RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637665.1

LINC01876-208, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1876, human

TSL 3

Gene LINC01876, Length 565 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC01876-208	ENST00000637665	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		5	□□□□□ -1.61
LINC01876-208	ENST00000637665		A0A0J9YXY3	114 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01876-208	ENST00000637665	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01876-208	ENST00000637665	TIMM17B	O60830	172 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01876-208	ENST00000637665	DDT	P30046	118 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01876-208	ENST00000637665	HAMP	P81172	84 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01876-208	ENST00000637665	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LINC01876-208	ENST00000637665	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01876-208	ENST00000637665	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01876-208	ENST00000637665	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01876-208	ENST00000637665	PKD1	P98161	4303 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01876-208	ENST00000637665	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01876-208	ENST00000637665	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01876-208	ENST00000637665	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01876-208	ENST00000637665	LECT2	O14960	151 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01876-208	ENST00000637665	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LINC01876-208	ENST00000637665	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LINC01876-208	ENST00000637665	XG	P55808	180 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01876-208	ENST00000637665	COX17	Q14061	63 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01876-208	ENST00000637665	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01876-208	ENST00000637665		Q6ZVH6	145 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01876-208	ENST00000637665	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01876-208	ENST00000637665		Q8N814	137 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01876-208	ENST00000637665	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01876-208	ENST00000637665	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01876-208	ENST00000637665	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LINC01876-208	ENST00000637665	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	WFDC2	Q14508	124 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	TAL2	Q16559	108 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	C2orf82	Q6UX34	121 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	HSD52	Q0P140	79 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665		Q5VSD8	79 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	LITAF	Q99732	161 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	IFITM1	P13164	125 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665		M0R143	59 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	LINC00158	P58513	81 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	CTAG1A	P78358	180 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665		Q6ZRU5	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	RYR1	P21817	5038 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	PFN2	P35080	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	CEND1	Q8N111	149 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01876-208	ENST00000637665		A0A0U1RRA0	63 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01876-208	ENST00000637665	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINC01876-208	ENST00000637665	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01876-208	ENST00000637665	DAND5	Q8N907	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01876-208	ENST00000637665	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01876-208	ENST00000637665	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01876-208	ENST00000637665	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01876-208	ENST00000637665	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01876-208	ENST00000637665	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01876-208	ENST00000637665	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01876-208	ENST00000637665		A6NDN8	102 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01876-208	ENST00000637665	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINC01876-208	ENST00000637665	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01876-208	ENST00000637665		Q6ZRP5	223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01876-208	ENST00000637665		A0A1B0GWB2	263 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01876-208	ENST00000637665	NDUFC2	O95298	119 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01876-208	ENST00000637665	FXYD2	P54710	66 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01876-208	ENST00000637665	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01876-208	ENST00000637665	HSPG2	P98160	4391 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01876-208	ENST00000637665		A4D1N5	150 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01876-208	ENST00000637665	NPC2	P61916	151 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01876-208	ENST00000637665	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC01876-208	ENST00000637665	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC01876-208	ENST00000637665	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01876-208	ENST00000637665	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms