RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608473.5

GTF3C2-AS1-211, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTF3C2-AS1, Length 554 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NDUFA6P56556 154 aa5.06□□□□□ -1.6
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PMVKQ15126 192 aa5.06□□□□□ -1.6
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FA2HQ7L5A8 372 aa5.06□□□□□ -1.6
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.06□□□□□ -1.6
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.06□□□□□ -1.6
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CST9LQ9H4G1 147 aa5.06□□□□□ -1.6
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ADCYAP1P18509 176 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PRYO14603 147 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 COX19Q49B96 90 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.03□□□□□ -1.6
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CTAG1AP78358 180 aa5.03□□□□□ -1.6
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PRLHP81277 87 aa5.03□□□□□ -1.6
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GNB1LQ9BYB4 327 aa5.03□□□□□ -1.6
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ATP6V1G1O75348 118 aa5.02□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SCO1O75880 301 aa5.02□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FABP9Q0Z7S8 132 aa5.02□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 COX17Q14061 63 aa5.02□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.02□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SFTA2Q6UW10 78 aa5.02□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.02□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CBLN2Q8IUK8 224 aa5.02□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TMEM126AQ9H061 195 aa5.02□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.02□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ERG28Q9UKR5 140 aa5.02□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.01□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HIGD2AQ9BW72 106 aa5.01□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LINC01546A6NGU7 62 aa5□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TMEM238C9JI98 176 aa5□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IGLC3P0DOY3 106 aa5□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 VPREB1P12018 145 aa5□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LINC00158P58513 81 aa5□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TPRXLQ17RH7 258 aa5□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 UQCC3Q6UW78 93 aa5□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LINC00337Q8N6G1 96 aa5□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TMEM218A2RU14 115 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PCP4P48539 62 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CLLU1Q5K131 121 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PLEKHB2Q96CS7 222 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SEC11CQ9BY50 192 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PPDPFQ9H3Y8 114 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MUC2Q02817 5179 aa4.98□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 M0R378 163 aa4.98□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HBDP02042 147 aa4.98□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 S100A12P80511 92 aa4.98□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 BAGE3Q86Y29 109 aa4.98□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LINC00614P0C842 121 aa4.97□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 A0A0U1RRA0 63 aa4.96□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 C3orf22Q8N5N4 141 aa4.96□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RPS10P5Q9NQ39 176 aa4.96□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa4.96□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.95□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 C11orf86A6NJI1 115 aa4.95□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MEIG1Q5JSS6 88 aa4.95□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SPRR4Q96PI1 79 aa4.95□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.95□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LINC00587B1AMM8 73 aa4.94□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RHEBQ15382 184 aa4.94□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PMCHL1Q16048 86 aa4.94□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 BOD1L2Q8IYS8 172 aa4.94□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 Q8NBF4 154 aa4.93□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 C18orf32Q8TCD1 76 aa4.93□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa4.93□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 A0A096LNJ9 63 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NCR3O14931 201 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SPINK1P00995 79 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SMIM13P0DJ93 91 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HERV-K104P63124 156 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 COMMD7Q86VX2 200 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DAND5Q8N907 189 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SMCR5Q8TEV8 140 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FAM19A2Q8N3H0 131 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 Q8NDZ9 215 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa4.9□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TMEM223A0PJW6 202 aa4.9□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.9□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IFI27L1Q96BM0 104 aa4.9□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.9□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.9□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.89□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa4.89□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NDUFA5Q16718 116 aa4.89□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.88□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MOBPQ13875 183 aa4.88□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 181.8 ms