RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 Q8IZM0 81 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-217ENST00000550044 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-217ENST00000550044 NUPR1O60356 82 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-217ENST00000550044 IGLC3P0DOY3 106 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-217ENST00000550044 Q6ZRP5 223 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-217ENST00000550044 C7orf33Q8WU49 177 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-217ENST00000550044 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-217ENST00000550044 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.01□□□□□ -1.45
CS-217ENST00000550044 SERF1AO75920 110 aa6.01□□□□□ -1.45
CS-217ENST00000550044 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.01□□□□□ -1.45
CS-217ENST00000550044 COX7B2Q8TF08 81 aa6.01□□□□□ -1.45
CS-217ENST00000550044 FAM168BA1KXE4 195 aa6□□□□□ -1.45
CS-217ENST00000550044 H3BRM9 83 aa6□□□□□ -1.45
CS-217ENST00000550044 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CS-217ENST00000550044 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6□□□□□ -1.45
CS-217ENST00000550044 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CS-217ENST00000550044 C11orf86A6NJI1 115 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-217ENST00000550044 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-217ENST00000550044 F8VRH5 84 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-217ENST00000550044 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CS-217ENST00000550044 LEPROTL1O95214 131 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-217ENST00000550044 FABP4P15090 132 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-217ENST00000550044 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
CS-217ENST00000550044 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa5.97□□□□□ -1.45
CS-217ENST00000550044 CXCL5P42830 114 aa5.97□□□□□ -1.45
CS-217ENST00000550044 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
CS-217ENST00000550044 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.97□□□□□ -1.45
CS-217ENST00000550044 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 HIST1H2BKO60814 126 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 HIST1H2BJP06899 126 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 HIST1H2BOP23527 126 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 HIST1H2BBP33778 126 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 HIST1H2BDP58876 126 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 HIST1H2BCP62807 126 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 HIST2H2BEQ16778 126 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 HIST1H2BHQ93079 126 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 HIST1H2BNQ99877 126 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 HIST1H2BMQ99879 126 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.95□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 TMEM223A0PJW6 202 aa5.94□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 PFN2P35080 140 aa5.94□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.94□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.94□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.94□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 PCP4L1A6NKN8 68 aa5.93□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 M0QXV9 152 aa5.93□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 PMCHL2Q9BQD1 86 aa5.93□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 C1orf137Q5JT78 98 aa5.92□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 C22orf24Q9Y442 160 aa5.92□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 S100A1P23297 94 aa5.91□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 UBE2BP63146 152 aa5.91□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.91□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa5.91□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 ERG28Q9UKR5 140 aa5.91□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 LPAP08519 4548 aa5.91□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.46
CS-217ENST00000550044 MUC2Q02817 5179 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 DPM2O94777 84 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 IGKCP01834 107 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 LINC00158P58513 81 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 IGLV7-43P04211 117 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 PLNP26678 52 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 COX17Q14061 63 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 RPL37AP8A6NKH3 93 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 LEPROTO15243 131 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 SMIM13P0DJ93 91 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 SFTA2Q6UW10 78 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 LINC00167Q96N53 147 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 HERVK_113P61574 105 aa5.86□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.86□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.86□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.86□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.86□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 J3QQQ9 107 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 C3orf79P0CE67 100 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 KRTDAPP60985 99 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 LINC01545Q5VT33 79 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 REG3GQ6UW15 175 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 Q8NDZ9 215 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-217ENST00000550044 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-217ENST00000550044 IGKV2D-28P01615 120 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-217ENST00000550044 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CS-217ENST00000550044 LINC01600Q96MT4 127 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-217ENST00000550044 LINC00587B1AMM8 73 aa5.82□□□□□ -1.48
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