RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521962.1

HACE1-211, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 4

Gene HACE1, Length 561 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-211ENST00000521962 HIST3H2BBQ8N257 126 aa10.15□□□□□ -0.78
HACE1-211ENST00000521962 Q8NDZ9 215 aa10.15□□□□□ -0.78
HACE1-211ENST00000521962 PLEKHB2Q96CS7 222 aa10.15□□□□□ -0.78
HACE1-211ENST00000521962 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa10.14□□□□□ -0.79
HACE1-211ENST00000521962 J3QQQ9 107 aa10.14□□□□□ -0.79
HACE1-211ENST00000521962 HERVK_113P61574 105 aa10.14□□□□□ -0.79
HACE1-211ENST00000521962 TP73-AS1Q9UF72 201 aa10.14□□□□□ -0.79
HACE1-211ENST00000521962 A0A0U1RRA0 63 aa10.13□□□□□ -0.79
HACE1-211ENST00000521962 E9PLD3 99 aa10.13□□□□□ -0.79
HACE1-211ENST00000521962 SMIM13P0DJ93 91 aa10.13□□□□□ -0.79
HACE1-211ENST00000521962 HERV-K104P63124 156 aa10.13□□□□□ -0.79
HACE1-211ENST00000521962 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa10.12□□□□□ -0.79
HACE1-211ENST00000521962 OXTP01178 125 aa10.12□□□□□ -0.79
HACE1-211ENST00000521962 VPREB1P12018 145 aa10.12□□□□□ -0.79
HACE1-211ENST00000521962 LINC00158P58513 81 aa10.12□□□□□ -0.79
HACE1-211ENST00000521962 UBE2BP63146 152 aa10.12□□□□□ -0.79
HACE1-211ENST00000521962 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP10.12□□□□□ -0.79
HACE1-211ENST00000521962 C1orf137Q5JT78 98 aa10.12□□□□□ -0.79
HACE1-211ENST00000521962 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
HACE1-211ENST00000521962 HIST1H2BLQ99880 126 aa10.12□□□□□ -0.79
HACE1-211ENST00000521962 RNF213Q63HN8 5207 aa10.11□□□□□ -0.79
HACE1-211ENST00000521962 MEIG1Q5JSS6 88 aa10.11□□□□□ -0.79
HACE1-211ENST00000521962 TNXBP22105 4242 aa10.1□□□□□ -0.79
HACE1-211ENST00000521962 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
HACE1-211ENST00000521962 NMUP48645 174 aa10.09□□□□□ -0.79
HACE1-211ENST00000521962 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa10.09□□□□□ -0.79
HACE1-211ENST00000521962 LINC00167Q96N53 147 aa10.09□□□□□ -0.79
HACE1-211ENST00000521962 LRP2P98164 4655 aa10.08□□□□□ -0.8
HACE1-211ENST00000521962 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa10.08□□□□□ -0.8
HACE1-211ENST00000521962 GAGE10A6NGK3 116 aa10.08□□□□□ -0.8
HACE1-211ENST00000521962 IGLV7-43P04211 117 aa10.08□□□□□ -0.8
HACE1-211ENST00000521962 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
HACE1-211ENST00000521962 SPINK6Q6UWN8 80 aa10.07□□□□□ -0.8
HACE1-211ENST00000521962 NKAPP1Q8N9T2 125 aa10.07□□□□□ -0.8
HACE1-211ENST00000521962 RPL37AP8A6NKH3 93 aa10.06□□□□□ -0.8
HACE1-211ENST00000521962 S100A6P06703 90 aa10.06□□□□□ -0.8
HACE1-211ENST00000521962 ATOH7Q8N100 152 aa10.06□□□□□ -0.8
HACE1-211ENST00000521962 DAND5Q8N907 189 aa10.06□□□□□ -0.8
HACE1-211ENST00000521962 TTTY13Q9BZ97 58 aa10.06□□□□□ -0.8
HACE1-211ENST00000521962 C20orf202A1L168 122 aa10.05□□□□□ -0.8
HACE1-211ENST00000521962 S100A2P29034 98 aa10.05□□□□□ -0.8
HACE1-211ENST00000521962 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
HACE1-211ENST00000521962 A0A0J9YXY3 114 aa10.04□□□□□ -0.8
HACE1-211ENST00000521962 C5orf52A6NGY3 159 aa10.04□□□□□ -0.8
HACE1-211ENST00000521962 A6NJY4 79 aa10.04□□□□□ -0.8
HACE1-211ENST00000521962 ANKRD39Q53RE8 183 aa10.04□□□□□ -0.8
HACE1-211ENST00000521962 LINC00587B1AMM8 73 aa10.03□□□□□ -0.8
HACE1-211ENST00000521962 MT1HL1P0DM35 61 aa10.03□□□□□ -0.8
HACE1-211ENST00000521962 RPL24P83731 157 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
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HACE1-211ENST00000521962 IGKV2D-28P01615 120 aa10.02□□□□□ -0.81
HACE1-211ENST00000521962 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa10.02□□□□□ -0.81
HACE1-211ENST00000521962 BOD1L2Q8IYS8 172 aa10.02□□□□□ -0.81
HACE1-211ENST00000521962 LITAFQ99732 161 aa10.02□□□□□ -0.81
HACE1-211ENST00000521962 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa10.01□□□□□ -0.81
HACE1-211ENST00000521962 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa10.01□□□□□ -0.81
HACE1-211ENST00000521962 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
HACE1-211ENST00000521962 ARL17AQ8IVW1 177 aa10.01□□□□□ -0.81
HACE1-211ENST00000521962 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa10□□□□□ -0.81
HACE1-211ENST00000521962 ZNF815PA8K554 130 aa9.99□□□□□ -0.81
HACE1-211ENST00000521962 H0Y9J4 135 aa9.99□□□□□ -0.81
HACE1-211ENST00000521962 BCE1O60756 84 aa9.99□□□□□ -0.81
HACE1-211ENST00000521962 TMEM238C9JI98 176 aa9.98□□□□□ -0.81
HACE1-211ENST00000521962 NCR3O14931 201 aa9.98□□□□□ -0.81
HACE1-211ENST00000521962 LINC01600Q96MT4 127 aa9.98□□□□□ -0.81
HACE1-211ENST00000521962 M0R378 163 aa9.97□□□□□ -0.81
HACE1-211ENST00000521962 ZNF861PO60384 105 aa9.97□□□□□ -0.81
HACE1-211ENST00000521962 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa9.97□□□□□ -0.81
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HACE1-211ENST00000521962 TIMM17BO60830 172 aa9.96□□□□□ -0.82
HACE1-211ENST00000521962 AKR1D1P51857 326 aa9.96□□□□□ -0.82
HACE1-211ENST00000521962 NPC2P61916 151 aa9.96□□□□□ -0.82
HACE1-211ENST00000521962 REG3GQ6UW15 175 aa9.96□□□□□ -0.82
HACE1-211ENST00000521962 TMEM126AQ9H061 195 aa9.96□□□□□ -0.82
HACE1-211ENST00000521962 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa9.95□□□□□ -0.82
HACE1-211ENST00000521962 PCP2Q8IVA1 136 aa9.95□□□□□ -0.82
HACE1-211ENST00000521962 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
HACE1-211ENST00000521962 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa9.92□□□□□ -0.82
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HACE1-211ENST00000521962 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.92□□□□□ -0.82
HACE1-211ENST00000521962 MIEN1Q9BRT3 115 aa9.92□□□□□ -0.82
HACE1-211ENST00000521962 NDUFC2O95298 119 aa9.91□□□□□ -0.82
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HACE1-211ENST00000521962 KRTAP10-8P60410 259 aa9.91□□□□□ -0.82
HACE1-211ENST00000521962 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
HACE1-211ENST00000521962 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.9□□□□□ -0.82
HACE1-211ENST00000521962 PRYO14603 147 aa9.89□□□□□ -0.83
HACE1-211ENST00000521962 SPRR1AP35321 89 aa9.89□□□□□ -0.83
HACE1-211ENST00000521962 UBE2AP49459 152 aa9.89□□□□□ -0.83
HACE1-211ENST00000521962 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa9.89□□□□□ -0.83
HACE1-211ENST00000521962 KCNQ1DNQ9H478 68 aa9.89□□□□□ -0.83
HACE1-211ENST00000521962 SCGB1D1O95968 90 aa9.88□□□□□ -0.83
HACE1-211ENST00000521962 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.88□□□□□ -0.83
HACE1-211ENST00000521962 SPANXDQ9BXN6 97 aa9.88□□□□□ -0.83
HACE1-211ENST00000521962 SPANXCQ9NY87 97 aa9.88□□□□□ -0.83
HACE1-211ENST00000521962 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
HACE1-211ENST00000521962 IGLV6-57P01721 117 aa9.87□□□□□ -0.83
HACE1-211ENST00000521962 DDTP30046 118 aa9.86□□□□□ -0.83
HACE1-211ENST00000521962 PRR26Q8N8Z3 221 aa9.86□□□□□ -0.83
HACE1-211ENST00000521962 HSBP1L1C9JCN9 74 aa9.85□□□□□ -0.83
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