RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 Q8IZM0 81 aa5.08□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 C15orf56Q8N910 161 aa5.08□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 CARD19Q96LW7 228 aa5.08□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.08□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.08□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.07□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 MT1HL1P0DM35 61 aa5.07□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 COX6A2Q02221 97 aa5.07□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 SYCNQ0VAF6 134 aa5.07□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.07□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.07□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa5.06□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.06□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 WFDC2Q14508 124 aa5.06□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 RNF151Q2KHN1 245 aa5.06□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 COX7B2Q8TF08 81 aa5.06□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.06□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM223A0PJW6 202 aa5.05□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF815PA8K554 130 aa5.05□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 VAMP3Q15836 100 aa5.05□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 C9orf163Q8N9P6 203 aa5.05□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa5.04□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.04□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 A6NJY4 79 aa5.04□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 LEPROTO15243 131 aa5.04□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 SPINK8P0C7L1 97 aa5.04□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa5.04□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 LINC00528Q8N1L1 170 aa5.04□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.03□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 J3QQQ9 107 aa5.03□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 HERV-K104P63124 156 aa5.03□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.03□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 CEND1Q8N111 149 aa5.03□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.03□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.03□□□□□ -1.6
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM238C9JI98 176 aa5.02□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 K7ERU9 68 aa5.02□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 TAX1BP3O14907 124 aa5.02□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 Q6ZRU5 148 aa5.02□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 DPH3Q96FX2 82 aa5.02□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 HIST1H4GQ99525 98 aa5.02□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.01□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.01□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.01□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 COX17Q14061 63 aa5.01□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 KIAA0087Q14695 138 aa5.01□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 A0A1B0GWB2 263 aa5□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 C9orf118A6NHY6 69 aa5□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 PCP4P48539 62 aa5□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 FXYD2P54710 66 aa5□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 LINC00526Q96FQ7 95 aa5□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 GAGE10A6NGK3 116 aa4.99□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 TIMM17BO60830 172 aa4.99□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 SLPIP03973 132 aa4.99□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 SMIM13P0DJ93 91 aa4.99□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 GAGE2BQ13066 116 aa4.99□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 MEIG1Q5JSS6 88 aa4.99□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 C2orf82Q6UX34 121 aa4.99□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 SDIM1Q6ZPB5 146 aa4.99□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 Q6ZSA8 131 aa4.99□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 Q6ZVH6 145 aa4.99□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.99□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.99□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.98□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP4.98□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 COPS9Q8WXC6 57 aa4.98□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 ERG28Q9UKR5 140 aa4.98□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 A0A0J9YXY3 114 aa4.97□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 A0A1W2PPM0 123 aa4.97□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 RPL24P83731 157 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 OCIAD2Q56VL3 154 aa4.97□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 C10orf25Q5T742 122 aa4.97□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 LCE3BQ5TA77 95 aa4.97□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 SPACA4Q8TDM5 124 aa4.97□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 SPANXDQ9BXN6 97 aa4.97□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 PPDPFQ9H3Y8 114 aa4.97□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 SPANXCQ9NY87 97 aa4.97□□□□□ -1.61
ZNF548-208ENST00000597576 K7EP34 96 aa4.96□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 FABP2P12104 132 aa4.96□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 PFN2P35080 140 aa4.96□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 LINC00158P58513 81 aa4.96□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 LINC01620Q4KN68 170 aa4.96□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 GAGE2EQ4V326 116 aa4.96□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 LYRM7Q5U5X0 104 aa4.96□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 C7orf33Q8WU49 177 aa4.96□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 VPS25Q9BRG1 176 aa4.96□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.96□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.96□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 A0A096LNI7 61 aa4.95□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 A0A0B4J2C4 111 aa4.95□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 H3BUT2 72 aa4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms