RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559143.1

MFGE8-209, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 3

Gene MFGE8, Length 358 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-209ENST00000559143 LINC00158P58513 81 aa5.74□□□□□ -1.49
MFGE8-209ENST00000559143 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
MFGE8-209ENST00000559143 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
MFGE8-209ENST00000559143 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.74□□□□□ -1.49
MFGE8-209ENST00000559143 C22orf24Q9Y442 160 aa5.74□□□□□ -1.49
MFGE8-209ENST00000559143 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.73□□□□□ -1.49
MFGE8-209ENST00000559143 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.73□□□□□ -1.49
MFGE8-209ENST00000559143 VPREB1P12018 145 aa5.73□□□□□ -1.49
MFGE8-209ENST00000559143 TIMM17BO60830 172 aa5.72□□□□□ -1.49
MFGE8-209ENST00000559143 SMIM13P0DJ93 91 aa5.72□□□□□ -1.49
MFGE8-209ENST00000559143 UBE2BP63146 152 aa5.72□□□□□ -1.49
MFGE8-209ENST00000559143 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa5.72□□□□□ -1.49
MFGE8-209ENST00000559143 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.72□□□□□ -1.49
MFGE8-209ENST00000559143 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.72□□□□□ -1.49
MFGE8-209ENST00000559143 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
MFGE8-209ENST00000559143 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.71□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 A0A0J9YXY3 114 aa5.71□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.71□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 ZNF815PA8K554 130 aa5.7□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.7□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 LINC00167Q96N53 147 aa5.7□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.7□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 A0A0U1RRA0 63 aa5.69□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 HSBP1L1C9JCN9 74 aa5.69□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 NDUFC2O95298 119 aa5.69□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 OXTP01178 125 aa5.69□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 IGLV7-43P04211 117 aa5.69□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 ANKRD39Q53RE8 183 aa5.69□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 C1orf137Q5JT78 98 aa5.69□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.69□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa5.68□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.68□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 M0R378 163 aa5.68□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 BOD1L2Q8IYS8 172 aa5.68□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 ATOH7Q8N100 152 aa5.68□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 Q8NDZ9 215 aa5.68□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 LITAFQ99732 161 aa5.68□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.68□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 BCE1O60756 84 aa5.67□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 Q6ZVH6 145 aa5.67□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 TMEM238C9JI98 176 aa5.66□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 REG3GQ6UW15 175 aa5.66□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 COPS9Q8WXC6 57 aa5.66□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 DIRC1Q969H9 104 aa5.66□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.66□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 SPANXCQ9NY87 97 aa5.66□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 GAGE10A6NGK3 116 aa5.65□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 ZNF861PO60384 105 aa5.65□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 SCGB1D1O95968 90 aa5.65□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.65□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.65□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 DAND5Q8N907 189 aa5.65□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.65□□□□□ -1.5
MFGE8-209ENST00000559143 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.65□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 RPL37AP8A6NKH3 93 aa5.64□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 H0Y9J4 135 aa5.64□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 IFITM1P13164 125 aa5.64□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 S100A12P80511 92 aa5.64□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa5.64□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.64□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 KCNQ1DNQ9H478 68 aa5.64□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 CBY1Q9Y3M2 126 aa5.64□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.63□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 PRYO14603 147 aa5.63□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 IGKV2D-28P01615 120 aa5.63□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 SPRR1AP35321 89 aa5.63□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.63□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 PCP2Q8IVA1 136 aa5.63□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 LINC01600Q96MT4 127 aa5.63□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 TMEM126AQ9H061 195 aa5.63□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 DLEU1O43261 78 aa5.62□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 LINC00518Q8N0U6 118 aa5.62□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 LINC00337Q8N6G1 96 aa5.62□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 NCR3O14931 201 aa5.61□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 IGLV6-57P01721 117 aa5.61□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 COX8AP10176 69 aa5.61□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa5.6□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 J3QL48 77 aa5.6□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 DDTP30046 118 aa5.6□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 UBE2AP49459 152 aa5.6□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 MYCBP2O75592 4640 aa5.59□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 NPC2P61916 151 aa5.59□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.59□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.59□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 VAMP8Q9BV40 100 aa5.59□□□□□ -1.51
MFGE8-209ENST00000559143 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.58□□□□□ -1.52
MFGE8-209ENST00000559143 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.58□□□□□ -1.52
MFGE8-209ENST00000559143 MT1HL1P0DM35 61 aa5.58□□□□□ -1.52
MFGE8-209ENST00000559143 PYY3Q5JQD4 70 aa5.58□□□□□ -1.52
MFGE8-209ENST00000559143 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa5.57□□□□□ -1.52
MFGE8-209ENST00000559143 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms