RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556496.2

NRXN3-213, Transcript of neurexin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NRXN3, Length 2,737 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3-213ENST00000556496 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.09□□□□□ -1.27
NRXN3-213ENST00000556496 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.09□□□□□ -1.27
NRXN3-213ENST00000556496 TENM3Q9P273 2699 aa7.09□□□□□ -1.27
NRXN3-213ENST00000556496 C6orf99Q4VX62 202 aa7.08□□□□□ -1.28
NRXN3-213ENST00000556496 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.08□□□□□ -1.28
NRXN3-213ENST00000556496 ANK2Q01484 3957 aa7.08□□□□□ -1.28
NRXN3-213ENST00000556496 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.08□□□□□ -1.28
NRXN3-213ENST00000556496 Q8N814 137 aa7.08□□□□□ -1.28
NRXN3-213ENST00000556496 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.08□□□□□ -1.28
NRXN3-213ENST00000556496 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.08□□□□□ -1.28
NRXN3-213ENST00000556496 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
NRXN3-213ENST00000556496 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.07□□□□□ -1.28
NRXN3-213ENST00000556496 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.07□□□□□ -1.28
NRXN3-213ENST00000556496 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
NRXN3-213ENST00000556496 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
NRXN3-213ENST00000556496 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.07□□□□□ -1.28
NRXN3-213ENST00000556496 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.07□□□□□ -1.28
NRXN3-213ENST00000556496 A0A1B0GX51 115 aa7.07□□□□□ -1.28
NRXN3-213ENST00000556496 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.06□□□□□ -1.28
NRXN3-213ENST00000556496 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.06□□□□□ -1.28
NRXN3-213ENST00000556496 NOTCH1P46531 2555 aa7.06□□□□□ -1.28
NRXN3-213ENST00000556496 LINC00167Q96N53 147 aa7.06□□□□□ -1.28
NRXN3-213ENST00000556496 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN3-213ENST00000556496 LINC00643Q86TS7 51 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN3-213ENST00000556496 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN3-213ENST00000556496 IGLV6-57P01721 117 aa7.04□□□□□ -1.28
NRXN3-213ENST00000556496 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
NRXN3-213ENST00000556496 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.04□□□□□ -1.28
NRXN3-213ENST00000556496 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.04□□□□□ -1.28
NRXN3-213ENST00000556496 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
NRXN3-213ENST00000556496 LINC00575Q6W349 94 aa7.03□□□□□ -1.28
NRXN3-213ENST00000556496 C15orf56Q8N910 161 aa7.03□□□□□ -1.28
NRXN3-213ENST00000556496 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.03□□□□□ -1.28
NRXN3-213ENST00000556496 COL6A5A8TX70 2615 aa7.03□□□□□ -1.28
NRXN3-213ENST00000556496 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.02□□□□□ -1.29
NRXN3-213ENST00000556496 Q6ZRU5 148 aa7.02□□□□□ -1.29
NRXN3-213ENST00000556496 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.02□□□□□ -1.29
NRXN3-213ENST00000556496 CMYA5Q8N3K9 4069 aa7.02□□□□□ -1.29
NRXN3-213ENST00000556496 IMUPQ9GZP8 106 aa7.01□□□□□ -1.29
NRXN3-213ENST00000556496 hADV29S1A0JD25 119 aa7.01□□□□□ -1.29
NRXN3-213ENST00000556496 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7□□□□□ -1.29
NRXN3-213ENST00000556496 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7□□□□□ -1.29
NRXN3-213ENST00000556496 C2orf48Q96LS8 159 aa7□□□□□ -1.29
NRXN3-213ENST00000556496 LINC00846Q9NV44 126 aa7□□□□□ -1.29
NRXN3-213ENST00000556496 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.99□□□□□ -1.29
NRXN3-213ENST00000556496 MRAPQ8TCY5 172 aa6.99□□□□□ -1.29
NRXN3-213ENST00000556496 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.99□□□□□ -1.29
NRXN3-213ENST00000556496 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.99□□□□□ -1.29
NRXN3-213ENST00000556496 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.99□□□□□ -1.29
NRXN3-213ENST00000556496 VPREB1P12018 145 aa6.99□□□□□ -1.29
NRXN3-213ENST00000556496 DIRC1Q969H9 104 aa6.99□□□□□ -1.29
NRXN3-213ENST00000556496 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.98□□□□□ -1.29
NRXN3-213ENST00000556496 CCKP06307 115 aa6.98□□□□□ -1.29
NRXN3-213ENST00000556496 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
NRXN3-213ENST00000556496 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.97□□□□□ -1.29
NRXN3-213ENST00000556496 Q6ZQY7 126 aa6.97□□□□□ -1.29
NRXN3-213ENST00000556496 Q6ZRP5 223 aa6.97□□□□□ -1.29
NRXN3-213ENST00000556496 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.96□□□□□ -1.29
NRXN3-213ENST00000556496 SYCNQ0VAF6 134 aa6.96□□□□□ -1.29
NRXN3-213ENST00000556496 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.96□□□□□ -1.29
NRXN3-213ENST00000556496 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.96□□□□□ -1.29
NRXN3-213ENST00000556496 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.96□□□□□ -1.3
NRXN3-213ENST00000556496 CCDC179H3BU77 68 aa6.96□□□□□ -1.3
NRXN3-213ENST00000556496 K7EIL1 84 aa6.96□□□□□ -1.3
NRXN3-213ENST00000556496 M0R378 163 aa6.96□□□□□ -1.3
NRXN3-213ENST00000556496 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.95□□□□□ -1.3
NRXN3-213ENST00000556496 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.95□□□□□ -1.3
NRXN3-213ENST00000556496 COX7BP24311 80 aa6.95□□□□□ -1.3
NRXN3-213ENST00000556496 F8WDY8 70 aa6.94□□□□□ -1.3
NRXN3-213ENST00000556496 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
NRXN3-213ENST00000556496 Q6JHZ5 121 aa6.94□□□□□ -1.3
NRXN3-213ENST00000556496 B5MCH6 92 aa6.93□□□□□ -1.3
NRXN3-213ENST00000556496 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
NRXN3-213ENST00000556496 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.92□□□□□ -1.3
NRXN3-213ENST00000556496 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.92□□□□□ -1.3
NRXN3-213ENST00000556496 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
NRXN3-213ENST00000556496 CASC10Q5T4H9 136 aa6.91□□□□□ -1.3
NRXN3-213ENST00000556496 Q6ZQT0 140 aa6.91□□□□□ -1.3
NRXN3-213ENST00000556496 USP17L23D6RBM5 183 aa6.91□□□□□ -1.3
NRXN3-213ENST00000556496 H3BQ85 93 aa6.91□□□□□ -1.3
NRXN3-213ENST00000556496 DSCR8Q96T75 97 aa6.9□□□□□ -1.3
NRXN3-213ENST00000556496 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.9□□□□□ -1.31
NRXN3-213ENST00000556496 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.9□□□□□ -1.31
NRXN3-213ENST00000556496 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.89□□□□□ -1.31
NRXN3-213ENST00000556496 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.89□□□□□ -1.31
NRXN3-213ENST00000556496 A0A087WVE0 104 aa6.89□□□□□ -1.31
NRXN3-213ENST00000556496 GHRHP01286 108 aa6.88□□□□□ -1.31
NRXN3-213ENST00000556496 RMI2Q96E14 147 aa6.88□□□□□ -1.31
NRXN3-213ENST00000556496 UBL5Q9BZL1 73 aa6.88□□□□□ -1.31
NRXN3-213ENST00000556496 M0R2N4 97 aa6.88□□□□□ -1.31
NRXN3-213ENST00000556496 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.88□□□□□ -1.31
NRXN3-213ENST00000556496 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
NRXN3-213ENST00000556496 C7orf33Q8WU49 177 aa6.88□□□□□ -1.31
NRXN3-213ENST00000556496 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
NRXN3-213ENST00000556496 UPK3BQ9BT76 320 aa6.86□□□□□ -1.31
NRXN3-213ENST00000556496 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.86□□□□□ -1.31
NRXN3-213ENST00000556496 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.86□□□□□ -1.31
NRXN3-213ENST00000556496 PDE6GP18545 87 aa6.86□□□□□ -1.31
NRXN3-213ENST00000556496 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.86□□□□□ -1.31
NRXN3-213ENST00000556496 FAM168BA1KXE4 195 aa6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.5 ms