RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 DNAH9Q9NYC9 4486 aa5.67□□□□□ -1.5
GINS1-201ENST00000262460 C20orf197Q8N268 126 aa5.67□□□□□ -1.5
GINS1-201ENST00000262460 SNURFQ9Y675 71 aa5.67□□□□□ -1.5
GINS1-201ENST00000262460 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
GINS1-201ENST00000262460 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
GINS1-201ENST00000262460 MUC7Q8TAX7 377 aa5.67□□□□□ -1.5
GINS1-201ENST00000262460 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.66□□□□□ -1.5
GINS1-201ENST00000262460 ATOX1O00244 68 aa5.66□□□□□ -1.5
GINS1-201ENST00000262460 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
GINS1-201ENST00000262460 SYCNQ0VAF6 134 aa5.66□□□□□ -1.5
GINS1-201ENST00000262460 LINC00588Q9Y4M8 146 aa5.66□□□□□ -1.5
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GINS1-201ENST00000262460 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.64□□□□□ -1.51
GINS1-201ENST00000262460 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
GINS1-201ENST00000262460 SERP2Q8N6R1 65 aa5.64□□□□□ -1.51
GINS1-201ENST00000262460 ERC2-IT1O76042 136 aa5.63□□□□□ -1.51
GINS1-201ENST00000262460 OXTP01178 125 aa5.63□□□□□ -1.51
GINS1-201ENST00000262460 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa5.63□□□□□ -1.51
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GINS1-201ENST00000262460 M0R378 163 aa5.63□□□□□ -1.51
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GINS1-201ENST00000262460 LINC00528Q8N1L1 170 aa5.63□□□□□ -1.51
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GINS1-201ENST00000262460 DNAH3Q8TD57 4116 aa5.62□□□□□ -1.51
GINS1-201ENST00000262460 TM2D3Q9BRN9 247 aa5.62□□□□□ -1.51
GINS1-201ENST00000262460 RMI2Q96E14 147 aa5.61□□□□□ -1.51
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.61□□□□□ -1.51
GINS1-201ENST00000262460 LINC01556Q5JQF7 62 aa5.61□□□□□ -1.51
GINS1-201ENST00000262460 Q9BRP9 147 aa5.61□□□□□ -1.51
GINS1-201ENST00000262460 CRYGAP11844 174 aa5.6□□□□□ -1.51
GINS1-201ENST00000262460 Q8N377 158 aa5.6□□□□□ -1.51
GINS1-201ENST00000262460 DNHD1Q96M86 4753 aa5.6□□□□□ -1.51
GINS1-201ENST00000262460 WIPF1O43516 503 aa5.6□□□□□ -1.51
GINS1-201ENST00000262460 K7EIL1 84 aa5.59□□□□□ -1.51
GINS1-201ENST00000262460 CHTF8P0CG12 524 aa5.59□□□□□ -1.51
GINS1-201ENST00000262460 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.59□□□□□ -1.51
GINS1-201ENST00000262460 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.59□□□□□ -1.51
GINS1-201ENST00000262460 PRLHP81277 87 aa5.59□□□□□ -1.52
GINS1-201ENST00000262460 DNAH1Q9P2D7 4330 aa5.58□□□□□ -1.52
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GINS1-201ENST00000262460 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
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GINS1-201ENST00000262460 DPH3Q96FX2 82 aa5.56□□□□□ -1.52
GINS1-201ENST00000262460 DNAH10OSP0CZ25 163 aa5.55□□□□□ -1.52
GINS1-201ENST00000262460 NREPQ16612 68 aa5.55□□□□□ -1.52
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.55□□□□□ -1.52
GINS1-201ENST00000262460 HIGD2AQ9BW72 106 aa5.55□□□□□ -1.52
GINS1-201ENST00000262460 H3BNG1 76 aa5.54□□□□□ -1.52
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GINS1-201ENST00000262460 C4orf26Q17RF5 130 aa5.54□□□□□ -1.52
GINS1-201ENST00000262460 KCNQ1DNQ9H478 68 aa5.54□□□□□ -1.52
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GINS1-201ENST00000262460 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa5.53□□□□□ -1.52
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GINS1-201ENST00000262460 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
GINS1-201ENST00000262460 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.52□□□□□ -1.53
GINS1-201ENST00000262460 FRAS1Q86XX4 4008 aa5.52□□□□□ -1.53
GINS1-201ENST00000262460 J3KT08 172 aa5.52□□□□□ -1.53
GINS1-201ENST00000262460 C1orf137Q5JT78 98 aa5.52□□□□□ -1.53
GINS1-201ENST00000262460 KMT2AQ03164 3969 aa5.52□□□□□ -1.53
GINS1-201ENST00000262460 IGKV4-1P06312 121 aa5.52□□□□□ -1.53
GINS1-201ENST00000262460 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
GINS1-201ENST00000262460 STARD9Q9P2P6 4700 aa5.51□□□□□ -1.53
GINS1-201ENST00000262460 H7BZZ5 65 aa5.51□□□□□ -1.53
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GINS1-201ENST00000262460 PANO1I0J062 215 aa5.5□□□□□ -1.53
GINS1-201ENST00000262460 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.5□□□□□ -1.53
GINS1-201ENST00000262460 SMIM29Q86T20 159 aa5.5□□□□□ -1.53
GINS1-201ENST00000262460 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
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GINS1-201ENST00000262460 MDFIQ99750 246 aa5.5□□□□□ -1.53
GINS1-201ENST00000262460 LRCOL1A6NCL2 159 aa5.49□□□□□ -1.53
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GINS1-201ENST00000262460 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.49□□□□□ -1.53
GINS1-201ENST00000262460 TMEM258P61165 79 aa5.49□□□□□ -1.53
GINS1-201ENST00000262460 CXCL6P80162 114 aa5.48□□□□□ -1.53
GINS1-201ENST00000262460 K7EQZ3 153 aa5.48□□□□□ -1.53
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GINS1-201ENST00000262460 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.48□□□□□ -1.53
GINS1-201ENST00000262460 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.47□□□□□ -1.53
GINS1-201ENST00000262460 FAM236CP0DP71 79 aa5.47□□□□□ -1.53
GINS1-201ENST00000262460 LINC00476Q8WZB0 136 aa5.47□□□□□ -1.53
GINS1-201ENST00000262460 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.46□□□□□ -1.53
GINS1-201ENST00000262460 FBN3Q75N90 2809 aa5.46□□□□□ -1.54
GINS1-201ENST00000262460 A0A087WSZ3 146 aa5.45□□□□□ -1.54
GINS1-201ENST00000262460 SEC61GP60059 68 aa5.45□□□□□ -1.54
GINS1-201ENST00000262460 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.45□□□□□ -1.54
GINS1-201ENST00000262460 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.45□□□□□ -1.54
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