RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576635.6

SPNS2-208, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 3

Gene SPNS2, Length 901 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-208ENST00000576635 LINC01546A6NGU7 62 aa8.74□□□□□ -1.01
SPNS2-208ENST00000576635 LINC01549A6NIU2 74 aa8.74□□□□□ -1.01
SPNS2-208ENST00000576635 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SPNS2-208ENST00000576635 NDUFA5Q16718 116 aa8.74□□□□□ -1.01
SPNS2-208ENST00000576635 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.74□□□□□ -1.01
SPNS2-208ENST00000576635 RPS10P5Q9NQ39 176 aa8.74□□□□□ -1.01
SPNS2-208ENST00000576635 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SPNS2-208ENST00000576635 SVBPQ8N300 66 aa8.73□□□□□ -1.01
SPNS2-208ENST00000576635 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SPNS2-208ENST00000576635 IGLC3P0DOY3 106 aa8.72□□□□□ -1.01
SPNS2-208ENST00000576635 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.72□□□□□ -1.01
SPNS2-208ENST00000576635 DAND5Q8N907 189 aa8.72□□□□□ -1.01
SPNS2-208ENST00000576635 YPEL4Q96NS1 127 aa8.72□□□□□ -1.01
SPNS2-208ENST00000576635 SNAPINO95295 136 aa8.71□□□□□ -1.02
SPNS2-208ENST00000576635 COX17Q14061 63 aa8.71□□□□□ -1.02
SPNS2-208ENST00000576635 Q8NBF4 154 aa8.71□□□□□ -1.02
SPNS2-208ENST00000576635 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SPNS2-208ENST00000576635 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.68□□□□□ -1.02
SPNS2-208ENST00000576635 FA2HQ7L5A8 372 aa8.68□□□□□ -1.02
SPNS2-208ENST00000576635 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
SPNS2-208ENST00000576635 NDUFA6P56556 154 aa8.67□□□□□ -1.02
SPNS2-208ENST00000576635 SMCO4Q9NRQ5 59 aa8.67□□□□□ -1.02
SPNS2-208ENST00000576635 CRCT1Q9UGL9 99 aa8.67□□□□□ -1.02
SPNS2-208ENST00000576635 FSIP2Q5CZC0 6907 aa8.67□□□□□ -1.02
SPNS2-208ENST00000576635 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
SPNS2-208ENST00000576635 A0A096LNJ9 63 aa8.65□□□□□ -1.02
SPNS2-208ENST00000576635 SPINK1P00995 79 aa8.65□□□□□ -1.02
SPNS2-208ENST00000576635 C11orf86A6NJI1 115 aa8.64□□□□□ -1.03
SPNS2-208ENST00000576635 S100PP25815 95 aa8.64□□□□□ -1.03
SPNS2-208ENST00000576635 A0A0U1RRA0 63 aa8.63□□□□□ -1.03
SPNS2-208ENST00000576635 LINC00158P58513 81 aa8.63□□□□□ -1.03
SPNS2-208ENST00000576635 SFTA2Q6UW10 78 aa8.63□□□□□ -1.03
SPNS2-208ENST00000576635 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.63□□□□□ -1.03
SPNS2-208ENST00000576635 PRYO14603 147 aa8.62□□□□□ -1.03
SPNS2-208ENST00000576635 ATP6V1G1O75348 118 aa8.61□□□□□ -1.03
SPNS2-208ENST00000576635 SPRR1AP35321 89 aa8.61□□□□□ -1.03
SPNS2-208ENST00000576635 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.61□□□□□ -1.03
SPNS2-208ENST00000576635 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
SPNS2-208ENST00000576635 NCR3O14931 201 aa8.6□□□□□ -1.03
SPNS2-208ENST00000576635 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.6□□□□□ -1.03
SPNS2-208ENST00000576635 LINC00483Q53H64 154 aa8.6□□□□□ -1.03
SPNS2-208ENST00000576635 Q8N377 158 aa8.6□□□□□ -1.03
SPNS2-208ENST00000576635 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.6□□□□□ -1.03
SPNS2-208ENST00000576635 PMCHL1Q16048 86 aa8.59□□□□□ -1.03
SPNS2-208ENST00000576635 LCE2CQ5TA81 110 aa8.59□□□□□ -1.03
SPNS2-208ENST00000576635 BAGE3Q86Y29 109 aa8.59□□□□□ -1.03
SPNS2-208ENST00000576635 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.59□□□□□ -1.03
SPNS2-208ENST00000576635 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.59□□□□□ -1.03
SPNS2-208ENST00000576635 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.58□□□□□ -1.04
SPNS2-208ENST00000576635 COLCA2A8K830 154 aa8.58□□□□□ -1.04
SPNS2-208ENST00000576635 HBDP02042 147 aa8.58□□□□□ -1.04
SPNS2-208ENST00000576635 MOBPQ13875 183 aa8.58□□□□□ -1.04
SPNS2-208ENST00000576635 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.58□□□□□ -1.04
SPNS2-208ENST00000576635 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.58□□□□□ -1.04
SPNS2-208ENST00000576635 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.57□□□□□ -1.04
SPNS2-208ENST00000576635 SMIM13P0DJ93 91 aa8.57□□□□□ -1.04
SPNS2-208ENST00000576635 COX19Q49B96 90 aa8.57□□□□□ -1.04
SPNS2-208ENST00000576635 XP32Q5T750 250 aa8.57□□□□□ -1.04
SPNS2-208ENST00000576635 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.57□□□□□ -1.04
SPNS2-208ENST00000576635 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SPNS2-208ENST00000576635 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.55□□□□□ -1.04
SPNS2-208ENST00000576635 ERC2-IT1O76042 136 aa8.55□□□□□ -1.04
SPNS2-208ENST00000576635 LINC00614P0C842 121 aa8.55□□□□□ -1.04
SPNS2-208ENST00000576635 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.55□□□□□ -1.04
SPNS2-208ENST00000576635 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.55□□□□□ -1.04
SPNS2-208ENST00000576635 TMEM223A0PJW6 202 aa8.54□□□□□ -1.04
SPNS2-208ENST00000576635 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.54□□□□□ -1.04
SPNS2-208ENST00000576635 SLC25A20O43772 301 aa8.53□□□□□ -1.04
SPNS2-208ENST00000576635 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa8.53□□□□□ -1.04
SPNS2-208ENST00000576635 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.53□□□□□ -1.04
SPNS2-208ENST00000576635 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
SPNS2-208ENST00000576635 B5MCH6 92 aa8.52□□□□□ -1.05
SPNS2-208ENST00000576635 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.52□□□□□ -1.05
SPNS2-208ENST00000576635 S100A1P23297 94 aa8.51□□□□□ -1.05
SPNS2-208ENST00000576635 TRGC2P03986 189 aa8.5□□□□□ -1.05
SPNS2-208ENST00000576635 MT1HP80294 61 aa8.5□□□□□ -1.05
SPNS2-208ENST00000576635 Q9BRP9 147 aa8.5□□□□□ -1.05
SPNS2-208ENST00000576635 S100A12P80511 92 aa8.48□□□□□ -1.05
SPNS2-208ENST00000576635 HERV-K104P63124 156 aa8.47□□□□□ -1.05
SPNS2-208ENST00000576635 Q6ZRX8 168 aa8.47□□□□□ -1.05
SPNS2-208ENST00000576635 DDTP30046 118 aa8.46□□□□□ -1.06
SPNS2-208ENST00000576635 LINC00310P59036 64 aa8.46□□□□□ -1.06
SPNS2-208ENST00000576635 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.46□□□□□ -1.06
SPNS2-208ENST00000576635 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.45□□□□□ -1.06
SPNS2-208ENST00000576635 PCOTHQ58A44 107 aa8.44□□□□□ -1.06
SPNS2-208ENST00000576635 IFI27L1Q96BM0 104 aa8.44□□□□□ -1.06
SPNS2-208ENST00000576635 LINC00587B1AMM8 73 aa8.43□□□□□ -1.06
SPNS2-208ENST00000576635 CFC1BP0CG36 223 aa8.43□□□□□ -1.06
SPNS2-208ENST00000576635 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.43□□□□□ -1.06
SPNS2-208ENST00000576635 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.42□□□□□ -1.06
SPNS2-208ENST00000576635 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.42□□□□□ -1.06
SPNS2-208ENST00000576635 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.42□□□□□ -1.06
SPNS2-208ENST00000576635 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.41□□□□□ -1.06
SPNS2-208ENST00000576635 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.41□□□□□ -1.06
SPNS2-208ENST00000576635 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.41□□□□□ -1.06
SPNS2-208ENST00000576635 HIST1H2BKO60814 126 aa8.4□□□□□ -1.06
SPNS2-208ENST00000576635 HIST1H2BJP06899 126 aa8.4□□□□□ -1.06
SPNS2-208ENST00000576635 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
SPNS2-208ENST00000576635 HIST1H2BOP23527 126 aa8.4□□□□□ -1.06
SPNS2-208ENST00000576635 HIST1H2BBP33778 126 aa8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 163.9 ms