RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368671.3

CLRN3-201, Transcript of clarin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN3, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN3-201ENST00000368671 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.79□□□□□ -1.48
CLRN3-201ENST00000368671 LINC00587B1AMM8 73 aa5.79□□□□□ -1.48
CLRN3-201ENST00000368671 H0Y8G0 127 aa5.79□□□□□ -1.48
CLRN3-201ENST00000368671 ERC2-IT1O76042 136 aa5.79□□□□□ -1.48
CLRN3-201ENST00000368671 APOC3P02656 99 aa5.79□□□□□ -1.48
CLRN3-201ENST00000368671 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
CLRN3-201ENST00000368671 DDTP30046 118 aa5.78□□□□□ -1.48
CLRN3-201ENST00000368671 NDUFA5Q16718 116 aa5.78□□□□□ -1.48
CLRN3-201ENST00000368671 Q8N377 158 aa5.78□□□□□ -1.48
CLRN3-201ENST00000368671 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.77□□□□□ -1.49
CLRN3-201ENST00000368671 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.77□□□□□ -1.49
CLRN3-201ENST00000368671 FAM19A2Q8N3H0 131 aa5.77□□□□□ -1.49
CLRN3-201ENST00000368671 HSBP1O75506 76 aa5.76□□□□□ -1.49
CLRN3-201ENST00000368671 SNAPINO95295 136 aa5.76□□□□□ -1.49
CLRN3-201ENST00000368671 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CLRN3-201ENST00000368671 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.76□□□□□ -1.49
CLRN3-201ENST00000368671 Q9BRP9 147 aa5.76□□□□□ -1.49
CLRN3-201ENST00000368671 LEPROTO15243 131 aa5.75□□□□□ -1.49
CLRN3-201ENST00000368671 SLC25A20O43772 301 aa5.75□□□□□ -1.49
CLRN3-201ENST00000368671 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.75□□□□□ -1.49
CLRN3-201ENST00000368671 Q6ZRX8 168 aa5.75□□□□□ -1.49
CLRN3-201ENST00000368671 SVBPQ8N300 66 aa5.75□□□□□ -1.49
CLRN3-201ENST00000368671 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.75□□□□□ -1.49
CLRN3-201ENST00000368671 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.74□□□□□ -1.49
CLRN3-201ENST00000368671 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CLRN3-201ENST00000368671 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.73□□□□□ -1.49
CLRN3-201ENST00000368671 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.73□□□□□ -1.49
CLRN3-201ENST00000368671 YPEL4Q96NS1 127 aa5.73□□□□□ -1.49
CLRN3-201ENST00000368671 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa5.72□□□□□ -1.49
CLRN3-201ENST00000368671 J3QQQ9 107 aa5.72□□□□□ -1.49
CLRN3-201ENST00000368671 LEPROTL1O95214 131 aa5.72□□□□□ -1.49
CLRN3-201ENST00000368671 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
CLRN3-201ENST00000368671 HERVK_113P61574 105 aa5.72□□□□□ -1.49
CLRN3-201ENST00000368671 NPC2P61916 151 aa5.72□□□□□ -1.49
CLRN3-201ENST00000368671 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
CLRN3-201ENST00000368671 NDUFC2O95298 119 aa5.71□□□□□ -1.5
CLRN3-201ENST00000368671 IGLV6-57P01721 117 aa5.71□□□□□ -1.5
CLRN3-201ENST00000368671 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.71□□□□□ -1.5
CLRN3-201ENST00000368671 PMCHL2Q9BQD1 86 aa5.71□□□□□ -1.5
CLRN3-201ENST00000368671 PLNP26678 52 aa5.7□□□□□ -1.5
CLRN3-201ENST00000368671 NMUP48645 174 aa5.7□□□□□ -1.5
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CLRN3-201ENST00000368671 SERF1AO75920 110 aa5.69□□□□□ -1.5
CLRN3-201ENST00000368671 DPM2O94777 84 aa5.69□□□□□ -1.5
CLRN3-201ENST00000368671 FABP4P15090 132 aa5.69□□□□□ -1.5
CLRN3-201ENST00000368671 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.69□□□□□ -1.5
CLRN3-201ENST00000368671 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa5.69□□□□□ -1.5
CLRN3-201ENST00000368671 IGKCP01834 107 aa5.68□□□□□ -1.5
CLRN3-201ENST00000368671 TRGC2P03986 189 aa5.68□□□□□ -1.5
CLRN3-201ENST00000368671 A0A0J9YXY3 114 aa5.67□□□□□ -1.5
CLRN3-201ENST00000368671 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CLRN3-201ENST00000368671 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.67□□□□□ -1.5
CLRN3-201ENST00000368671 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.67□□□□□ -1.5
CLRN3-201ENST00000368671 C9orf92A6NGG3 77 aa5.66□□□□□ -1.5
CLRN3-201ENST00000368671 TRIAP1O43715 76 aa5.66□□□□□ -1.5
CLRN3-201ENST00000368671 PCOTHQ58A44 107 aa5.66□□□□□ -1.5
CLRN3-201ENST00000368671 LIMD2Q9BT23 127 aa5.66□□□□□ -1.5
CLRN3-201ENST00000368671 OR13C6PQ8NH95 151 aa5.65□□□□□ -1.5
CLRN3-201ENST00000368671 CBY1Q9Y3M2 126 aa5.65□□□□□ -1.5
CLRN3-201ENST00000368671 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.64□□□□□ -1.51
CLRN3-201ENST00000368671 C5orf52A6NGY3 159 aa5.64□□□□□ -1.51
CLRN3-201ENST00000368671 SLC25A34Q6PIV7 304 aa5.64□□□□□ -1.51
CLRN3-201ENST00000368671 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.64□□□□□ -1.51
CLRN3-201ENST00000368671 E9PLD3 99 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN3-201ENST00000368671 SPRR1BP22528 89 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN3-201ENST00000368671 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN3-201ENST00000368671 MT1HP80294 61 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN3-201ENST00000368671 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN3-201ENST00000368671 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN3-201ENST00000368671 SPANXCQ9NY87 97 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN3-201ENST00000368671 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN3-201ENST00000368671 Q1RN00 199 aa5.61□□□□□ -1.51
CLRN3-201ENST00000368671 DEFB105AQ8NG35 78 aa5.61□□□□□ -1.51
CLRN3-201ENST00000368671 COX7BP24311 80 aa5.6□□□□□ -1.51
CLRN3-201ENST00000368671 TAL2Q16559 108 aa5.6□□□□□ -1.51
CLRN3-201ENST00000368671 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.6□□□□□ -1.51
CLRN3-201ENST00000368671 LITAFQ99732 161 aa5.6□□□□□ -1.51
CLRN3-201ENST00000368671 H7C2G1 150 aa5.59□□□□□ -1.51
CLRN3-201ENST00000368671 CFC1BP0CG36 223 aa5.59□□□□□ -1.51
CLRN3-201ENST00000368671 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
CLRN3-201ENST00000368671 C6orf99Q4VX62 202 aa5.59□□□□□ -1.51
CLRN3-201ENST00000368671 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.59□□□□□ -1.51
CLRN3-201ENST00000368671 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.58□□□□□ -1.52
CLRN3-201ENST00000368671 TIMM17BO60830 172 aa5.58□□□□□ -1.52
CLRN3-201ENST00000368671 PRO1933Q9H354 126 aa5.58□□□□□ -1.52
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF815PA8K554 130 aa5.57□□□□□ -1.52
CLRN3-201ENST00000368671 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa5.57□□□□□ -1.52
CLRN3-201ENST00000368671 CD164Q04900 197 aa5.57□□□□□ -1.52
CLRN3-201ENST00000368671 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.57□□□□□ -1.52
CLRN3-201ENST00000368671 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5.56□□□□□ -1.52
CLRN3-201ENST00000368671 A0A0G2JQZ4 141 aa5.55□□□□□ -1.52
CLRN3-201ENST00000368671 COLCA2A8K830 154 aa5.55□□□□□ -1.52
CLRN3-201ENST00000368671 LINC00518Q8N0U6 118 aa5.55□□□□□ -1.52
CLRN3-201ENST00000368671 AKR1D1P51857 326 aa5.54□□□□□ -1.52
CLRN3-201ENST00000368671 SMIM29Q86T20 159 aa5.54□□□□□ -1.52
CLRN3-201ENST00000368671 M0R2T5 61 aa5.53□□□□□ -1.52
CLRN3-201ENST00000368671 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
CLRN3-201ENST00000368671 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
CLRN3-201ENST00000368671 C1orf195Q5TG92 126 aa5.53□□□□□ -1.52
CLRN3-201ENST00000368671 LINC01545Q5VT33 79 aa5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms