RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520548.1

RNF145-208, Transcript of ring finger protein 145, human

TSL 4

Gene RNF145, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF145-208	ENST00000520548	NMU	P48645	174 aa		5	□□□□□ -1.61
RNF145-208	ENST00000520548	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RNF145-208	ENST00000520548	GAGE2E	Q4V326	116 aa		5	□□□□□ -1.61
RNF145-208	ENST00000520548	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		5	□□□□□ -1.61
RNF145-208	ENST00000520548	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RNF145-208	ENST00000520548	NUPR1	O60356	82 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF145-208	ENST00000520548	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF145-208	ENST00000520548	KRTDAP	P60985	99 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF145-208	ENST00000520548	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RNF145-208	ENST00000520548	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RNF145-208	ENST00000520548	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF145-208	ENST00000520548	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF145-208	ENST00000520548	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF145-208	ENST00000520548	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF145-208	ENST00000520548	LEPROT	O15243	131 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF145-208	ENST00000520548	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RNF145-208	ENST00000520548	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RNF145-208	ENST00000520548		Q6ZRP5	223 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF145-208	ENST00000520548	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RNF145-208	ENST00000520548	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF145-208	ENST00000520548	LINC00158	P58513	81 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF145-208	ENST00000520548	UBE2B	P63146	152 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF145-208	ENST00000520548	S100A12	P80511	92 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF145-208	ENST00000520548	LINC01545	Q5VT33	79 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF145-208	ENST00000520548	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF145-208	ENST00000520548	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF145-208	ENST00000520548	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF145-208	ENST00000520548		E9PLD3	99 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548		J3QQQ9	107 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548		M0QXV9	152 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	C3orf79	P0CE67	100 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	PFN2	P35080	140 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	PANO1	I0J062	215 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548		A0A1W2PNN7	141 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	OXT	P01178	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	TIMM17B	O60830	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	C22orf24	Q9Y442	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF145-208	ENST00000520548	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	C1orf137	Q5JT78	98 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548		A0A0U1RRA0	63 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548		M0R378	163 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548		Q6ZVH6	145 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548		A0A0J9YXY3	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	NDUFC2	O95298	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	VPREB1	P12018	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	IFITM1	P13164	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	ATOH7	Q8N100	152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	BCE1	O60756	84 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	UBE2A	P49459	152 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF145-208	ENST00000520548	PRY	O14603	147 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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