RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536509.5

LMO3-214, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 550 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-214ENST00000536509 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
LMO3-214ENST00000536509 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.39□□□□□ -1.39
LMO3-214ENST00000536509 TMEM126AQ9H061 195 aa6.39□□□□□ -1.39
LMO3-214ENST00000536509 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.39□□□□□ -1.39
LMO3-214ENST00000536509 SPINK8P0C7L1 97 aa6.38□□□□□ -1.39
LMO3-214ENST00000536509 PRLHP81277 87 aa6.38□□□□□ -1.39
LMO3-214ENST00000536509 PMVKQ15126 192 aa6.38□□□□□ -1.39
LMO3-214ENST00000536509 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-214ENST00000536509 LINC01546A6NGU7 62 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-214ENST00000536509 ADCYAP1P18509 176 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-214ENST00000536509 SFTA2Q6UW10 78 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-214ENST00000536509 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-214ENST00000536509 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-214ENST00000536509 VPREB1P12018 145 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-214ENST00000536509 PFN2P35080 140 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-214ENST00000536509 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-214ENST00000536509 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-214ENST00000536509 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-214ENST00000536509 M0R378 163 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-214ENST00000536509 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-214ENST00000536509 ERG28Q9UKR5 140 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-214ENST00000536509 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
LMO3-214ENST00000536509 TMEM238C9JI98 176 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-214ENST00000536509 SCO1O75880 301 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-214ENST00000536509 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-214ENST00000536509 IGLC3P0DOY3 106 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-214ENST00000536509 RAB14P61106 215 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-214ENST00000536509 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-214ENST00000536509 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-214ENST00000536509 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-214ENST00000536509 COX19Q49B96 90 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-214ENST00000536509 FA2HQ7L5A8 372 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-214ENST00000536509 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-214ENST00000536509 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
LMO3-214ENST00000536509 SPRR4Q96PI1 79 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-214ENST00000536509 SPINK1P00995 79 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-214ENST00000536509 S100PP25815 95 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-214ENST00000536509 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-214ENST00000536509 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-214ENST00000536509 MUC17Q685J3 4493 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-214ENST00000536509 A0A1B0GVG6 124 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-214ENST00000536509 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
LMO3-214ENST00000536509 NDUFA6P56556 154 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-214ENST00000536509 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-214ENST00000536509 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-214ENST00000536509 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-214ENST00000536509 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
LMO3-214ENST00000536509 LINC00158P58513 81 aa6.27□□□□□ -1.41
LMO3-214ENST00000536509 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
LMO3-214ENST00000536509 Q8NBF4 154 aa6.27□□□□□ -1.41
LMO3-214ENST00000536509 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.26□□□□□ -1.41
LMO3-214ENST00000536509 UQCC3Q6UW78 93 aa6.26□□□□□ -1.41
LMO3-214ENST00000536509 Q8NDZ9 215 aa6.26□□□□□ -1.41
LMO3-214ENST00000536509 ATP6V1G1O75348 118 aa6.25□□□□□ -1.41
LMO3-214ENST00000536509 HBDP02042 147 aa6.25□□□□□ -1.41
LMO3-214ENST00000536509 S100A12P80511 92 aa6.25□□□□□ -1.41
LMO3-214ENST00000536509 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.25□□□□□ -1.41
LMO3-214ENST00000536509 DAND5Q8N907 189 aa6.25□□□□□ -1.41
LMO3-214ENST00000536509 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.25□□□□□ -1.41
LMO3-214ENST00000536509 C11orf86A6NJI1 115 aa6.24□□□□□ -1.41
LMO3-214ENST00000536509 LINC00614P0C842 121 aa6.24□□□□□ -1.41
LMO3-214ENST00000536509 SPRR1AP35321 89 aa6.24□□□□□ -1.41
LMO3-214ENST00000536509 LINC00483Q53H64 154 aa6.24□□□□□ -1.41
LMO3-214ENST00000536509 BAGE3Q86Y29 109 aa6.24□□□□□ -1.41
LMO3-214ENST00000536509 SEC11CQ9BY50 192 aa6.24□□□□□ -1.41
LMO3-214ENST00000536509 A0A096LNJ9 63 aa6.23□□□□□ -1.41
LMO3-214ENST00000536509 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.23□□□□□ -1.41
LMO3-214ENST00000536509 TMEM218A2RU14 115 aa6.23□□□□□ -1.41
LMO3-214ENST00000536509 LINC00587B1AMM8 73 aa6.23□□□□□ -1.41
LMO3-214ENST00000536509 CLLU1Q5K131 121 aa6.23□□□□□ -1.41
LMO3-214ENST00000536509 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.23□□□□□ -1.41
LMO3-214ENST00000536509 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.23□□□□□ -1.41
LMO3-214ENST00000536509 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.22□□□□□ -1.41
LMO3-214ENST00000536509 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
LMO3-214ENST00000536509 SLC25A20O43772 301 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-214ENST00000536509 HERV-K104P63124 156 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-214ENST00000536509 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-214ENST00000536509 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-214ENST00000536509 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-214ENST00000536509 Q8N377 158 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-214ENST00000536509 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-214ENST00000536509 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
LMO3-214ENST00000536509 A0A0U1RRA0 63 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-214ENST00000536509 TMEM223A0PJW6 202 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-214ENST00000536509 NCR3O14931 201 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-214ENST00000536509 SMIM13P0DJ93 91 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-214ENST00000536509 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-214ENST00000536509 LCE1DQ5T752 114 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-214ENST00000536509 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-214ENST00000536509 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-214ENST00000536509 A0A0A0MQY5 61 aa6.18□□□□□ -1.42
LMO3-214ENST00000536509 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.18□□□□□ -1.42
LMO3-214ENST00000536509 MOBPQ13875 183 aa6.18□□□□□ -1.42
LMO3-214ENST00000536509 RHEBQ15382 184 aa6.18□□□□□ -1.42
LMO3-214ENST00000536509 PMCHL1Q16048 86 aa6.18□□□□□ -1.42
LMO3-214ENST00000536509 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.18□□□□□ -1.42
LMO3-214ENST00000536509 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.18□□□□□ -1.42
LMO3-214ENST00000536509 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.18□□□□□ -1.42
LMO3-214ENST00000536509 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.18□□□□□ -1.42
LMO3-214ENST00000536509 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms