RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612516.4

CCL23-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 23, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL23, Length 569 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23-201ENST00000612516 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa3.67□□□□□ -1.82
CCL23-201ENST00000612516 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa3.66□□□□□ -1.82
CCL23-201ENST00000612516 CRYGAP11844 174 aa3.66□□□□□ -1.82
CCL23-201ENST00000612516 PLNP26678 52 aa3.66□□□□□ -1.82
CCL23-201ENST00000612516 S100A12P80511 92 aa3.66□□□□□ -1.82
CCL23-201ENST00000612516 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa3.66□□□□□ -1.82
CCL23-201ENST00000612516 NDUFA12Q9UI09 145 aa3.66□□□□□ -1.82
CCL23-201ENST00000612516 COLCA2A8K830 154 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 SCO1O75880 301 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 DPM2O94777 84 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 SMIM13P0DJ93 91 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 VPREB1P12018 145 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 BOD1L2Q8IYS8 172 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 PLEKHB2Q96CS7 222 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 M0R378 163 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 LEPROTO15243 131 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 IGKCP01834 107 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 MIEN1Q9BRT3 115 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 TMEM126AQ9H061 195 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 TMEM238C9JI98 176 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 J3QQQ9 107 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 TSPAN13O95857 204 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 NMUP48645 174 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 PRLHP81277 87 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 PRR4Q16378 134 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 PMCHL2Q9BQD1 86 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 HIGD2AQ9BW72 106 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 NCR3O14931 201 aa3.62□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.62□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa3.61□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 PRYO14603 147 aa3.61□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 LINC00310P59036 64 aa3.61□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 FAM229BQ4G0N7 80 aa3.61□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 S100A7L2Q5SY68 101 aa3.61□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 A0A087X002 238 aa3.6□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 HIST1H2BKO60814 126 aa3.6□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 HIST1H2BJP06899 126 aa3.6□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 HIST1H2BOP23527 126 aa3.6□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 HIST1H2BBP33778 126 aa3.6□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 HIST1H2BDP58876 126 aa3.6□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 HIST1H2BCP62807 126 aa3.6□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 HIST2H2BEQ16778 126 aa3.6□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.6□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 DAND5Q8N907 189 aa3.6□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 Q8NDZ9 215 aa3.6□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 HIST1H2BHQ93079 126 aa3.6□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 HIST1H2BNQ99877 126 aa3.6□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 HIST1H2BMQ99879 126 aa3.6□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa3.59□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 E9PLD3 99 aa3.59□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa3.59□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 DDTP30046 118 aa3.59□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 TSPEAR-AS2P59090 65 aa3.59□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 C4orf48Q5BLP8 95 aa3.59□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 PET117Q6UWS5 81 aa3.59□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 KCNQ1DNQ9H478 68 aa3.59□□□□□ -1.83
CCL23-201ENST00000612516 TNXBP22105 4242 aa3.59□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 A0A0J9YXY3 114 aa3.58□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa3.58□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 C20orf202A1L168 122 aa3.58□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 KRTDAPP60985 99 aa3.58□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 NPC2P61916 151 aa3.58□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 LINC00337Q8N6G1 96 aa3.58□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.58□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 SMCR5Q8TEV8 140 aa3.58□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 CBY1Q9Y3M2 126 aa3.58□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.58□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa3.57□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 NDUFC2O95298 119 aa3.57□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.57□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 LINC01545Q5VT33 79 aa3.57□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 ARL17AQ8IVW1 177 aa3.57□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 OR13C6PQ8NH95 151 aa3.57□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 SPRR4Q96PI1 79 aa3.57□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 ZNF815PA8K554 130 aa3.56□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 C3orf79P0CE67 100 aa3.56□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 SPRR1AP35321 89 aa3.56□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 SPAG11AQ6PDA7 123 aa3.56□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 SCGB1D4Q6XE38 83 aa3.56□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 PPDPFQ9H3Y8 114 aa3.56□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa3.55□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 B5MCH6 92 aa3.55□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 TIMM17BO60830 172 aa3.55□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 AKR1D1P51857 326 aa3.55□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 CTAG1AP78358 180 aa3.55□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.55□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 GAGE2AQ6NT46 116 aa3.55□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 C3orf22Q8N5N4 141 aa3.55□□□□□ -1.84
CCL23-201ENST00000612516 COPS9Q8WXC6 57 aa3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms