RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 ERASQ7Z444 233 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-228ENST00000551473 AKAP14Q86UN6 197 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-228ENST00000551473 RAB14P61106 215 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-228ENST00000551473 M0R2T5 61 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-228ENST00000551473 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-228ENST00000551473 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-228ENST00000551473 ERG28Q9UKR5 140 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-228ENST00000551473 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-228ENST00000551473 PRYO14603 147 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-228ENST00000551473 PEA15Q15121 130 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-228ENST00000551473 LINC00483Q53H64 154 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-228ENST00000551473 SFTA2Q6UW10 78 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-228ENST00000551473 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CS-228ENST00000551473 MOBPQ13875 183 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-228ENST00000551473 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-228ENST00000551473 PCOTHQ58A44 107 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-228ENST00000551473 CST9LQ9H4G1 147 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-228ENST00000551473 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-228ENST00000551473 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-228ENST00000551473 PMVKQ15126 192 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-228ENST00000551473 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-228ENST00000551473 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-228ENST00000551473 C9JQL5 133 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-228ENST00000551473 S100A12P80511 92 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-228ENST00000551473 Q8NDZ9 215 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-228ENST00000551473 ADCYAP1P18509 176 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-228ENST00000551473 SPRR1AP35321 89 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-228ENST00000551473 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-228ENST00000551473 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CS-228ENST00000551473 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-228ENST00000551473 IGLC3P0DOY3 106 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-228ENST00000551473 LINC00158P58513 81 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-228ENST00000551473 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-228ENST00000551473 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-228ENST00000551473 MT-ND4LP03901 98 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-228ENST00000551473 LIMD2Q9BT23 127 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-228ENST00000551473 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-228ENST00000551473 ATP6V1G1O75348 118 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-228ENST00000551473 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CS-228ENST00000551473 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-228ENST00000551473 LINC01546A6NGU7 62 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-228ENST00000551473 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-228ENST00000551473 C9orf92A6NGG3 77 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-228ENST00000551473 B5MCH6 92 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-228ENST00000551473 NCR3O14931 201 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-228ENST00000551473 NDUFA6P56556 154 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-228ENST00000551473 FA2HQ7L5A8 372 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-228ENST00000551473 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-228ENST00000551473 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-228ENST00000551473 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-228ENST00000551473 A0A0U1RRA0 63 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-228ENST00000551473 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-228ENST00000551473 LINC00587B1AMM8 73 aa6.4□□□□□ -1.38
CS-228ENST00000551473 ERC2-IT1O76042 136 aa6.4□□□□□ -1.38
CS-228ENST00000551473 IGLV6-57P01721 117 aa6.4□□□□□ -1.38
CS-228ENST00000551473 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CS-228ENST00000551473 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-228ENST00000551473 Q6ZRX8 168 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-228ENST00000551473 CFC1P0CG37 223 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-228ENST00000551473 SMIM13P0DJ93 91 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-228ENST00000551473 Q9BRP9 147 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-228ENST00000551473 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-228ENST00000551473 C5orf52A6NGY3 159 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-228ENST00000551473 C11orf86A6NJI1 115 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-228ENST00000551473 DDTP30046 118 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-228ENST00000551473 HERV-K104P63124 156 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-228ENST00000551473 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-228ENST00000551473 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-228ENST00000551473 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CS-228ENST00000551473 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-228ENST00000551473 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CS-228ENST00000551473 BAGE3Q86Y29 109 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-228ENST00000551473 COX19Q49B96 90 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-228ENST00000551473 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-228ENST00000551473 HBDP02042 147 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-228ENST00000551473 TMEM223A0PJW6 202 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-228ENST00000551473 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-228ENST00000551473 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CS-228ENST00000551473 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CS-228ENST00000551473 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-228ENST00000551473 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-228ENST00000551473 A0A096LNJ9 63 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-228ENST00000551473 S100PP25815 95 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-228ENST00000551473 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CS-228ENST00000551473 CD164Q04900 197 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-228ENST00000551473 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-228ENST00000551473 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-228ENST00000551473 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-228ENST00000551473 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-228ENST00000551473 SPRR1BP22528 89 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-228ENST00000551473 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-228ENST00000551473 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-228ENST00000551473 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-228ENST00000551473 LINC00614P0C842 121 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-228ENST00000551473 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-228ENST00000551473 Q6Q795 121 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-228ENST00000551473 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CS-228ENST00000551473 Q5XG85 94 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-228ENST00000551473 COMMD7Q86VX2 200 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-228ENST00000551473 SEC11CQ9BY50 192 aa6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.8 ms