RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 PSPHP1O15172 72 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-201ENST00000345716 SPACA4Q8TDM5 124 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-201ENST00000345716 TM2D3Q9BRN9 247 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-201ENST00000345716 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-201ENST00000345716 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
NISCH-201ENST00000345716 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-201ENST00000345716 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
NISCH-201ENST00000345716 SPINK1P00995 79 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-201ENST00000345716 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-201ENST00000345716 IGKV2-30P06310 120 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-201ENST00000345716 XIRP2A4UGR9 3374 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-201ENST00000345716 CDH23Q9H251 3354 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-201ENST00000345716 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa13.58□□□□□ -0.23
NISCH-201ENST00000345716 TRIOO75962 3097 aa13.58□□□□□ -0.23
NISCH-201ENST00000345716 TLX1NBP0CAT3 122 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-201ENST00000345716 C1orf195Q5TG92 126 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-201ENST00000345716 MAST4O15021 2626 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-201ENST00000345716 Q8N377 158 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-201ENST00000345716 K7EQZ3 153 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-201ENST00000345716 AKAP13Q12802 2813 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-201ENST00000345716 FAM104AQ969W3 186 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-201ENST00000345716 CASC10Q5T4H9 136 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-201ENST00000345716 TRAV22A0A0B4J277 110 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-201ENST00000345716 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-201ENST00000345716 IGFL1Q6UW32 110 aa13.52□□□□□ -0.24
NISCH-201ENST00000345716 H3BPC8 53 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-201ENST00000345716 RPS28P62857 69 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
NISCH-201ENST00000345716 PMAIP1Q13794 54 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-201ENST00000345716 A8MWP4 228 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-201ENST00000345716 TYMSOSQ8TAI1 123 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-201ENST00000345716 C9orf163Q8N9P6 203 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-201ENST00000345716 LINC00313P59037 77 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-201ENST00000345716 VPS13AQ96RL7 3174 aa13.47□□□□□ -0.25
NISCH-201ENST00000345716 A0A087WTM6 91 aa13.46□□□□□ -0.26
NISCH-201ENST00000345716 CR1P17927 2039 aa13.45□□□□□ -0.26
NISCH-201ENST00000345716 DSPP15924 2871 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
NISCH-201ENST00000345716 A0A0G2JQZ4 141 aa13.44□□□□□ -0.26
NISCH-201ENST00000345716 A0A1W2PNN7 141 aa13.44□□□□□ -0.26
NISCH-201ENST00000345716 APLNQ9ULZ1 77 aa13.44□□□□□ -0.26
NISCH-201ENST00000345716 C7orf65Q6ZTY9 151 aa13.43□□□□□ -0.26
NISCH-201ENST00000345716 ACYP2P14621 99 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-201ENST00000345716 ERC2-IT1O76042 136 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-201ENST00000345716 ZNF861PO60384 105 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-201ENST00000345716 CNBPP62633 177 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
NISCH-201ENST00000345716 C4orf26Q17RF5 130 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-201ENST00000345716 FAM229AH3BQW9 127 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-201ENST00000345716 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
NISCH-201ENST00000345716 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
NISCH-201ENST00000345716 PRR15Q8IV56 129 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-201ENST00000345716 CHD6Q8TD26 2715 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-201ENST00000345716 C8orf87E5RJ46 101 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-201ENST00000345716 SPAG11AQ6PDA7 123 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-201ENST00000345716 WIPF1O43516 503 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-201ENST00000345716 A0A1W2PNM2 257 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-201ENST00000345716 Q96NJ1 140 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-201ENST00000345716 SZT2Q5T011 3432 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-201ENST00000345716 A0A1B0GU69 56 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-201ENST00000345716 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-201ENST00000345716 LINC01600Q96MT4 127 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-201ENST00000345716 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-201ENST00000345716 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
NISCH-201ENST00000345716 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa13.29□□□□□ -0.28
NISCH-201ENST00000345716 C8orf17Q9NRJ1 99 aa13.29□□□□□ -0.28
NISCH-201ENST00000345716 KLKP1Q107X0 134 aa13.29□□□□□ -0.28
NISCH-201ENST00000345716 ANAPC11Q9NYG5 84 aa13.29□□□□□ -0.28
NISCH-201ENST00000345716 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-201ENST00000345716 PRO0628Q9UI54 55 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-201ENST00000345716 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa13.27□□□□□ -0.28
NISCH-201ENST00000345716 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
NISCH-201ENST00000345716 IGSF10Q6WRI0 2623 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-201ENST00000345716 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-201ENST00000345716 A0A1B0GVX0 72 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-201ENST00000345716 FRYQ5TBA9 3013 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-201ENST00000345716 SPRR4Q96PI1 79 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-201ENST00000345716 IGLV7-43P04211 117 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-201ENST00000345716 DSCR10P59022 87 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-201ENST00000345716 LAMA1P25391 3075 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-201ENST00000345716 TEX15Q9BXT5 2789 aa13.21□□□□□ -0.3
NISCH-201ENST00000345716 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa13.19□□□□□ -0.3
NISCH-201ENST00000345716 H7BZZ5 65 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-201ENST00000345716 VCANP13611 3396 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-201ENST00000345716 COA5Q86WW8 74 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-201ENST00000345716 UNC79Q9P2D8 2635 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-201ENST00000345716 LINC00304Q8N9R0 145 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-201ENST00000345716 Q8NDZ9 215 aa13.13□□□□□ -0.31
NISCH-201ENST00000345716 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
NISCH-201ENST00000345716 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
NISCH-201ENST00000345716 DNAH14Q0VDD8 3507 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-201ENST00000345716 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-201ENST00000345716 A8MUN3 132 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-201ENST00000345716 COL6A5A8TX70 2615 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-201ENST00000345716 TNP2Q05952 138 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-201ENST00000345716 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-201ENST00000345716 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
NISCH-201ENST00000345716 STAB1Q9NY15 2570 aa13.03□□□□□ -0.32
NISCH-201ENST00000345716 NOTCH1P46531 2555 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-201ENST00000345716 C9orf92A6NGG3 77 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-201ENST00000345716 LINC00336Q6ZUF6 198 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-201ENST00000345716 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
NISCH-201ENST00000345716 OCR1Q9BZK8 76 aa12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 121.9 ms