RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603487.1

SMC2-AS1-201, Transcript of SMC2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMC2-AS1, Length 7,020 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2-AS1-201ENST00000603487 J3QKU1 62 aa3.48□□□□□ -1.85
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
SMC2-AS1-201ENST00000603487 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.48□□□□□ -1.85
SMC2-AS1-201ENST00000603487 LINC00476Q8WZB0 136 aa3.48□□□□□ -1.85
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PCNX3Q9H6A9 2034 aa3.48□□□□□ -1.85
SMC2-AS1-201ENST00000603487 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa3.48□□□□□ -1.85
SMC2-AS1-201ENST00000603487 KLKP1Q107X0 134 aa3.48□□□□□ -1.85
SMC2-AS1-201ENST00000603487 FAM208BQ5VWN6 2430 aa3.48□□□□□ -1.85
SMC2-AS1-201ENST00000603487 LRP4O75096 1905 aa3.47□□□□□ -1.85
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa3.47□□□□□ -1.85
SMC2-AS1-201ENST00000603487 LINC00574Q9H8X3 128 aa3.47□□□□□ -1.85
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SPRNQ5BIV9 151 aa3.47□□□□□ -1.85
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PLXNB1O43157 2135 aa3.47□□□□□ -1.85
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ATRXP46100 2492 aa3.47□□□□□ -1.85
SMC2-AS1-201ENST00000603487 MYO9AB2RTY4 2548 aa3.47□□□□□ -1.85
SMC2-AS1-201ENST00000603487 H7BZZ5 65 aa3.47□□□□□ -1.85
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TANC2Q9HCD6 1990 aa3.47□□□□□ -1.85
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CEP350Q5VT06 3117 aa3.46□□□□□ -1.85
SMC2-AS1-201ENST00000603487 NOTCH3Q9UM47 2321 aa3.46□□□□□ -1.85
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ZNF580Q9UK33 172 aa3.46□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 GAS8-AS1O95177 125 aa3.46□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 WNK1Q9H4A3 2382 aa3.46□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CEP295Q9C0D2 2601 aa3.46□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 K7EQG2 157 aa3.46□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 NUP210LQ5VU65 1888 aa3.46□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 C9orf163Q8N9P6 203 aa3.46□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ROMO1P60602 79 aa3.45□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa3.45□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 DNAH12Q6ZR08 3092 aa3.45□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 NDUFAF8A1L188 74 aa3.45□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CRIP3Q6Q6R5 217 aa3.45□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa3.45□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa3.45□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa3.45□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PRR14LQ5THK1 2151 aa3.45□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 MED12LQ86YW9 2145 aa3.45□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 Q75L30 129 aa3.44□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 NAV3Q8IVL0 2385 aa3.44□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa3.44□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa3.44□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 DEFB114Q30KQ6 69 aa3.44□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 AGRNO00468 2067 aa3.44□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CSPG4Q6UVK1 2322 aa3.44□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 C9orf92A6NGG3 77 aa3.44□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 A0A1B0GU33 70 aa3.43□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 FAM218AQ96MZ4 157 aa3.43□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CHCHD7Q9BUK0 85 aa3.43□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 C16orf90A8MZG2 172 aa3.43□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 C18orf65Q6ZTR6 163 aa3.43□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 LINC00528Q8N1L1 170 aa3.43□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PRO0461Q9UI25 63 aa3.43□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 COL4A2P08572 1712 aa3.43□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa3.43□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 HIVEP2P31629 2446 aa3.42□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.42□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 NCOR2Q9Y618 2525 aa3.42□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 DSCR10P59022 87 aa3.42□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 Q8NAQ8 132 aa3.42□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 EXPH5Q8NEV8 1989 aa3.42□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.42□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 LINC00167Q96N53 147 aa3.42□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa3.42□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 OCR1Q9BZK8 76 aa3.42□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 NAV2Q8IVL1 2488 aa3.42□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 IGF2RP11717 2491 aa3.41□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 FAM229BQ4G0N7 80 aa3.41□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 Q6ZRX8 168 aa3.41□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PTPN13Q12923 2485 aa3.41□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa3.41□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 NOTCH2Q04721 2471 aa3.41□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ODF3BA8MYP8 253 aa3.41□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 EML5Q05BV3 1969 aa3.41□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 Q8N1X5 172 aa3.41□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa3.41□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa3.4□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.4□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 MYO18BQ8IUG5 2567 aa3.4□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 LINC00310P59036 64 aa3.4□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 C11orf21Q9P2W6 132 aa3.4□□□□□ -1.86
SMC2-AS1-201ENST00000603487 Q8N7P7 452 aa3.4□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PRR26Q8N8Z3 221 aa3.39□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ZFHX3Q15911 3703 aa3.39□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa3.39□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 IGLV1-47P01700 117 aa3.38□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 RTL8CO15255 209 aa3.38□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 Q6ZPA2 131 aa3.38□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 DNAH10OSP0CZ25 163 aa3.38□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 LINC00315P59091 139 aa3.38□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa3.38□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 KLLNB2CW77 178 aa3.38□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 IGLV1-51P01701 117 aa3.38□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.2 ms