RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601247.5

FCHO1-235, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 458 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-235ENST00000601247 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
FCHO1-235ENST00000601247 NKAPP1Q8N9T2 125 aa9.77□□□□□ -0.85
FCHO1-235ENST00000601247 DDTP30046 118 aa9.76□□□□□ -0.85
FCHO1-235ENST00000601247 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
FCHO1-235ENST00000601247 CTAG1AP78358 180 aa9.75□□□□□ -0.85
FCHO1-235ENST00000601247 CEND1Q8N111 149 aa9.75□□□□□ -0.85
FCHO1-235ENST00000601247 SPACA4Q8TDM5 124 aa9.75□□□□□ -0.85
FCHO1-235ENST00000601247 PPDPFQ9H3Y8 114 aa9.75□□□□□ -0.85
FCHO1-235ENST00000601247 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa9.74□□□□□ -0.85
FCHO1-235ENST00000601247 M0R143 59 aa9.74□□□□□ -0.85
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP10-1P60331 282 aa9.74□□□□□ -0.85
FCHO1-235ENST00000601247 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9.74□□□□□ -0.85
FCHO1-235ENST00000601247 ARL17AQ8IVW1 177 aa9.74□□□□□ -0.85
FCHO1-235ENST00000601247 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa9.74□□□□□ -0.85
FCHO1-235ENST00000601247 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
FCHO1-235ENST00000601247 PCP4L1A6NKN8 68 aa9.73□□□□□ -0.85
FCHO1-235ENST00000601247 NDUFC2O95298 119 aa9.73□□□□□ -0.85
FCHO1-235ENST00000601247 NCR3O14931 201 aa9.72□□□□□ -0.85
FCHO1-235ENST00000601247 FAM168BA1KXE4 195 aa9.71□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 A4D1N5 150 aa9.71□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 A0A087WYN8 130 aa9.7□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 PANO1I0J062 215 aa9.7□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 M0QXV9 152 aa9.7□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 M0R378 163 aa9.7□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 VPREB1P12018 145 aa9.7□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 S100A7L2Q5SY68 101 aa9.7□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa9.7□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 OR13C6PQ8NH95 151 aa9.7□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 RAB37Q96AX2 223 aa9.7□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa9.69□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.69□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 A0A1W2PNN7 141 aa9.69□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 C22orf24Q9Y442 160 aa9.69□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 RYR3Q15413 4870 aa9.68□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa9.67□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 A6NDN8 102 aa9.67□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 FXYD2P54710 66 aa9.67□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 UBE2BP63146 152 aa9.67□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 PRR3P79522 188 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 BATFQ16520 125 aa9.67□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 Q6ZSA8 131 aa9.67□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 PLAC8Q9NZF1 115 aa9.67□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 FAM30AQ9NZY2 134 aa9.67□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 CBY1Q9Y3M2 126 aa9.67□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 FAT2Q9NYQ8 4349 aa9.67□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 GAGE10A6NGK3 116 aa9.66□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa9.66□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 SCXQ7RTU7 201 aa9.65□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 Q8NDZ9 215 aa9.65□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 C7orf33Q8WU49 177 aa9.65□□□□□ -0.86
FCHO1-235ENST00000601247 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa9.65□□□□□ -0.87
FCHO1-235ENST00000601247 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
FCHO1-235ENST00000601247 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.64□□□□□ -0.87
FCHO1-235ENST00000601247 TMEM126AQ9H061 195 aa9.64□□□□□ -0.87
FCHO1-235ENST00000601247 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.63□□□□□ -0.87
FCHO1-235ENST00000601247 A0A0B4J2C4 111 aa9.63□□□□□ -0.87
FCHO1-235ENST00000601247 IGKV2D-28P01615 120 aa9.63□□□□□ -0.87
FCHO1-235ENST00000601247 LINC00167Q96N53 147 aa9.63□□□□□ -0.87
FCHO1-235ENST00000601247 PKD1P98161 4303 aa9.63□□□□□ -0.87
FCHO1-235ENST00000601247 CFC1BP0CG36 223 aa9.62□□□□□ -0.87
FCHO1-235ENST00000601247 CFC1P0CG37 223 aa9.62□□□□□ -0.87
FCHO1-235ENST00000601247 DNAH11Q96DT5 4516 aa9.62□□□□□ -0.87
FCHO1-235ENST00000601247 RPL37AP8A6NKH3 93 aa9.61□□□□□ -0.87
FCHO1-235ENST00000601247 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
FCHO1-235ENST00000601247 HAMPP81172 84 aa9.61□□□□□ -0.87
FCHO1-235ENST00000601247 Q1RN00 199 aa9.61□□□□□ -0.87
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa9.61□□□□□ -0.87
FCHO1-235ENST00000601247 LINC00337Q8N6G1 96 aa9.61□□□□□ -0.87
FCHO1-235ENST00000601247 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa9.6□□□□□ -0.87
FCHO1-235ENST00000601247 H7C2G1 150 aa9.6□□□□□ -0.87
FCHO1-235ENST00000601247 PRO1854Q9UHT4 67 aa9.6□□□□□ -0.87
FCHO1-235ENST00000601247 EPM2AB3EWF7 344 aa9.59□□□□□ -0.87
FCHO1-235ENST00000601247 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa9.58□□□□□ -0.88
FCHO1-235ENST00000601247 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa9.58□□□□□ -0.88
FCHO1-235ENST00000601247 K7ERJ3 54 aa9.58□□□□□ -0.88
FCHO1-235ENST00000601247 PRYO14603 147 aa9.58□□□□□ -0.88
FCHO1-235ENST00000601247 IGLV6-57P01721 117 aa9.58□□□□□ -0.88
FCHO1-235ENST00000601247 A0A1B0GWB2 263 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-235ENST00000601247 CDK2AP2O75956 126 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-235ENST00000601247 REG3GQ6UW15 175 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-235ENST00000601247 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa9.54□□□□□ -0.88
FCHO1-235ENST00000601247 PSMB2P49721 201 aa9.54□□□□□ -0.88
FCHO1-235ENST00000601247 XGP55808 180 aa9.54□□□□□ -0.88
FCHO1-235ENST00000601247 DIRC1Q969H9 104 aa9.54□□□□□ -0.88
FCHO1-235ENST00000601247 KCNQ1DNQ9H478 68 aa9.54□□□□□ -0.88
FCHO1-235ENST00000601247 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
FCHO1-235ENST00000601247 VAMP3Q15836 100 aa9.53□□□□□ -0.88
FCHO1-235ENST00000601247 SMIM11BQ8TCY0 68 aa9.53□□□□□ -0.88
FCHO1-235ENST00000601247 SNHG12Q9BXW3 62 aa9.53□□□□□ -0.88
FCHO1-235ENST00000601247 DNAH5Q8TE73 4624 aa9.52□□□□□ -0.89
FCHO1-235ENST00000601247 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa9.52□□□□□ -0.89
FCHO1-235ENST00000601247 C1orf137Q5JT78 98 aa9.51□□□□□ -0.89
FCHO1-235ENST00000601247 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-235ENST00000601247 COX6CP09669 75 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-235ENST00000601247 RPL28P46779 137 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms