RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 Q6ZTC4 211 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 A0A087WSZ3 146 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 KIAA0087Q14695 138 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 SMIM29Q86T20 159 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 H0Y9P7 68 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 IGLV6-57P01721 117 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 CHD8Q9HCK8 2581 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 LRRK2Q5S007 2527 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 KLKP1Q107X0 134 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 X6R8D5 127 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 H3BNG1 76 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 PSPHP1O15172 72 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 LIMD2Q9BT23 127 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 CHD7Q9P2D1 2997 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 C7orf33Q8WU49 177 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 Q9BRP9 147 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 MTORP42345 2549 aa7.09□□□□□ -1.28
PTPRM-205ENST00000577827 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRM-205ENST00000577827 JMJD1CQ15652 2540 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRM-205ENST00000577827 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRM-205ENST00000577827 Q8NBF4 154 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRM-205ENST00000577827 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRM-205ENST00000577827 SPTBN4Q9H254 2564 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRM-205ENST00000577827 H3BPC8 53 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRM-205ENST00000577827 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRM-205ENST00000577827 C22orf24Q9Y442 160 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-205ENST00000577827 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-205ENST00000577827 RETNQ9HD89 108 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-205ENST00000577827 LINC00167Q96N53 147 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-205ENST00000577827 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-205ENST00000577827 Q6ZRX8 168 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-205ENST00000577827 A0A0C4DFX4 3053 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRM-205ENST00000577827 POLQO75417 2590 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRM-205ENST00000577827 VPREB1P12018 145 aa7.03□□□□□ -1.28
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PTPRM-205ENST00000577827 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.03□□□□□ -1.28
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PTPRM-205ENST00000577827 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRM-205ENST00000577827 H7BZZ5 65 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-205ENST00000577827 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF462Q96JM2 2506 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-205ENST00000577827 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7□□□□□ -1.29
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PTPRM-205ENST00000577827 SMR3AQ99954 134 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-205ENST00000577827 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-205ENST00000577827 K7ERS5 55 aa6.99□□□□□ -1.29
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PTPRM-205ENST00000577827 Q8NAQ8 132 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-205ENST00000577827 PRLHP81277 87 aa6.99□□□□□ -1.29
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PTPRM-205ENST00000577827 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-205ENST00000577827 PRR34Q9NV39 138 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-205ENST00000577827 HTTP42858 3142 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-205ENST00000577827 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-205ENST00000577827 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-205ENST00000577827 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
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PTPRM-205ENST00000577827 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-205ENST00000577827 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-205ENST00000577827 ACANP16112 2415 aa6.93□□□□□ -1.3
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PTPRM-205ENST00000577827 NUPR2A6NF83 97 aa6.92□□□□□ -1.3
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PTPRM-205ENST00000577827 K7EQZ3 153 aa6.9□□□□□ -1.31
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PTPRM-205ENST00000577827 M0R2N4 97 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-205ENST00000577827 Q8N377 158 aa6.88□□□□□ -1.31
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PTPRM-205ENST00000577827 A8MWP4 228 aa6.88□□□□□ -1.31
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PTPRM-205ENST00000577827 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-205ENST00000577827 C15orf56Q8N910 161 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-205ENST00000577827 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-205ENST00000577827 A8MUN3 132 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-205ENST00000577827 EPM2AB3EWF7 344 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-205ENST00000577827 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.83□□□□□ -1.32
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PTPRM-205ENST00000577827 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-205ENST00000577827 PRR15Q8IV56 129 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-205ENST00000577827 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-205ENST00000577827 IGFL1Q6UW32 110 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-205ENST00000577827 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-205ENST00000577827 A0A1B0GU69 56 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-205ENST00000577827 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-205ENST00000577827 OCR1Q9BZK8 76 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-205ENST00000577827 COA5Q86WW8 74 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-205ENST00000577827 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
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