RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567316.1

CTU2-209, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTU2, Length 452 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-209ENST00000567316 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9.83□□□□□ -0.84
CTU2-209ENST00000567316 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CTU2-209ENST00000567316 KIAA1109Q2LD37 5005 aa9.82□□□□□ -0.84
CTU2-209ENST00000567316 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa9.82□□□□□ -0.84
CTU2-209ENST00000567316 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CTU2-209ENST00000567316 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.82□□□□□ -0.84
CTU2-209ENST00000567316 Q6ZVH6 145 aa9.82□□□□□ -0.84
CTU2-209ENST00000567316 ARL17AQ8IVW1 177 aa9.82□□□□□ -0.84
CTU2-209ENST00000567316 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.82□□□□□ -0.84
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CTU2-209ENST00000567316 SPACA4Q8TDM5 124 aa9.81□□□□□ -0.84
CTU2-209ENST00000567316 IFITM1P13164 125 aa9.8□□□□□ -0.84
CTU2-209ENST00000567316 MUSTN1Q8IVN3 82 aa9.8□□□□□ -0.84
CTU2-209ENST00000567316 HIST1H4GQ99525 98 aa9.8□□□□□ -0.84
CTU2-209ENST00000567316 FAM30AQ9NZY2 134 aa9.8□□□□□ -0.84
CTU2-209ENST00000567316 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.8□□□□□ -0.84
CTU2-209ENST00000567316 CDK2AP2O75956 126 aa9.79□□□□□ -0.84
CTU2-209ENST00000567316 FAM168BA1KXE4 195 aa9.78□□□□□ -0.84
CTU2-209ENST00000567316 TAL2Q16559 108 aa9.78□□□□□ -0.84
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CTU2-209ENST00000567316 COPS9Q8WXC6 57 aa9.77□□□□□ -0.85
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CTU2-209ENST00000567316 DNAH8Q96JB1 4490 aa9.76□□□□□ -0.85
CTU2-209ENST00000567316 VPREB1P12018 145 aa9.76□□□□□ -0.85
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CTU2-209ENST00000567316 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa9.76□□□□□ -0.85
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CTU2-209ENST00000567316 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CTU2-209ENST00000567316 LRP1BQ9NZR2 4599 aa9.75□□□□□ -0.85
CTU2-209ENST00000567316 DDTP30046 118 aa9.74□□□□□ -0.85
CTU2-209ENST00000567316 CTAG1AP78358 180 aa9.74□□□□□ -0.85
CTU2-209ENST00000567316 RPL24P83731 157 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CTU2-209ENST00000567316 CEND1Q8N111 149 aa9.74□□□□□ -0.85
CTU2-209ENST00000567316 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa9.73□□□□□ -0.85
CTU2-209ENST00000567316 EPM2AB3EWF7 344 aa9.73□□□□□ -0.85
CTU2-209ENST00000567316 NDUFC2O95298 119 aa9.73□□□□□ -0.85
CTU2-209ENST00000567316 PRR3P79522 188 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CTU2-209ENST00000567316 PLAC8Q9NZF1 115 aa9.73□□□□□ -0.85
CTU2-209ENST00000567316 RYR1P21817 5038 aa9.73□□□□□ -0.85
CTU2-209ENST00000567316 A4D1N5 150 aa9.72□□□□□ -0.85
CTU2-209ENST00000567316 SCXQ7RTU7 201 aa9.71□□□□□ -0.86
CTU2-209ENST00000567316 NKAPP1Q8N9T2 125 aa9.71□□□□□ -0.86
CTU2-209ENST00000567316 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.71□□□□□ -0.86
CTU2-209ENST00000567316 C22orf24Q9Y442 160 aa9.71□□□□□ -0.86
CTU2-209ENST00000567316 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.7□□□□□ -0.86
CTU2-209ENST00000567316 NCR3O14931 201 aa9.7□□□□□ -0.86
CTU2-209ENST00000567316 IGKV2D-28P01615 120 aa9.7□□□□□ -0.86
CTU2-209ENST00000567316 FXYD2P54710 66 aa9.7□□□□□ -0.86
CTU2-209ENST00000567316 HAMPP81172 84 aa9.7□□□□□ -0.86
CTU2-209ENST00000567316 M0QXV9 152 aa9.69□□□□□ -0.86
CTU2-209ENST00000567316 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
CTU2-209ENST00000567316 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.68□□□□□ -0.86
CTU2-209ENST00000567316 M0R378 163 aa9.68□□□□□ -0.86
CTU2-209ENST00000567316 XGP55808 180 aa9.68□□□□□ -0.86
CTU2-209ENST00000567316 C7orf33Q8WU49 177 aa9.68□□□□□ -0.86
CTU2-209ENST00000567316 PCLOQ9Y6V0 5065 aa9.68□□□□□ -0.86
CTU2-209ENST00000567316 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
CTU2-209ENST00000567316 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa9.67□□□□□ -0.86
CTU2-209ENST00000567316 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CTU2-209ENST00000567316 LINC00167Q96N53 147 aa9.67□□□□□ -0.86
CTU2-209ENST00000567316 PCP4L1A6NKN8 68 aa9.66□□□□□ -0.86
CTU2-209ENST00000567316 CFC1BP0CG36 223 aa9.66□□□□□ -0.86
CTU2-209ENST00000567316 CFC1P0CG37 223 aa9.66□□□□□ -0.86
CTU2-209ENST00000567316 LINC00337Q8N6G1 96 aa9.66□□□□□ -0.86
CTU2-209ENST00000567316 APOBP04114 4563 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CTU2-209ENST00000567316 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa9.65□□□□□ -0.86
CTU2-209ENST00000567316 GAGE10A6NGK3 116 aa9.65□□□□□ -0.86
CTU2-209ENST00000567316 A6NJY4 79 aa9.65□□□□□ -0.86
CTU2-209ENST00000567316 M0R143 59 aa9.65□□□□□ -0.86
CTU2-209ENST00000567316 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CTU2-209ENST00000567316 HSPG2P98160 4391 aa9.64□□□□□ -0.87
CTU2-209ENST00000567316 A0A0B4J2C4 111 aa9.63□□□□□ -0.87
CTU2-209ENST00000567316 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa9.63□□□□□ -0.87
CTU2-209ENST00000567316 RPL37AP8A6NKH3 93 aa9.63□□□□□ -0.87
CTU2-209ENST00000567316 OR13C6PQ8NH95 151 aa9.63□□□□□ -0.87
CTU2-209ENST00000567316 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CTU2-209ENST00000567316 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa9.62□□□□□ -0.87
CTU2-209ENST00000567316 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa9.62□□□□□ -0.87
CTU2-209ENST00000567316 IGLV6-57P01721 117 aa9.62□□□□□ -0.87
CTU2-209ENST00000567316 S100A7L2Q5SY68 101 aa9.62□□□□□ -0.87
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa9.62□□□□□ -0.87
CTU2-209ENST00000567316 Q8N1X5 172 aa9.62□□□□□ -0.87
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa9.62□□□□□ -0.87
CTU2-209ENST00000567316 A0A1B0GWB2 263 aa9.61□□□□□ -0.87
CTU2-209ENST00000567316 A6NDN8 102 aa9.61□□□□□ -0.87
CTU2-209ENST00000567316 UBE2BP63146 152 aa9.61□□□□□ -0.87
CTU2-209ENST00000567316 RAB37Q96AX2 223 aa9.61□□□□□ -0.87
CTU2-209ENST00000567316 TMEM126AQ9H061 195 aa9.6□□□□□ -0.87
CTU2-209ENST00000567316 BATFQ16520 125 aa9.59□□□□□ -0.87
CTU2-209ENST00000567316 K7ERJ3 54 aa9.58□□□□□ -0.88
CTU2-209ENST00000567316 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CTU2-209ENST00000567316 KCNQ1DNQ9H478 68 aa9.58□□□□□ -0.88
CTU2-209ENST00000567316 PRO1854Q9UHT4 67 aa9.58□□□□□ -0.88
CTU2-209ENST00000567316 PRYO14603 147 aa9.56□□□□□ -0.88
CTU2-209ENST00000567316 SNHG12Q9BXW3 62 aa9.56□□□□□ -0.88
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