RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527744.5

PUF60-211, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 2

Gene PUF60, Length 1,007 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-211ENST00000527744 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PUF60-211ENST00000527744 SPINK1P00995 79 aa7.12□□□□□ -1.27
PUF60-211ENST00000527744 Q8NBF4 154 aa7.12□□□□□ -1.27
PUF60-211ENST00000527744 VCX2Q9H322 139 aa7.12□□□□□ -1.27
PUF60-211ENST00000527744 M0R378 163 aa7.11□□□□□ -1.27
PUF60-211ENST00000527744 HERVK_113P63121 156 aa7.11□□□□□ -1.27
PUF60-211ENST00000527744 SPRR4Q96PI1 79 aa7.11□□□□□ -1.27
PUF60-211ENST00000527744 NPSP0C0P6 89 aa7.09□□□□□ -1.27
PUF60-211ENST00000527744 LINC00614P0C842 121 aa7.09□□□□□ -1.27
PUF60-211ENST00000527744 SEC11AP67812 179 aa7.09□□□□□ -1.27
PUF60-211ENST00000527744 YPEL4Q96NS1 127 aa7.09□□□□□ -1.27
PUF60-211ENST00000527744 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.09□□□□□ -1.27
PUF60-211ENST00000527744 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.09□□□□□ -1.27
PUF60-211ENST00000527744 IGIPA6NJ69 53 aa7.08□□□□□ -1.28
PUF60-211ENST00000527744 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.08□□□□□ -1.28
PUF60-211ENST00000527744 BAGE3Q86Y29 109 aa7.08□□□□□ -1.28
PUF60-211ENST00000527744 COX7B2Q8TF08 81 aa7.08□□□□□ -1.28
PUF60-211ENST00000527744 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.08□□□□□ -1.28
PUF60-211ENST00000527744 TRGC2P03986 189 aa7.07□□□□□ -1.28
PUF60-211ENST00000527744 VPREB1P12018 145 aa7.07□□□□□ -1.28
PUF60-211ENST00000527744 Q8N377 158 aa7.07□□□□□ -1.28
PUF60-211ENST00000527744 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PUF60-211ENST00000527744 SSPOA2VEC9 5147 aa7.06□□□□□ -1.28
PUF60-211ENST00000527744 COLCA2A8K830 154 aa7.06□□□□□ -1.28
PUF60-211ENST00000527744 ATP6V1G1O75348 118 aa7.06□□□□□ -1.28
PUF60-211ENST00000527744 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.06□□□□□ -1.28
PUF60-211ENST00000527744 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.06□□□□□ -1.28
PUF60-211ENST00000527744 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.06□□□□□ -1.28
PUF60-211ENST00000527744 TOMM6Q96B49 74 aa7.06□□□□□ -1.28
PUF60-211ENST00000527744 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PUF60-211ENST00000527744 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PUF60-211ENST00000527744 ERASQ7Z444 233 aa7.05□□□□□ -1.28
PUF60-211ENST00000527744 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.04□□□□□ -1.28
PUF60-211ENST00000527744 LINC01546A6NGU7 62 aa7.04□□□□□ -1.28
PUF60-211ENST00000527744 HSBP1O75506 76 aa7.04□□□□□ -1.28
PUF60-211ENST00000527744 ATP5LO75964 103 aa7.04□□□□□ -1.28
PUF60-211ENST00000527744 HBDP02042 147 aa7.04□□□□□ -1.28
PUF60-211ENST00000527744 TIMM17AQ99595 171 aa7.04□□□□□ -1.28
PUF60-211ENST00000527744 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PUF60-211ENST00000527744 M0R2T5 61 aa7.03□□□□□ -1.28
PUF60-211ENST00000527744 PCOTHQ58A44 107 aa7.03□□□□□ -1.28
PUF60-211ENST00000527744 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.02□□□□□ -1.29
PUF60-211ENST00000527744 SLC25A20O43772 301 aa7.02□□□□□ -1.29
PUF60-211ENST00000527744 NDUFA6P56556 154 aa7.02□□□□□ -1.29
PUF60-211ENST00000527744 Q8NDZ9 215 aa7.02□□□□□ -1.29
PUF60-211ENST00000527744 USH2AO75445 5202 aa7.02□□□□□ -1.29
PUF60-211ENST00000527744 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PUF60-211ENST00000527744 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.01□□□□□ -1.29
PUF60-211ENST00000527744 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7□□□□□ -1.29
PUF60-211ENST00000527744 PFN2P35080 140 aa7□□□□□ -1.29
PUF60-211ENST00000527744 SPINK8P0C7L1 97 aa6.99□□□□□ -1.29
PUF60-211ENST00000527744 PMVKQ15126 192 aa6.99□□□□□ -1.29
PUF60-211ENST00000527744 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.99□□□□□ -1.29
PUF60-211ENST00000527744 PMCHL1Q16048 86 aa6.98□□□□□ -1.29
PUF60-211ENST00000527744 LINC00483Q53H64 154 aa6.98□□□□□ -1.29
PUF60-211ENST00000527744 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.97□□□□□ -1.29
PUF60-211ENST00000527744 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.97□□□□□ -1.29
PUF60-211ENST00000527744 CST9LQ9H4G1 147 aa6.97□□□□□ -1.29
PUF60-211ENST00000527744 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
PUF60-211ENST00000527744 H3BRM9 83 aa6.96□□□□□ -1.3
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PUF60-211ENST00000527744 LEPROTL1O95214 131 aa6.96□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 MOBPQ13875 183 aa6.96□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.96□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.95□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 ERG28Q9UKR5 140 aa6.95□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.94□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 HIST1H2BKO60814 126 aa6.94□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 HIST1H2BJP06899 126 aa6.94□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 HIST1H2BOP23527 126 aa6.94□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 HIST1H2BBP33778 126 aa6.94□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 HIST1H2BDP58876 126 aa6.94□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 HIST1H2BCP62807 126 aa6.94□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 COX17Q14061 63 aa6.94□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.94□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.94□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.94□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.94□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.94□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 S100A6P06703 90 aa6.93□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 FABP4P15090 132 aa6.93□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 SPRR1AP35321 89 aa6.93□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.93□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 A0A096LNJ9 63 aa6.92□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.92□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 H0Y8G0 127 aa6.92□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.91□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 PRYO14603 147 aa6.91□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.91□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.91□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 S100A2P29034 98 aa6.9□□□□□ -1.3
PUF60-211ENST00000527744 C9orf92A6NGG3 77 aa6.89□□□□□ -1.31
PUF60-211ENST00000527744 IGLC3P0DOY3 106 aa6.89□□□□□ -1.31
PUF60-211ENST00000527744 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PUF60-211ENST00000527744 PLNP26678 52 aa6.88□□□□□ -1.31
PUF60-211ENST00000527744 AKR1D1P51857 326 aa6.88□□□□□ -1.31
PUF60-211ENST00000527744 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
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