RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563951.1

CCDC33-211, Transcript of coiled-coil domain containing 33, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC33, Length 308 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33-211ENST00000563951 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.24□□□□□ -1.57
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CCDC33-211ENST00000563951 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.23□□□□□ -1.57
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CCDC33-211ENST00000563951 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.22□□□□□ -1.57
CCDC33-211ENST00000563951 Q8NDZ9 215 aa5.22□□□□□ -1.57
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CCDC33-211ENST00000563951 LINC00167Q96N53 147 aa5.17□□□□□ -1.58
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CCDC33-211ENST00000563951 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa5.14□□□□□ -1.59
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CCDC33-211ENST00000563951 HERVK_113P61574 105 aa5.12□□□□□ -1.59
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CCDC33-211ENST00000563951 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.09□□□□□ -1.59
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CCDC33-211ENST00000563951 HIST1H2BLQ99880 126 aa5.08□□□□□ -1.6
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CCDC33-211ENST00000563951 A0A087X002 238 aa5.06□□□□□ -1.6
CCDC33-211ENST00000563951 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa5.06□□□□□ -1.6
CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CCDC33-211ENST00000563951 SPRR1AP35321 89 aa5.06□□□□□ -1.6
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF815PA8K554 130 aa5.05□□□□□ -1.6
CCDC33-211ENST00000563951 UBE2AP49459 152 aa5.05□□□□□ -1.6
CCDC33-211ENST00000563951 NPC2P61916 151 aa5.05□□□□□ -1.6
CCDC33-211ENST00000563951 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.05□□□□□ -1.6
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