RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514834.1

ITGA3-214, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ITGA3, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-214ENST00000514834 CXCL5P42830 114 aa8.73□□□□□ -1.01
ITGA3-214ENST00000514834 PTTG1IPP53801 180 aa8.73□□□□□ -1.01
ITGA3-214ENST00000514834 VAMP3Q15836 100 aa8.73□□□□□ -1.01
ITGA3-214ENST00000514834 Q6ZRU5 148 aa8.73□□□□□ -1.01
ITGA3-214ENST00000514834 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.73□□□□□ -1.01
ITGA3-214ENST00000514834 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.73□□□□□ -1.01
ITGA3-214ENST00000514834 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.73□□□□□ -1.01
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ITGA3-214ENST00000514834 KIAA0087Q14695 138 aa8.72□□□□□ -1.01
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ITGA3-214ENST00000514834 CEND1Q8N111 149 aa8.71□□□□□ -1.02
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ITGA3-214ENST00000514834 Q8IZM0 81 aa8.69□□□□□ -1.02
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ITGA3-214ENST00000514834 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.67□□□□□ -1.02
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ITGA3-214ENST00000514834 C10orf25Q5T742 122 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGA3-214ENST00000514834 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGA3-214ENST00000514834 A0A1W2PNN7 141 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGA3-214ENST00000514834 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.02
ITGA3-214ENST00000514834 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGA3-214ENST00000514834 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGA3-214ENST00000514834 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGA3-214ENST00000514834 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGA3-214ENST00000514834 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.65□□□□□ -1.02
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ITGA3-214ENST00000514834 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ITGA3-214ENST00000514834 GAGE10A6NGK3 116 aa8.64□□□□□ -1.03
ITGA3-214ENST00000514834 TMEM238C9JI98 176 aa8.64□□□□□ -1.03
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ITGA3-214ENST00000514834 C2orf82Q6UX34 121 aa8.64□□□□□ -1.03
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ITGA3-214ENST00000514834 A0A1B0GWB2 263 aa8.6□□□□□ -1.03
ITGA3-214ENST00000514834 K7EP34 96 aa8.6□□□□□ -1.03
ITGA3-214ENST00000514834 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.6□□□□□ -1.03
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ITGA3-214ENST00000514834 Q6ZRP5 223 aa8.6□□□□□ -1.03
ITGA3-214ENST00000514834 A0A0J9YXY3 114 aa8.59□□□□□ -1.03
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ITGA3-214ENST00000514834 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.59□□□□□ -1.03
ITGA3-214ENST00000514834 SPCS1Q9Y6A9 102 aa8.59□□□□□ -1.03
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ITGA3-214ENST00000514834 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
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ITGA3-214ENST00000514834 K7ERJ3 54 aa8.55□□□□□ -1.04
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ITGA3-214ENST00000514834 SPANXCQ9NY87 97 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-214ENST00000514834 ERG28Q9UKR5 140 aa8.54□□□□□ -1.04
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ITGA3-214ENST00000514834 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-214ENST00000514834 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-214ENST00000514834 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-214ENST00000514834 LINC01600Q96MT4 127 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-214ENST00000514834 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-214ENST00000514834 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGA3-214ENST00000514834 A0A0B4J2C4 111 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGA3-214ENST00000514834 PFN2P35080 140 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGA3-214ENST00000514834 C1orf137Q5JT78 98 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGA3-214ENST00000514834 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.49□□□□□ -1.05
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