RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.87□□□□□ -1.63
CTPS1-201ENST00000372616 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CTPS1-201ENST00000372616 TENM1Q9UKZ4 2725 aa4.87□□□□□ -1.63
CTPS1-201ENST00000372616 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CTPS1-201ENST00000372616 NREPQ16612 68 aa4.87□□□□□ -1.63
CTPS1-201ENST00000372616 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CTPS1-201ENST00000372616 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-201ENST00000372616 COX7BP24311 80 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-201ENST00000372616 Q6ZQY7 126 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-201ENST00000372616 LINC00336Q6ZUF6 198 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-201ENST00000372616 LYRM9A8MSI8 78 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-201ENST00000372616 BPY2O14599 106 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-201ENST00000372616 REG3AQ06141 175 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-201ENST00000372616 RMI2Q96E14 147 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-201ENST00000372616 SNURFQ9Y675 71 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-201ENST00000372616 APOC4P55056 127 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-201ENST00000372616 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-201ENST00000372616 SPAG11BQ08648 103 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-201ENST00000372616 LINC00269Q8N2A0 174 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-201ENST00000372616 TRAV10A0A0B4J240 114 aa4.84□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.84□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP10-2P60368 255 aa4.84□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.84□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 ANGP03950 147 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa4.83□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 DEFB130BP0DP73 79 aa4.82□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 DEFB130AP0DP74 79 aa4.82□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.82□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 ESRGQ1W209 222 aa4.82□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 WFDC10AQ9H1F0 79 aa4.82□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 V9GYY9 64 aa4.82□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.82□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 TM2D3Q9BRN9 247 aa4.82□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 VWFP04275 2813 aa4.81□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 CLPSL2Q6UWE3 100 aa4.81□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.8□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 A0A0U1RQV1 116 aa4.8□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 BRK1Q8WUW1 75 aa4.8□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 M0R378 163 aa4.8□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 OCR1Q9BZK8 76 aa4.8□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 NOTCH3Q9UM47 2321 aa4.8□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 LELP1Q5T871 98 aa4.79□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 C1orf195Q5TG92 126 aa4.79□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 PRR34Q9NV39 138 aa4.79□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 CELA1Q9UNI1 258 aa4.79□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.79□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.79□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 M0R2N4 97 aa4.78□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 IGKV4-1P06312 121 aa4.78□□□□□ -1.64
CTPS1-201ENST00000372616 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa4.77□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 NDUFB1O75438 58 aa4.77□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP10-11P60412 298 aa4.77□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 Q8NDZ9 215 aa4.77□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 LCE6AA0A183 80 aa4.76□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 DAD1P61803 113 aa4.76□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 DEFB135Q30KP9 77 aa4.76□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 PKIGQ9Y2B9 76 aa4.76□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 Q1T7F1 81 aa4.75□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 SCXQ7RTU7 201 aa4.75□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 PRR15Q8IV56 129 aa4.75□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 LINC00474Q9P2X8 69 aa4.75□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.75□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 Q6ZTC4 211 aa4.75□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.75□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.75□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 A0A096LPF7 62 aa4.74□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.74□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 TGP01266 2768 aa4.74□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa4.73□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 hDV103S1A0JD37 113 aa4.73□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 SPART-AS1P0CW21 52 aa4.73□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.72□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.72□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 Q8NAQ8 132 aa4.72□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa4.72□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.72□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 KLK12Q9UKR0 248 aa4.72□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa4.72□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 H3BNG1 76 aa4.72□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.72□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.72□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 ANK2Q01484 3957 aa4.71□□□□□ -1.65
CTPS1-201ENST00000372616 Q6ZRU5 148 aa4.71□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.71□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.71□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 NOTCH1P46531 2555 aa4.71□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 K7EIL1 84 aa4.7□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 C3orf84H3BNL1 204 aa4.69□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 H3BPC8 53 aa4.69□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 CDK2AP2O75956 126 aa4.69□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.69□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 SMIM29Q86T20 159 aa4.69□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 Q8NBF4 154 aa4.69□□□□□ -1.66
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