RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568043.5

INO80E-212, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene INO80E, Length 482 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-212ENST00000568043 SFTA2Q6UW10 78 aa11.05□□□□□ -0.64
INO80E-212ENST00000568043 NDUFA1O15239 70 aa11.04□□□□□ -0.64
INO80E-212ENST00000568043 SMIM6P0DI80 62 aa11.04□□□□□ -0.64
INO80E-212ENST00000568043 ANKRD39Q53RE8 183 aa11.04□□□□□ -0.64
INO80E-212ENST00000568043 C1orf137Q5JT78 98 aa11.04□□□□□ -0.64
INO80E-212ENST00000568043 C10orf25Q5T742 122 aa11.04□□□□□ -0.64
INO80E-212ENST00000568043 J3QQQ9 107 aa11.03□□□□□ -0.64
INO80E-212ENST00000568043 TSPEAR-AS2P59090 65 aa11.03□□□□□ -0.64
INO80E-212ENST00000568043 C6orf226Q5I0X4 101 aa11.03□□□□□ -0.64
INO80E-212ENST00000568043 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
INO80E-212ENST00000568043 NMUP48645 174 aa11.02□□□□□ -0.65
INO80E-212ENST00000568043 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa11.02□□□□□ -0.65
INO80E-212ENST00000568043 VAMP8Q9BV40 100 aa11.02□□□□□ -0.65
INO80E-212ENST00000568043 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa11.01□□□□□ -0.65
INO80E-212ENST00000568043 FAM168BA1KXE4 195 aa11.01□□□□□ -0.65
INO80E-212ENST00000568043 TLX1NBP0CAT3 122 aa11.01□□□□□ -0.65
INO80E-212ENST00000568043 CKS1BP61024 79 aa11.01□□□□□ -0.65
INO80E-212ENST00000568043 C6orf48Q9UBA6 75 aa11.01□□□□□ -0.65
INO80E-212ENST00000568043 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
INO80E-212ENST00000568043 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
INO80E-212ENST00000568043 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa10.99□□□□□ -0.65
INO80E-212ENST00000568043 C2orf82Q6UX34 121 aa10.99□□□□□ -0.65
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa10.99□□□□□ -0.65
INO80E-212ENST00000568043 NDUFA12Q9UI09 145 aa10.99□□□□□ -0.65
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa10.98□□□□□ -0.65
INO80E-212ENST00000568043 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa10.98□□□□□ -0.65
INO80E-212ENST00000568043 IGLV7-43P04211 117 aa10.98□□□□□ -0.65
INO80E-212ENST00000568043 GAGE2EQ4V326 116 aa10.98□□□□□ -0.65
INO80E-212ENST00000568043 SPATA45Q537H7 98 aa10.98□□□□□ -0.65
INO80E-212ENST00000568043 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
INO80E-212ENST00000568043 GAGE2DQ9UEU5 116 aa10.98□□□□□ -0.65
INO80E-212ENST00000568043 PAM16Q9Y3D7 125 aa10.98□□□□□ -0.65
INO80E-212ENST00000568043 HERV-K104P63124 156 aa10.97□□□□□ -0.65
INO80E-212ENST00000568043 DIRC1Q969H9 104 aa10.97□□□□□ -0.65
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa10.96□□□□□ -0.65
INO80E-212ENST00000568043 ZNF815PA8K554 130 aa10.95□□□□□ -0.66
INO80E-212ENST00000568043 S100A12P80511 92 aa10.95□□□□□ -0.66
INO80E-212ENST00000568043 PRR4Q16378 134 aa10.95□□□□□ -0.66
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa10.95□□□□□ -0.66
INO80E-212ENST00000568043 FAT4Q6V0I7 4981 aa10.93□□□□□ -0.66
INO80E-212ENST00000568043 H0Y9J4 135 aa10.93□□□□□ -0.66
INO80E-212ENST00000568043 M0QXV9 152 aa10.93□□□□□ -0.66
INO80E-212ENST00000568043 COX8AP10176 69 aa10.93□□□□□ -0.66
INO80E-212ENST00000568043 PCP2Q8IVA1 136 aa10.93□□□□□ -0.66
INO80E-212ENST00000568043 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa10.92□□□□□ -0.66
INO80E-212ENST00000568043 TTTY13Q9BZ97 58 aa10.92□□□□□ -0.66
INO80E-212ENST00000568043 A0A0U1RQV1 116 aa10.91□□□□□ -0.66
INO80E-212ENST00000568043 LINC00587B1AMM8 73 aa10.91□□□□□ -0.66
INO80E-212ENST00000568043 ERG28Q9UKR5 140 aa10.91□□□□□ -0.66
INO80E-212ENST00000568043 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa10.9□□□□□ -0.66
INO80E-212ENST00000568043 A0A0J9YXY3 114 aa10.9□□□□□ -0.66
INO80E-212ENST00000568043 DLEU1O43261 78 aa10.9□□□□□ -0.66
INO80E-212ENST00000568043 UBE2BP63146 152 aa10.9□□□□□ -0.66
INO80E-212ENST00000568043 COX17Q14061 63 aa10.9□□□□□ -0.66
INO80E-212ENST00000568043 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
INO80E-212ENST00000568043 BOD1L2Q8IYS8 172 aa10.9□□□□□ -0.66
INO80E-212ENST00000568043 MEIG1Q5JSS6 88 aa10.89□□□□□ -0.67
INO80E-212ENST00000568043 TIMM17BO60830 172 aa10.88□□□□□ -0.67
INO80E-212ENST00000568043 C12orf57Q99622 126 aa10.88□□□□□ -0.67
INO80E-212ENST00000568043 SLC25A34Q6PIV7 304 aa10.87□□□□□ -0.67
INO80E-212ENST00000568043 SCGB1D4Q6XE38 83 aa10.87□□□□□ -0.67
INO80E-212ENST00000568043 LINC00518Q8N0U6 118 aa10.86□□□□□ -0.67
INO80E-212ENST00000568043 C14orf144Q96I85 54 aa10.86□□□□□ -0.67
INO80E-212ENST00000568043 SMIM13P0DJ93 91 aa10.85□□□□□ -0.67
INO80E-212ENST00000568043 PFN2P35080 140 aa10.85□□□□□ -0.67
INO80E-212ENST00000568043 TMEM238C9JI98 176 aa10.84□□□□□ -0.67
INO80E-212ENST00000568043 LITAFQ99732 161 aa10.84□□□□□ -0.67
INO80E-212ENST00000568043 LINC00158P58513 81 aa10.83□□□□□ -0.68
INO80E-212ENST00000568043 TP73-AS1Q9UF72 201 aa10.83□□□□□ -0.68
INO80E-212ENST00000568043 UQCR10Q9UDW1 63 aa10.82□□□□□ -0.68
INO80E-212ENST00000568043 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa10.81□□□□□ -0.68
INO80E-212ENST00000568043 SPANXDQ9BXN6 97 aa10.81□□□□□ -0.68
INO80E-212ENST00000568043 XAGE1AQ9HD64 81 aa10.81□□□□□ -0.68
INO80E-212ENST00000568043 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
INO80E-212ENST00000568043 SPANXCQ9NY87 97 aa10.81□□□□□ -0.68
INO80E-212ENST00000568043 HIGD1BQ9P298 99 aa10.81□□□□□ -0.68
INO80E-212ENST00000568043 A0A0U1RRA0 63 aa10.8□□□□□ -0.68
INO80E-212ENST00000568043 Q6ZVH6 145 aa10.8□□□□□ -0.68
INO80E-212ENST00000568043 C22orf24Q9Y442 160 aa10.8□□□□□ -0.68
INO80E-212ENST00000568043 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
INO80E-212ENST00000568043 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa10.79□□□□□ -0.68
INO80E-212ENST00000568043 ZNF861PO60384 105 aa10.78□□□□□ -0.68
INO80E-212ENST00000568043 TSPAN13O95857 204 aa10.78□□□□□ -0.68
INO80E-212ENST00000568043 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa10.78□□□□□ -0.68
INO80E-212ENST00000568043 C2orf91Q6ZV80 131 aa10.78□□□□□ -0.68
INO80E-212ENST00000568043 PPDPFQ9H3Y8 114 aa10.78□□□□□ -0.68
INO80E-212ENST00000568043 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa10.77□□□□□ -0.69
INO80E-212ENST00000568043 TSTD3H0UI37 97 aa10.77□□□□□ -0.69
INO80E-212ENST00000568043 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
INO80E-212ENST00000568043 ARL17AQ8IVW1 177 aa10.77□□□□□ -0.69
INO80E-212ENST00000568043 DAND5Q8N907 189 aa10.77□□□□□ -0.69
INO80E-212ENST00000568043 COPS9Q8WXC6 57 aa10.77□□□□□ -0.69
INO80E-212ENST00000568043 MIEN1Q9BRT3 115 aa10.77□□□□□ -0.69
INO80E-212ENST00000568043 PRO1933Q9H354 126 aa10.77□□□□□ -0.69
INO80E-212ENST00000568043 IFITM1P13164 125 aa10.75□□□□□ -0.69
INO80E-212ENST00000568043 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
INO80E-212ENST00000568043 MUC17Q685J3 4493 aa10.74□□□□□ -0.69
INO80E-212ENST00000568043 LINC00308Q8TCZ7 52 aa10.74□□□□□ -0.69
INO80E-212ENST00000568043 TAL2Q16559 108 aa10.73□□□□□ -0.69
INO80E-212ENST00000568043 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.8 ms