RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519068.2

MSC-AS1-205, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 569 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-205ENST00000519068 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.47□□□□□ -1.85
MSC-AS1-205ENST00000519068 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.47□□□□□ -1.85
MSC-AS1-205ENST00000519068 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
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MSC-AS1-205ENST00000519068 IGKV2-30P06310 120 aa3.46□□□□□ -1.86
MSC-AS1-205ENST00000519068 PFN2P35080 140 aa3.46□□□□□ -1.86
MSC-AS1-205ENST00000519068 CKS1BP61024 79 aa3.46□□□□□ -1.86
MSC-AS1-205ENST00000519068 HERVK_113P61574 105 aa3.46□□□□□ -1.86
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MSC-AS1-205ENST00000519068 C14orf177Q52M58 125 aa3.46□□□□□ -1.86
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MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa3.46□□□□□ -1.86
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MSC-AS1-205ENST00000519068 NKAPP1Q8N9T2 125 aa3.46□□□□□ -1.86
MSC-AS1-205ENST00000519068 CAMK2N2Q96S95 79 aa3.46□□□□□ -1.86
MSC-AS1-205ENST00000519068 DNAH5Q8TE73 4624 aa3.45□□□□□ -1.86
MSC-AS1-205ENST00000519068 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa3.45□□□□□ -1.86
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MSC-AS1-205ENST00000519068 PCP2Q8IVA1 136 aa3.44□□□□□ -1.86
MSC-AS1-205ENST00000519068 C9orf163Q8N9P6 203 aa3.44□□□□□ -1.86
MSC-AS1-205ENST00000519068 DPH3Q96FX2 82 aa3.44□□□□□ -1.86
MSC-AS1-205ENST00000519068 C14orf144Q96I85 54 aa3.44□□□□□ -1.86
MSC-AS1-205ENST00000519068 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3.44□□□□□ -1.86
MSC-AS1-205ENST00000519068 NDUFA12Q9UI09 145 aa3.44□□□□□ -1.86
MSC-AS1-205ENST00000519068 PKD1P98161 4303 aa3.43□□□□□ -1.86
MSC-AS1-205ENST00000519068 FRAS1Q86XX4 4008 aa3.43□□□□□ -1.86
MSC-AS1-205ENST00000519068 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
MSC-AS1-205ENST00000519068 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa3.43□□□□□ -1.86
MSC-AS1-205ENST00000519068 A0A1B0GVY2 172 aa3.43□□□□□ -1.86
MSC-AS1-205ENST00000519068 LINC00158P58513 81 aa3.43□□□□□ -1.86
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MSC-AS1-205ENST00000519068 C6orf48Q9UBA6 75 aa3.43□□□□□ -1.86
MSC-AS1-205ENST00000519068 A0A0J9YXY3 114 aa3.42□□□□□ -1.86
MSC-AS1-205ENST00000519068 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa3.42□□□□□ -1.86
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF815PA8K554 130 aa3.42□□□□□ -1.86
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MSC-AS1-205ENST00000519068 S100A12P80511 92 aa3.42□□□□□ -1.86
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MSC-AS1-205ENST00000519068 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa3.41□□□□□ -1.86
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MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa3.41□□□□□ -1.86
MSC-AS1-205ENST00000519068 EPM2AB3EWF7 344 aa3.41□□□□□ -1.86
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MSC-AS1-205ENST00000519068 CXCL5P42830 114 aa3.41□□□□□ -1.86
MSC-AS1-205ENST00000519068 KRTAP10-1P60331 282 aa3.41□□□□□ -1.86
MSC-AS1-205ENST00000519068 CXCL6P80162 114 aa3.41□□□□□ -1.86
MSC-AS1-205ENST00000519068 MEIG1Q5JSS6 88 aa3.41□□□□□ -1.86
MSC-AS1-205ENST00000519068 PRO1933Q9H354 126 aa3.41□□□□□ -1.86
MSC-AS1-205ENST00000519068 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
MSC-AS1-205ENST00000519068 ERG28Q9UKR5 140 aa3.41□□□□□ -1.86
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MSC-AS1-205ENST00000519068 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa3.4□□□□□ -1.87
MSC-AS1-205ENST00000519068 LINC00587B1AMM8 73 aa3.4□□□□□ -1.87
MSC-AS1-205ENST00000519068 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa3.4□□□□□ -1.87
MSC-AS1-205ENST00000519068 PRR3P79522 188 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
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MSC-AS1-205ENST00000519068 SCGB1D4Q6XE38 83 aa3.4□□□□□ -1.87
MSC-AS1-205ENST00000519068 DAND5Q8N907 189 aa3.4□□□□□ -1.87
MSC-AS1-205ENST00000519068 C12orf57Q99622 126 aa3.4□□□□□ -1.87
MSC-AS1-205ENST00000519068 XAGE1AQ9HD64 81 aa3.4□□□□□ -1.87
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MSC-AS1-205ENST00000519068 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.39□□□□□ -1.87
MSC-AS1-205ENST00000519068 A0A1W2PNN7 141 aa3.39□□□□□ -1.87
MSC-AS1-205ENST00000519068 C16orf90A8MZG2 172 aa3.39□□□□□ -1.87
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MSC-AS1-205ENST00000519068 TLX1NBP0CAT3 122 aa3.39□□□□□ -1.87
MSC-AS1-205ENST00000519068 CHTF8P0CG12 524 aa3.39□□□□□ -1.87
MSC-AS1-205ENST00000519068 NPC2P61916 151 aa3.39□□□□□ -1.87
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MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC25A34Q6PIV7 304 aa3.39□□□□□ -1.87
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MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM168BA1KXE4 195 aa3.38□□□□□ -1.87
MSC-AS1-205ENST00000519068 SMIM6P0DI80 62 aa3.38□□□□□ -1.87
MSC-AS1-205ENST00000519068 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
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MSC-AS1-205ENST00000519068 MIEN1Q9BRT3 115 aa3.38□□□□□ -1.87
MSC-AS1-205ENST00000519068 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
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