RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC00269Q8N2A0 174 aa4.76□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.76□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM126AQ9H061 195 aa4.76□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.76□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAH5Q8TE73 4624 aa4.76□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa4.75□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A096LPF7 62 aa4.75□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAV10A0A0B4J240 114 aa4.75□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa4.75□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 IGKV2D-28P01615 120 aa4.75□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa4.75□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 Q8NAQ8 132 aa4.75□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa4.74□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 H3BNG1 76 aa4.74□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.74□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 CLPSL2Q6UWE3 100 aa4.74□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 FAT1Q14517 4588 aa4.73□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa4.73□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 F8WDY8 70 aa4.73□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 HTN3P15516 51 aa4.73□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 SPAG11BQ08648 103 aa4.73□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 KIAA0087Q14695 138 aa4.73□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.73□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 CELA1Q9UNI1 258 aa4.73□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.72□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 LECT2O14960 151 aa4.72□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.72□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 Q9HAA7 133 aa4.72□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa4.71□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A087WYN8 130 aa4.71□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 Q5VSD8 79 aa4.71□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC00167Q96N53 147 aa4.71□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 PRR34Q9NV39 138 aa4.71□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 LYPD5Q6UWN5 251 aa4.7□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 SDIM1Q6ZPB5 146 aa4.7□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa4.7□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 KLK12Q9UKR0 248 aa4.7□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.69□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa4.69□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 Q8N814 137 aa4.69□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 CCKP06307 115 aa4.68□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 PDE6GP18545 87 aa4.68□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa4.68□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 Q6JHZ5 121 aa4.68□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 C6orf223Q8N319 242 aa4.68□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 C2orf48Q96LS8 159 aa4.68□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa4.68□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa4.67□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 hADV29S1A0JD25 119 aa4.67□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 NCR3O14931 201 aa4.67□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 SLPIP03973 132 aa4.67□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.67□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.67□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC00575Q6W349 94 aa4.67□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.67□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 C22orf24Q9Y442 160 aa4.67□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa4.66□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa4.66□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 ATOX1O00244 68 aa4.66□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 C6orf99Q4VX62 202 aa4.66□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 ENHOQ6UWT2 76 aa4.66□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 DIRC1Q969H9 104 aa4.66□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.66□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 C1orf43Q9BWL3 253 aa4.66□□□□□ -1.66
SMARCE1-201ENST00000264640 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa4.65□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 M0R378 163 aa4.65□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 IGLV6-57P01721 117 aa4.65□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 RBM3P98179 157 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 RMI2Q96E14 147 aa4.65□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 UBL5Q9BZL1 73 aa4.65□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.65□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.64□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 COX7BP24311 80 aa4.64□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC01556Q5JQF7 62 aa4.64□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 C10orf25Q5T742 122 aa4.64□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 SMCR5Q8TEV8 140 aa4.64□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.64□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.63□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 B5MCH6 92 aa4.63□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.63□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 UQCRQO14949 82 aa4.63□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 HAMPP81172 84 aa4.63□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 C3orf22Q8N5N4 141 aa4.63□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 DSCR8Q96T75 97 aa4.63□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa4.62□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC179H3BU77 68 aa4.62□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 WFDC10BQ8IUB3 73 aa4.62□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF213Q63HN8 5207 aa4.62□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa4.61□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.61□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.61□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC00846Q9NV44 126 aa4.61□□□□□ -1.67
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