RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 Q6ZTI0 123 aa3.34□□□□□ -1.87
CLVS1-201ENST00000325897 OTOGQ6ZRI0 2925 aa3.34□□□□□ -1.87
CLVS1-201ENST00000325897 CRPP02741 224 aa3.34□□□□□ -1.87
CLVS1-201ENST00000325897 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.34□□□□□ -1.87
CLVS1-201ENST00000325897 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 NDUFB1O75438 58 aa3.33□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 PROK1P58294 105 aa3.33□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 LINC00315P59091 139 aa3.33□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 F8P00451 2351 aa3.33□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 ATRQ13535 2644 aa3.33□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 M0QY20 66 aa3.32□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 C1orf134Q5TEV5 83 aa3.32□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 HIVEP1P15822 2718 aa3.32□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 A0A1B0GW54 56 aa3.32□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 A8MTW9 85 aa3.32□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 PDE6GP18545 87 aa3.32□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 SMIM11BQ8TCY0 68 aa3.32□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa3.32□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa3.32□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 ROMO1P60602 79 aa3.32□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 WFDC10AQ9H1F0 79 aa3.32□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 LINC00242Q5T6M2 205 aa3.31□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 LINC00208Q96KT6 92 aa3.31□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 B9D2Q9BPU9 175 aa3.31□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa3.31□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 RTL8CO15255 209 aa3.31□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 C9orf66Q5T8R8 295 aa3.31□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 Q8NAQ8 132 aa3.31□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 IGHV3-53P01767 116 aa3.3□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 SLPIP03973 132 aa3.3□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 PLAC8Q9NZF1 115 aa3.3□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 TRGV2A0A075B6R0 118 aa3.3□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 CDK2AP2O75956 126 aa3.3□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 J3QL48 77 aa3.29□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.29□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 LINC00467Q9BRT7 94 aa3.29□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 IGKV4-1P06312 121 aa3.29□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.29□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 KRTAP10-3P60369 221 aa3.29□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 C16orf74Q96GX8 76 aa3.29□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa3.28□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa3.28□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 IGKV2D-28P01615 120 aa3.28□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 VWFP04275 2813 aa3.28□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 A0A1W2PNM2 257 aa3.28□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 HIGD2BQ4VC39 106 aa3.28□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa3.28□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 Q6ZSN1 163 aa3.28□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 XAGE1AQ9HD64 81 aa3.28□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa3.28□□□□□ -1.88
CLVS1-201ENST00000325897 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa3.28□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 CNBPP62633 177 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 TENM1Q9UKZ4 2725 aa3.27□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa3.27□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa3.27□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 CSAG1Q6PB30 78 aa3.27□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.27□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 M0R2N4 97 aa3.27□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 DEFB130BP0DP73 79 aa3.27□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 DEFB130AP0DP74 79 aa3.27□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 SPINK7P58062 85 aa3.26□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 PRR4Q16378 134 aa3.26□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 FAM104AQ969W3 186 aa3.26□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa3.26□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 MAST4O15021 2626 aa3.26□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 TNP2Q05952 138 aa3.25□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 Q6ZR54 194 aa3.25□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 H3BQ85 93 aa3.25□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa3.25□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 DEFB135Q30KP9 77 aa3.25□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 CHCHD7Q9BUK0 85 aa3.25□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 LINC00612Q8N6U2 182 aa3.24□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa3.24□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 COX7B2Q8TF08 81 aa3.24□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa3.24□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa3.24□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 SMIM29Q86T20 159 aa3.24□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 MUC7Q8TAX7 377 aa3.24□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 STAB1Q9NY15 2570 aa3.24□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa3.23□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 DEFB4AO15263 64 aa3.23□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 Q8NDZ9 215 aa3.23□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa3.23□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.23□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 SPAG11BQ08648 103 aa3.22□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 SPAG11AQ6PDA7 123 aa3.22□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 KCNQ1DNQ9H478 68 aa3.22□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 Q8N9L7 120 aa3.22□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa3.22□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 SMIM1B2RUZ4 78 aa3.21□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 COA5Q86WW8 74 aa3.21□□□□□ -1.89
CLVS1-201ENST00000325897 COL6A5A8TX70 2615 aa3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 134.3 ms