RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP10-11P60412 298 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
TMOD1-202ENST00000375175 BPY2O14599 106 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD1-202ENST00000375175 COX7BP24311 80 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD1-202ENST00000375175 H3BNG1 76 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD1-202ENST00000375175 ESRGQ1W209 222 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD1-202ENST00000375175 Q6ZRU5 148 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD1-202ENST00000375175 F8WDY8 70 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD1-202ENST00000375175 PDE6GP18545 87 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD1-202ENST00000375175 Q8N9L7 120 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD1-202ENST00000375175 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.72□□□□□ -1.01
TMOD1-202ENST00000375175 VPREB1P12018 145 aa8.72□□□□□ -1.01
TMOD1-202ENST00000375175 C1orf195Q5TG92 126 aa8.71□□□□□ -1.02
TMOD1-202ENST00000375175 C15orf56Q8N910 161 aa8.71□□□□□ -1.02
TMOD1-202ENST00000375175 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.71□□□□□ -1.02
TMOD1-202ENST00000375175 H3BQ85 93 aa8.71□□□□□ -1.02
TMOD1-202ENST00000375175 M0R378 163 aa8.7□□□□□ -1.02
TMOD1-202ENST00000375175 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
TMOD1-202ENST00000375175 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
TMOD1-202ENST00000375175 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TMOD1-202ENST00000375175 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD1-202ENST00000375175 PRYO14603 147 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD1-202ENST00000375175 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD1-202ENST00000375175 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD1-202ENST00000375175 ERC2-IT1O76042 136 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD1-202ENST00000375175 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.021e-8■□□□□ 10.2
TMOD1-202ENST00000375175 Q6ZRP5 223 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD1-202ENST00000375175 IGKV4-1P06312 121 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD1-202ENST00000375175 V9GYY9 64 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD1-202ENST00000375175 OCR1Q9BZK8 76 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD1-202ENST00000375175 SYCNQ0VAF6 134 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD1-202ENST00000375175 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD1-202ENST00000375175 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD1-202ENST00000375175 SEC61GP60059 68 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD1-202ENST00000375175 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD1-202ENST00000375175 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.62□□□□□ -1.03
TMOD1-202ENST00000375175 TENM3Q9P273 2699 aa8.62□□□□□ -1.03
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD1-202ENST00000375175 F8P00451 2351 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-202ENST00000375175 C3orf84H3BNL1 204 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-202ENST00000375175 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-202ENST00000375175 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-202ENST00000375175 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-202ENST00000375175 ANK2Q01484 3957 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-202ENST00000375175 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.57□□□□□ -1.04
TMOD1-202ENST00000375175 C7orf33Q8WU49 177 aa8.57□□□□□ -1.04
TMOD1-202ENST00000375175 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.56□□□□□ -1.04
TMOD1-202ENST00000375175 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.56□□□□□ -1.04
TMOD1-202ENST00000375175 STAB1Q9NY15 2570 aa8.56□□□□□ -1.04
TMOD1-202ENST00000375175 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.55□□□□□ -1.04
TMOD1-202ENST00000375175 hDV103S1A0JD37 113 aa8.55□□□□□ -1.04
TMOD1-202ENST00000375175 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
TMOD1-202ENST00000375175 SMIM29Q86T20 159 aa8.55□□□□□ -1.04
TMOD1-202ENST00000375175 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.54□□□□□ -1.04
TMOD1-202ENST00000375175 CASC10Q5T4H9 136 aa8.54□□□□□ -1.04
TMOD1-202ENST00000375175 FAM168BA1KXE4 195 aa8.53□□□□□ -1.04
TMOD1-202ENST00000375175 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
TMOD1-202ENST00000375175 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.51□□□□□ -1.05
TMOD1-202ENST00000375175 PRR15Q8IV56 129 aa8.51□□□□□ -1.05
TMOD1-202ENST00000375175 Q8N377 158 aa8.51□□□□□ -1.05
TMOD1-202ENST00000375175 C1orf64Q8NEQ6 169 aa8.51□□□□□ -1.05
TMOD1-202ENST00000375175 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.5□□□□□ -1.05
TMOD1-202ENST00000375175 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.5□□□□□ -1.05
TMOD1-202ENST00000375175 NOTCH1P46531 2555 aa8.49□□□□□ -1.05
TMOD1-202ENST00000375175 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.49□□□□□ -1.05
TMOD1-202ENST00000375175 Q6ZRX8 168 aa8.49□□□□□ -1.05
TMOD1-202ENST00000375175 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.49□□□□□ -1.05
TMOD1-202ENST00000375175 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.48□□□□□ -1.05
TMOD1-202ENST00000375175 PSPHP1O15172 72 aa8.48□□□□□ -1.05
TMOD1-202ENST00000375175 Q1T7F1 81 aa8.48□□□□□ -1.05
TMOD1-202ENST00000375175 MAST4O15021 2626 aa8.48□□□□□ -1.05
TMOD1-202ENST00000375175 LCE6AA0A183 80 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD1-202ENST00000375175 Q9BRP9 147 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD1-202ENST00000375175 PMAIP1Q13794 54 aa8.46□□□□□ -1.05
TMOD1-202ENST00000375175 PRR4Q16378 134 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD1-202ENST00000375175 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD1-202ENST00000375175 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD1-202ENST00000375175 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
TMOD1-202ENST00000375175 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD1-202ENST00000375175 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TMOD1-202ENST00000375175 TRAV22A0A0B4J277 110 aa8.43□□□□□ -1.06
TMOD1-202ENST00000375175 UBE2BP63146 152 aa8.43□□□□□ -1.06
TMOD1-202ENST00000375175 SPRR1AP35321 89 aa8.43□□□□□ -1.06
TMOD1-202ENST00000375175 A0A1W2PNM2 257 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD1-202ENST00000375175 C1orf137Q5JT78 98 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD1-202ENST00000375175 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD1-202ENST00000375175 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
TMOD1-202ENST00000375175 K7EIL1 84 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD1-202ENST00000375175 BAHCC1Q9P281 2608 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD1-202ENST00000375175 K7EQZ3 153 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD1-202ENST00000375175 REG3GQ6UW15 175 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD1-202ENST00000375175 A8MU10 97 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD1-202ENST00000375175 DSCR10P59022 87 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD1-202ENST00000375175 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD1-202ENST00000375175 A8MUN3 132 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD1-202ENST00000375175 PSCAO43653 123 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD1-202ENST00000375175 TNP2Q05952 138 aa8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.1 ms