RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552295.5

BEST3-211, Transcript of bestrophin 3, humanhuman

TSL 5

Gene BEST3, Length 720 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3-211ENST00000552295 Q6ZRU5 148 aa5.22□□□□□ -1.57
BEST3-211ENST00000552295 Q8N814 137 aa5.22□□□□□ -1.57
BEST3-211ENST00000552295 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa5.21□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 C2orf91Q6ZV80 131 aa5.21□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 CARD19Q96LW7 228 aa5.21□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.21□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.21□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 LITAFQ99732 161 aa5.2□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 ERG28Q9UKR5 140 aa5.2□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 DNAH10Q8IVF4 4471 aa5.19□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 FRAS1Q86XX4 4008 aa5.19□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 GAGE10A6NGK3 116 aa5.19□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 TIMM17BO60830 172 aa5.19□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 SMIM13P0DJ93 91 aa5.19□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 DDTP30046 118 aa5.19□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.19□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.19□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 HIGD1BQ9P298 99 aa5.19□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 RYR2Q92736 4967 aa5.18□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 SACSQ9NZJ4 4579 aa5.18□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 A0A0U1RRA0 63 aa5.18□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 PFN2P35080 140 aa5.18□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 COX17Q14061 63 aa5.18□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.18□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 LINC00587B1AMM8 73 aa5.17□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 TMEM238C9JI98 176 aa5.17□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.17□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 LINC00158P58513 81 aa5.17□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa5.17□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 DAND5Q8N907 189 aa5.17□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 C9orf163Q8N9P6 203 aa5.17□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.17□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 SPANXCQ9NY87 97 aa5.17□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 A0A0A0MQY5 61 aa5.16□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.16□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.16□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 CTAG1AP78358 180 aa5.16□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.16□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 Q6ZRP5 223 aa5.16□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 HIST1H4GQ99525 98 aa5.16□□□□□ -1.58
BEST3-211ENST00000552295 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa5.15□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 BATFQ16520 125 aa5.15□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 LINC01620Q4KN68 170 aa5.15□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa5.15□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 Q6ZVH6 145 aa5.15□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.15□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 DNAH2Q9P225 4427 aa5.15□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 DNAH17Q9UFH2 4485 aa5.14□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa5.14□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 A0A1B0GVY2 172 aa5.14□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 M0R143 59 aa5.14□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 NPC2P61916 151 aa5.14□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 HSD52Q0P140 79 aa5.14□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 TAL2Q16559 108 aa5.14□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 SDIM1Q6ZPB5 146 aa5.14□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.14□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 A0A096LNI7 61 aa5.13□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.13□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 IFITM1P13164 125 aa5.13□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 GAGE2EQ4V326 116 aa5.13□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 MUSTN1Q8IVN3 82 aa5.13□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.13□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 COPS9Q8WXC6 57 aa5.13□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.13□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.13□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.13□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 C16orf90A8MZG2 172 aa5.12□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 GAGE2BQ13066 116 aa5.12□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 CEND1Q8N111 149 aa5.12□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 Q8NDZ9 215 aa5.12□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 PKIGQ9Y2B9 76 aa5.12□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 CHTF8P0CG12 524 aa5.11□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 FXYD2P54710 66 aa5.11□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa5.11□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.1□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 A4D1N5 150 aa5.1□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 PANO1I0J062 215 aa5.1□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.1□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 FAT2Q9NYQ8 4349 aa5.1□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 FAM168BA1KXE4 195 aa5.09□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 A6NDN8 102 aa5.09□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 NDUFC2O95298 119 aa5.09□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 VPREB1P12018 145 aa5.09□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.09□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 SPACA4Q8TDM5 124 aa5.09□□□□□ -1.59
BEST3-211ENST00000552295 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa5.09□□□□□ -1.6
BEST3-211ENST00000552295 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.08□□□□□ -1.6
BEST3-211ENST00000552295 IGKV2D-28P01615 120 aa5.08□□□□□ -1.6
BEST3-211ENST00000552295 KRTAP10-1P60331 282 aa5.08□□□□□ -1.6
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