RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	LCE6A	A0A183	80 aa		2.83	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM223	A0PJW6	202 aa		2.83	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	SPINK8	P0C7L1	97 aa		2.83	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	HERVK_113	P63121	156 aa		2.83	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	SEC11A	P67812	179 aa		2.83	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	SPATA45	Q537H7	98 aa		2.83	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		2.83	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		2.83	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		2.83	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	C14orf144	Q96I85	54 aa		2.83	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		2.83	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		2.82	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		2.82	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	COX7A2L	O14548	114 aa		2.82	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	PLN	P26678	52 aa		2.82	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	WFDC2	Q14508	124 aa		2.82	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	KIAA0087	Q14695	138 aa		2.82	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	TTC32	Q5I0X7	151 aa		2.82	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		2.82	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	C6orf223	Q8N319	242 aa		2.82	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	LINC00167	Q96N53	147 aa		2.82	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		2.81	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934		H3BRM9	83 aa		2.81	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	LECT2	O14960	151 aa		2.81	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	RTL8C	O15255	209 aa		2.81	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	PCP2	Q8IVA1	136 aa		2.81	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	C15orf56	Q8N910	161 aa		2.81	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	RMI2	Q96E14	147 aa		2.81	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		2.81	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		2.81	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		2.81	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934		A0A087WTM6	91 aa		2.8	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	LEPROT	O15243	131 aa		2.8	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	PSCA	O43653	123 aa		2.8	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		2.8	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	CTAG1A	P78358	180 aa		2.8	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		2.8	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	C2orf82	Q6UX34	121 aa		2.8	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		2.8	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		2.8	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		2.8	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		2.79	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		2.79	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934		J3QQQ9	107 aa		2.79	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934		M0R143	59 aa		2.79	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	DLEU1	O43261	78 aa		2.79	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	APOM	O95445	188 aa		2.79	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	COX8A	P10176	69 aa		2.79	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	2.79	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	NMU	P48645	174 aa		2.79	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	HERVK_113	P61574	105 aa		2.79	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		2.79	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		2.79	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934		Q6ZVH6	145 aa		2.79	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		2.79	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	COX7B2	Q8TF08	81 aa		2.79	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		2.79	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		2.79	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		2.79	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	SPAG11B	Q08648	103 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934		Q6ZRU5	148 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934		Q8IZM0	81 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LINS1-210	ENST00000560934	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
LINS1-210	ENST00000560934	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF815P	A8K554	130 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LINS1-210	ENST00000560934	NDUFA1	O15239	70 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LINS1-210	ENST00000560934	CKS1B	P61024	79 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LINS1-210	ENST00000560934	SYCN	Q0VAF6	134 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LINS1-210	ENST00000560934		Q8N814	137 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LINS1-210	ENST00000560934	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LINS1-210	ENST00000560934	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LINS1-210	ENST00000560934	SMIM13	P0DJ93	91 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LINS1-210	ENST00000560934	PFN2	P35080	140 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LINS1-210	ENST00000560934	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LINS1-210	ENST00000560934	HIGD1B	Q9P298	99 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LINS1-210	ENST00000560934	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1B0GV90	55 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LINS1-210	ENST00000560934	CXCL5	P42830	114 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LINS1-210	ENST00000560934	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
LINS1-210	ENST00000560934	LINC00158	P58513	81 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LINS1-210	ENST00000560934	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
LINS1-210	ENST00000560934	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LINS1-210	ENST00000560934	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LINS1-210	ENST00000560934	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LINS1-210	ENST00000560934	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LINS1-210	ENST00000560934	DAND5	Q8N907	189 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LINS1-210	ENST00000560934	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LINS1-210	ENST00000560934	CARD19	Q96LW7	228 aa		2.75	□□□□□ -1.97

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