RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 ANK2Q01484 3957 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 M0QY20 66 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 DSCR9P59020 149 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 COX6A2Q02221 97 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 RPL37AP8A6NKH3 93 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 INSP01308 110 aa4.42□□□□□ -1.7
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RABGEF1-202ENST00000380828 A8MTW9 85 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1-202ENST00000380828 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1-202ENST00000380828 NPBQ8NG41 125 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1-202ENST00000380828 NF1P21359 2839 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1-202ENST00000380828 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1-202ENST00000380828 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1-202ENST00000380828 TENM2Q9NT68 2774 aa4.28□□□□□ -1.72
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