa9.08□□□□□ -0.96
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A4D1N5 150 aa9.08□□□□□ -0.96
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPRR4Q96PI1 79 aa9.08□□□□□ -0.96
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C6orf99Q4VX62 202 aa9.07□□□□□ -0.96
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q9BRP9 147 aa9.07□□□□□ -0.96
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A087X002 238 aa9.06□□□□□ -0.96
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TAL2Q16559 108 aa9.06□□□□□ -0.96
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa9.06□□□□□ -0.96
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C2orf91Q6ZV80 131 aa9.05□□□□□ -0.96
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1B0GWB2 263 aa9.04□□□□□ -0.96
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COX7BP24311 80 aa9.04□□□□□ -0.96
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC00483Q53H64 154 aa9.04□□□□□ -0.96
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TYMSOSQ8TAI1 123 aa9.04□□□□□ -0.96
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANAPC11Q9NYG5 84 aa9.04□□□□□ -0.96
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ERC2-IT1O76042 136 aa9.03□□□□□ -0.96
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HMCN2Q8NDA2 5059 aa9.02□□□□□ -0.96
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa9.01□□□□□ -0.97
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMIM11BQ8TCY0 68 aa9.01□□□□□ -0.97
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VAMP3Q15836 100 aa9□□□□□ -0.97
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UQCR10Q9UDW1 63 aa9□□□□□ -0.97
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A0B4J2C4 111 aa8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CTAG1AP78358 180 aa8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CEND1Q8N111 149 aa8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C12orf57Q99622 126 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CFC1BP0CG36 223 aa8.97□□□□□ -0.97
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CFC1P0CG37 223 aa8.97□□□□□ -0.97
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMIM6P0DI80 62 aa8.97□□□□□ -0.97
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HSD52Q0P140 79 aa8.97□□□□□ -0.97
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAB37Q96AX2 223 aa8.97□□□□□ -0.97
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPRR1BP22528 89 aa8.95□□□□□ -0.98
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.95□□□□□ -0.98
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC25A20O43772 301 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.93□□□□□ -0.98
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.92□□□□□ -0.98
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FXYD2P54710 66 aa8.91□□□□□ -0.98
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC00575Q6W349 94 aa8.91□□□□□ -0.98
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.91□□□□□ -0.98
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.9□□□□□ -0.98
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.9□□□□□ -0.98
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRIAP1O43715 76 aa8.9□□□□□ -0.98
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.89□□□□□ -0.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.88□□□□□ -0.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 hADV29S1A0JD25 119 aa8.88□□□□□ -0.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 H7C2G1 150 aa8.88□□□□□ -0.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MOBPQ13875 183 aa8.88□□□□□ -0.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 H0YGX0 51 aa8.87□□□□□ -0.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SNCGO76070 127 aa8.87□□□□□ -0.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q8NBF4 154 aa8.87□□□□□ -0.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa8.86□□□□□ -0.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TSPAN13O95857 204 aa8.86□□□□□ -0.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q1RN00 199 aa8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms