RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 TIMM17BO60830 172 aa15.03■□□□□ -0
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CAPNS1-214ENST00000592483 CHTF8P0CG12 524 aa14.92□□□□□ -0.02
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CAPNS1-214ENST00000592483 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa14.9□□□□□ -0.02
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CAPNS1-214ENST00000592483 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CAPNS1-214ENST00000592483 PANO1I0J062 215 aa14.88□□□□□ -0.03
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CAPNS1-214ENST00000592483 C12orf57Q99622 126 aa14.87□□□□□ -0.03
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CAPNS1-214ENST00000592483 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa14.82□□□□□ -0.04
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CAPNS1-214ENST00000592483 FAM168BA1KXE4 195 aa14.79□□□□□ -0.04
CAPNS1-214ENST00000592483 VPREB1P12018 145 aa14.79□□□□□ -0.04
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CAPNS1-214ENST00000592483 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa14.78□□□□□ -0.04
CAPNS1-214ENST00000592483 NKAPP1Q8N9T2 125 aa14.78□□□□□ -0.04
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CAPNS1-214ENST00000592483 TAL2Q16559 108 aa14.77□□□□□ -0.05
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CAPNS1-214ENST00000592483 HIST1H4GQ99525 98 aa14.77□□□□□ -0.05
CAPNS1-214ENST00000592483 TSTD3H0UI37 97 aa14.76□□□□□ -0.05
CAPNS1-214ENST00000592483 M0QXV9 152 aa14.76□□□□□ -0.05
CAPNS1-214ENST00000592483 NPC2P61916 151 aa14.76□□□□□ -0.05
CAPNS1-214ENST00000592483 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa14.75□□□□□ -0.05
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CAPNS1-214ENST00000592483 C22orf24Q9Y442 160 aa14.75□□□□□ -0.05
CAPNS1-214ENST00000592483 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa14.74□□□□□ -0.05
CAPNS1-214ENST00000592483 PRO1933Q9H354 126 aa14.74□□□□□ -0.05
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CAPNS1-214ENST00000592483 M0R378 163 aa14.72□□□□□ -0.05
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CAPNS1-214ENST00000592483 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
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CAPNS1-214ENST00000592483 CEND1Q8N111 149 aa14.65□□□□□ -0.06
CAPNS1-214ENST00000592483 LINC00167Q96N53 147 aa14.65□□□□□ -0.06
CAPNS1-214ENST00000592483 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa14.65□□□□□ -0.06
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CAPNS1-214ENST00000592483 A6NJY4 79 aa14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1-214ENST00000592483 CBY1Q9Y3M2 126 aa14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1-214ENST00000592483 A4D1N5 150 aa14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1-214ENST00000592483 PRR3P79522 188 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1-214ENST00000592483 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1-214ENST00000592483 IGKV2D-28P01615 120 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1-214ENST00000592483 GAGE10A6NGK3 116 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-214ENST00000592483 S100A7L2Q5SY68 101 aa14.61□□□□□ -0.07
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