RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 DNAH1Q9P2D7 4330 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRR-202ENST00000342084 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
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PTPRR-202ENST00000342084 H3BNG1 76 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRR-202ENST00000342084 J3KT08 172 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRR-202ENST00000342084 SYCNQ0VAF6 134 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRR-202ENST00000342084 C11orf45Q8TAV5 145 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRR-202ENST00000342084 RPL37AP8A6NKH3 93 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM258P61165 79 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRR-202ENST00000342084 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRR-202ENST00000342084 C7orf33Q8WU49 177 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRR-202ENST00000342084 DNAH3Q8TD57 4116 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRR-202ENST00000342084 MAST4O15021 2626 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRR-202ENST00000342084 C3orf84H3BNL1 204 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRR-202ENST00000342084 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRR-202ENST00000342084 RMI2Q96E14 147 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRR-202ENST00000342084 LYSTQ99698 3801 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRR-202ENST00000342084 TM2D3Q9BRN9 247 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRR-202ENST00000342084 DNAH10Q8IVF4 4471 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRR-202ENST00000342084 TRAV7A0A075B6U4 112 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRR-202ENST00000342084 H3BQ85 93 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRR-202ENST00000342084 Q8N377 158 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRR-202ENST00000342084 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRR-202ENST00000342084 LINC00588Q9Y4M8 146 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRR-202ENST00000342084 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRR-202ENST00000342084 MRAPQ8TCY5 172 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRR-202ENST00000342084 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRR-202ENST00000342084 BAHCC1Q9P281 2608 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRR-202ENST00000342084 DNAH10OSP0CZ25 163 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRR-202ENST00000342084 Q9BRP9 147 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRR-202ENST00000342084 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRR-202ENST00000342084 H7BZZ5 65 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRR-202ENST00000342084 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRR-202ENST00000342084 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRR-202ENST00000342084 ERC2-IT1O76042 136 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRR-202ENST00000342084 IGKV4-1P06312 121 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRR-202ENST00000342084 FAM236CP0DP71 79 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRR-202ENST00000342084 NREPQ16612 68 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRR-202ENST00000342084 Q6ZRX8 168 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRR-202ENST00000342084 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRR-202ENST00000342084 A0A0G2JQZ4 141 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRR-202ENST00000342084 A0A1W2PNN7 141 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRR-202ENST00000342084 F8WEM9 126 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRR-202ENST00000342084 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRR-202ENST00000342084 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRR-202ENST00000342084 DNAH9Q9NYC9 4486 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRR-202ENST00000342084 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRR-202ENST00000342084 A0A1W2PNM2 257 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRR-202ENST00000342084 C4orf26Q17RF5 130 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRR-202ENST00000342084 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa4.66□□□□□ -1.66
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PTPRR-202ENST00000342084 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRR-202ENST00000342084 UBE2BP63146 152 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRR-202ENST00000342084 KLKP1Q107X0 134 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRR-202ENST00000342084 Q5XG85 94 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRR-202ENST00000342084 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 PRYO14603 147 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 C1orf137Q5JT78 98 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 SPRR1AP35321 89 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 COL6A5A8TX70 2615 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 K7EIL1 84 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 HRCT1Q6UXD1 115 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 CSMD3Q7Z407 3707 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 A0A0A0MQY5 61 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.63□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 PRLHP81277 87 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 SMIM29Q86T20 159 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRR-202ENST00000342084 OCR1Q9BZK8 76 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 REG3GQ6UW15 175 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 Q8NBF4 154 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 DNAH7Q8WXX0 4024 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 DEFB116Q30KQ4 102 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 LINC00476Q8WZB0 136 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 SERP1Q9Y6X1 66 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 COL7A1Q02388 2944 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 K7EQZ3 153 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 CHTF8P0CG12 524 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 DSCR10P59022 87 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 C5orf47Q569G3 176 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRR-202ENST00000342084 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
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