RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534909.2

OTX2-AS1-201, Transcript of OTX2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene OTX2-AS1, Length 2,428 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2-AS1-201ENST00000534909 H0Y9P7 68 aa4.82□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 IGHV3-23P01764 117 aa4.82□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 IGKV4-1P06312 121 aa4.82□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa4.81□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa4.81□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa4.81□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 J3QKU1 62 aa4.81□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 CSMD1Q96PZ7 3565 aa4.8□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa4.8□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa4.8□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 IGKV3-15P01624 115 aa4.8□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 GAFA1Q96PS6 74 aa4.8□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 FLNCQ14315 2725 aa4.8□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 USF3Q68DE3 2245 aa4.8□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 CREBBPQ92793 2442 aa4.8□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.8□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa4.8□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 A0A087WW49 117 aa4.8□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 C7orf33Q8WU49 177 aa4.8□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 COL6A6A6NMZ7 2263 aa4.79□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 ITPR3Q14573 2671 aa4.79□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.79□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 H3BPC8 53 aa4.79□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 IGHV1-46P01743 117 aa4.79□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 DNAH10OSP0CZ25 163 aa4.79□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 SMIM29Q86T20 159 aa4.79□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.78□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.78□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.78□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 PRR34Q9NV39 138 aa4.78□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 TRGV2A0A075B6R0 118 aa4.78□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.78□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 LRRK2Q5S007 2527 aa4.78□□□□□ -1.64
OTX2-AS1-201ENST00000534909 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa4.77□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 ERHP84090 104 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.77□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.77□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa4.77□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 A6NDX4 124 aa4.77□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 Q8N9W7 124 aa4.77□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa4.76□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa4.76□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa4.76□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 COA5Q86WW8 74 aa4.76□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 DEFB113Q30KQ7 82 aa4.76□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 C1orf137Q5JT78 98 aa4.76□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 DEFB126Q9BYW3 111 aa4.76□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa4.76□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 NBASA2RRP1 2371 aa4.75□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 CADP27708 2225 aa4.75□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 RPL39P62891 51 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 IGKV3-20P01619 116 aa4.74□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 MGPP08493 103 aa4.74□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 DEFB112Q30KQ8 113 aa4.74□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.74□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.74□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 C2CD3Q4AC94 2353 aa4.74□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.74□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 FAM229AH3BQW9 127 aa4.74□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 POLQO75417 2590 aa4.73□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 FBN2P35556 2912 aa4.73□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 SLPIP03973 132 aa4.73□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 CCL18P55774 89 aa4.73□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 DEFB109BQ30KR1 87 aa4.73□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 IGFL4Q6B9Z1 124 aa4.73□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 LINC01006Q8NI28 216 aa4.73□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 CENPEQ02224 2701 aa4.73□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa4.73□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa4.73□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.73□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa4.73□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 DMAC1Q96GE9 116 aa4.73□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 ITPR2Q14571 2701 aa4.73□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 NDUFAF8A1L188 74 aa4.72□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 SPINK14Q6IE38 97 aa4.72□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 SPRR4Q96PI1 79 aa4.72□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.65
OTX2-AS1-201ENST00000534909 LRBAP50851 2863 aa4.71□□□□□ -1.66
OTX2-AS1-201ENST00000534909 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.71□□□□□ -1.66
OTX2-AS1-201ENST00000534909 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa4.71□□□□□ -1.66
OTX2-AS1-201ENST00000534909 A0A1B0GVX0 72 aa4.71□□□□□ -1.66
OTX2-AS1-201ENST00000534909 ODF3BA8MYP8 253 aa4.71□□□□□ -1.66
OTX2-AS1-201ENST00000534909 H3BRN7 92 aa4.71□□□□□ -1.66
OTX2-AS1-201ENST00000534909 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
OTX2-AS1-201ENST00000534909 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
OTX2-AS1-201ENST00000534909 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa4.71□□□□□ -1.66
OTX2-AS1-201ENST00000534909 IGKV2D-28P01615 120 aa4.71□□□□□ -1.66
OTX2-AS1-201ENST00000534909 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
OTX2-AS1-201ENST00000534909 UQCR11O14957 56 aa4.7□□□□□ -1.66
OTX2-AS1-201ENST00000534909 LINC00612Q8N6U2 182 aa4.7□□□□□ -1.66
OTX2-AS1-201ENST00000534909 CSMD2Q7Z408 3487 aa4.7□□□□□ -1.66
OTX2-AS1-201ENST00000534909 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms