RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 C11orf94C9JXX5 98 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-209ENST00000561136 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-209ENST00000561136 MIAQ16674 131 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-209ENST00000561136 FAM19A2Q8N3H0 131 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-209ENST00000561136 Q8N6K4 173 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-209ENST00000561136 C8orf17Q9NRJ1 99 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-209ENST00000561136 PRO1854Q9UHT4 67 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-209ENST00000561136 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-209ENST00000561136 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-209ENST00000561136 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-209ENST00000561136 C16orf90A8MZG2 172 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-209ENST00000561136 HCG22E2RYF7 251 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-209ENST00000561136 IGLV2-23P01705 113 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-209ENST00000561136 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-209ENST00000561136 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-209ENST00000561136 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-209ENST00000561136 ATXN8Q156A1 80 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-209ENST00000561136 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-209ENST00000561136 Q6JHZ5 121 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-209ENST00000561136 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-209ENST00000561136 C20orf197Q8N268 126 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-209ENST00000561136 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-209ENST00000561136 C7orf33Q8WU49 177 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-209ENST00000561136 PKD1P98161 4303 aa3.71□□□□□ -1.81
TMOD3-209ENST00000561136 NACAE9PAV3 2078 aa3.71□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa3.71□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa3.71□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 CGB3P0DN86 165 aa3.71□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 CGB7P0DN87 165 aa3.71□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 MT3P25713 68 aa3.71□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 PLGLAQ15195 96 aa3.71□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 LUZP6Q538Z0 58 aa3.71□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 SMCR5Q8TEV8 140 aa3.71□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF414Q96IQ9 312 aa3.71□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa3.71□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 CHCHD7Q9BUK0 85 aa3.71□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.71□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 DNAH17Q9UFH2 4485 aa3.7□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa3.7□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa3.7□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa3.7□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 A0A1B0GVY2 172 aa3.7□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa3.7□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 FAM223BA6NKX1 122 aa3.7□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 SOCS3O14543 225 aa3.7□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 IGLV1-51P01701 117 aa3.7□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 C10orf25Q5T742 122 aa3.7□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 LYPD6Q86Y78 171 aa3.7□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 Q8N814 137 aa3.7□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM190Q8WZ59 177 aa3.7□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.7□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3.7□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 A0A0J9YWU9 116 aa3.69□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 A6NED7 52 aa3.69□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 SMIM1B2RUZ4 78 aa3.69□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 F8WEM9 126 aa3.69□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 GAS8-AS1O95177 125 aa3.69□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 MIFP14174 115 aa3.69□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 PIGYQ3MUY2 71 aa3.69□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa3.69□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 Q8IYB0 196 aa3.69□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 TXNDC17Q9BRA2 123 aa3.69□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 APOBP04114 4563 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa3.68□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa3.68□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 SH2D1AO60880 128 aa3.68□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 ERC2-IT1O76042 136 aa3.68□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV3-23P01764 117 aa3.68□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 COX6CP09669 75 aa3.68□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 C15orf32Q32M92 178 aa3.68□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa3.68□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 LIMD2Q9BT23 127 aa3.68□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 LINC00574Q9H8X3 128 aa3.68□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 R4GMQ9 66 aa3.68□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 LRP1BQ9NZR2 4599 aa3.67□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 TRAV22A0A0B4J277 110 aa3.67□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM223A0PJW6 202 aa3.67□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF815PA8K554 130 aa3.67□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 RPL28P46779 137 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 UBE2D1P51668 147 aa3.67□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 C2orf82Q6UX34 121 aa3.67□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa3.67□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa3.66□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 LECT2O14960 151 aa3.66□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 APELAP0DMC3 54 aa3.66□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 ROMO1P60602 79 aa3.66□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 DEFB135Q30KP9 77 aa3.66□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 FAM229BQ4G0N7 80 aa3.66□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 C1orf134Q5TEV5 83 aa3.66□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.66□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 Q8NDZ9 215 aa3.66□□□□□ -1.82
TMOD3-209ENST00000561136 NUPR2A6NF83 97 aa3.65□□□□□ -1.83
TMOD3-209ENST00000561136 SDHAF1A6NFY7 115 aa3.65□□□□□ -1.83
TMOD3-209ENST00000561136 LINC01549A6NIU2 74 aa3.65□□□□□ -1.83
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM14DPA8MWL7 114 aa3.65□□□□□ -1.83
TMOD3-209ENST00000561136 A8MWP4 228 aa3.65□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms