RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533817.5

TSTA3-216, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-216ENST00000533817 SMIM13P0DJ93 91 aa9.13□□□□□ -0.95
TSTA3-216ENST00000533817 LINC00158P58513 81 aa9.13□□□□□ -0.95
TSTA3-216ENST00000533817 UBE2BP63146 152 aa9.13□□□□□ -0.95
TSTA3-216ENST00000533817 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
TSTA3-216ENST00000533817 NMUP48645 174 aa9.12□□□□□ -0.95
TSTA3-216ENST00000533817 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.12□□□□□ -0.95
TSTA3-216ENST00000533817 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
TSTA3-216ENST00000533817 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.12□□□□□ -0.95
TSTA3-216ENST00000533817 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
TSTA3-216ENST00000533817 Q8NDZ9 215 aa9.12□□□□□ -0.95
TSTA3-216ENST00000533817 HIST1H2BLQ99880 126 aa9.12□□□□□ -0.95
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TSTA3-216ENST00000533817 C1orf137Q5JT78 98 aa9.11□□□□□ -0.95
TSTA3-216ENST00000533817 C20orf202A1L168 122 aa9.1□□□□□ -0.95
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TSTA3-216ENST00000533817 LINC00167Q96N53 147 aa9.1□□□□□ -0.95
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TSTA3-216ENST00000533817 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa9.08□□□□□ -0.96
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TSTA3-216ENST00000533817 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
TSTA3-216ENST00000533817 GAGE10A6NGK3 116 aa9.07□□□□□ -0.96
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TSTA3-216ENST00000533817 RPL37AP8A6NKH3 93 aa9.06□□□□□ -0.96
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TSTA3-216ENST00000533817 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
TSTA3-216ENST00000533817 A0A0J9YXY3 114 aa9.05□□□□□ -0.96
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TSTA3-216ENST00000533817 ANKRD39Q53RE8 183 aa9.04□□□□□ -0.96
TSTA3-216ENST00000533817 ARL17AQ8IVW1 177 aa9.04□□□□□ -0.96
TSTA3-216ENST00000533817 TTTY13Q9BZ97 58 aa9.04□□□□□ -0.96
TSTA3-216ENST00000533817 J3QL48 77 aa9.03□□□□□ -0.96
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TSTA3-216ENST00000533817 IGKV2D-28P01615 120 aa9.02□□□□□ -0.97
TSTA3-216ENST00000533817 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.02□□□□□ -0.97
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TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.97□□□□□ -0.97
TSTA3-216ENST00000533817 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.97□□□□□ -0.97
TSTA3-216ENST00000533817 TMEM126AQ9H061 195 aa8.97□□□□□ -0.97
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TSTA3-216ENST00000533817 NPC2P61916 151 aa8.96□□□□□ -0.98
TSTA3-216ENST00000533817 PCP2Q8IVA1 136 aa8.96□□□□□ -0.98
TSTA3-216ENST00000533817 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
TSTA3-216ENST00000533817 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.95□□□□□ -0.98
TSTA3-216ENST00000533817 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.94□□□□□ -0.98
TSTA3-216ENST00000533817 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.94□□□□□ -0.98
TSTA3-216ENST00000533817 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
TSTA3-216ENST00000533817 PRYO14603 147 aa8.93□□□□□ -0.98
TSTA3-216ENST00000533817 SCGB1D1O95968 90 aa8.93□□□□□ -0.98
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.93□□□□□ -0.98
TSTA3-216ENST00000533817 UBE2AP49459 152 aa8.93□□□□□ -0.98
TSTA3-216ENST00000533817 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.92□□□□□ -0.98
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TSTA3-216ENST00000533817 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.92□□□□□ -0.98
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TSTA3-216ENST00000533817 PRLHP81277 87 aa8.91□□□□□ -0.98
TSTA3-216ENST00000533817 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.91□□□□□ -0.98
TSTA3-216ENST00000533817 IGLV6-57P01721 117 aa8.9□□□□□ -0.98
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TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
TSTA3-216ENST00000533817 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.89□□□□□ -0.99
TSTA3-216ENST00000533817 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
TSTA3-216ENST00000533817 Q6ZVH6 145 aa8.87□□□□□ -0.99
TSTA3-216ENST00000533817 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.87□□□□□ -0.99
TSTA3-216ENST00000533817 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.87□□□□□ -0.99
TSTA3-216ENST00000533817 IFITM1P13164 125 aa8.86□□□□□ -0.99
TSTA3-216ENST00000533817 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
TSTA3-216ENST00000533817 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.86□□□□□ -0.99
TSTA3-216ENST00000533817 S100A12P80511 92 aa8.85□□□□□ -0.99
TSTA3-216ENST00000533817 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.84□□□□□ -0.99
TSTA3-216ENST00000533817 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.84□□□□□ -0.99
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