RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323081.12

SPNS1-202, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SPNS1, Length 2,102 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-202ENST00000323081 CYSTM1Q9H1C7 97 aa11.53□□□□□ -0.56
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SPNS1-202ENST00000323081 CASC10Q5T4H9 136 aa11.51□□□□□ -0.57
SPNS1-202ENST00000323081 RPS28P62857 69 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
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SPNS1-202ENST00000323081 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa11.49□□□□□ -0.57
SPNS1-202ENST00000323081 NKAPP1Q8N9T2 125 aa11.49□□□□□ -0.57
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SPNS1-202ENST00000323081 STAB2Q8WWQ8 2551 aa11.48□□□□□ -0.57
SPNS1-202ENST00000323081 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa11.47□□□□□ -0.57
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SPNS1-202ENST00000323081 RMI2Q96E14 147 aa11.47□□□□□ -0.57
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SPNS1-202ENST00000323081 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
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SPNS1-202ENST00000323081 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
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SPNS1-202ENST00000323081 RPL37AP8A6NKH3 93 aa11.39□□□□□ -0.59
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SPNS1-202ENST00000323081 C20orf197Q8N268 126 aa11.38□□□□□ -0.59
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SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa11.35□□□□□ -0.59
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SPNS1-202ENST00000323081 B9D2Q9BPU9 175 aa11.32□□□□□ -0.6
SPNS1-202ENST00000323081 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa11.32□□□□□ -0.6
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SPNS1-202ENST00000323081 Q9BRP9 147 aa11.3□□□□□ -0.6
SPNS1-202ENST00000323081 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa11.29□□□□□ -0.6
SPNS1-202ENST00000323081 FAM236CP0DP71 79 aa11.29□□□□□ -0.6
SPNS1-202ENST00000323081 OXTP01178 125 aa11.28□□□□□ -0.6
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SPNS1-202ENST00000323081 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa11.24□□□□□ -0.61
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SPNS1-202ENST00000323081 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa11.23□□□□□ -0.61
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SPNS1-202ENST00000323081 UBE2BP63146 152 aa11.21□□□□□ -0.61
SPNS1-202ENST00000323081 ERC2-IT1O76042 136 aa11.21□□□□□ -0.62
SPNS1-202ENST00000323081 NREPQ16612 68 aa11.2□□□□□ -0.62
SPNS1-202ENST00000323081 SNURFQ9Y675 71 aa11.2□□□□□ -0.62
SPNS1-202ENST00000323081 SERP1Q9Y6X1 66 aa11.2□□□□□ -0.62
SPNS1-202ENST00000323081 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
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SPNS1-202ENST00000323081 C3orf84H3BNL1 204 aa11.18□□□□□ -0.62
SPNS1-202ENST00000323081 BPY2O14599 106 aa11.18□□□□□ -0.62
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SPNS1-202ENST00000323081 A0A1W2PNN7 141 aa11.18□□□□□ -0.62
SPNS1-202ENST00000323081 IGKV4-1P06312 121 aa11.17□□□□□ -0.62
SPNS1-202ENST00000323081 F8WEM9 126 aa11.16□□□□□ -0.62
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SPNS1-202ENST00000323081 Q5XG85 94 aa11.16□□□□□ -0.62
SPNS1-202ENST00000323081 EPM2AB3EWF7 344 aa11.15□□□□□ -0.62
SPNS1-202ENST00000323081 C14orf177Q52M58 125 aa11.15□□□□□ -0.62
SPNS1-202ENST00000323081 STARD9Q9P2P6 4700 aa11.14□□□□□ -0.63
SPNS1-202ENST00000323081 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.63
SPNS1-202ENST00000323081 C1orf137Q5JT78 98 aa11.14□□□□□ -0.63
SPNS1-202ENST00000323081 A0A1B0GW54 56 aa11.14□□□□□ -0.63
SPNS1-202ENST00000323081 NUPR2A6NF83 97 aa11.14□□□□□ -0.63
SPNS1-202ENST00000323081 Q8N9L7 120 aa11.14□□□□□ -0.63
SPNS1-202ENST00000323081 A0A1W2PNM2 257 aa11.12□□□□□ -0.63
SPNS1-202ENST00000323081 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SPNS1-202ENST00000323081 CHTF8P0CG12 524 aa11.11□□□□□ -0.63
SPNS1-202ENST00000323081 PRLHP81277 87 aa11.11□□□□□ -0.63
SPNS1-202ENST00000323081 C4orf26Q17RF5 130 aa11.11□□□□□ -0.63
SPNS1-202ENST00000323081 TMEM254Q8TBM7 123 aa11.11□□□□□ -0.63
SPNS1-202ENST00000323081 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa11.11□□□□□ -0.63
SPNS1-202ENST00000323081 VPS13DQ5THJ4 4388 aa11.1□□□□□ -0.63
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