RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512553.5

ITGA3-213, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA3, Length 351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-213ENST00000512553 LINC00158P58513 81 aa5.57□□□□□ -1.52
ITGA3-213ENST00000512553 S100A12P80511 92 aa5.57□□□□□ -1.52
ITGA3-213ENST00000512553 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.57□□□□□ -1.52
ITGA3-213ENST00000512553 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa5.57□□□□□ -1.52
ITGA3-213ENST00000512553 TMEM126AQ9H061 195 aa5.57□□□□□ -1.52
ITGA3-213ENST00000512553 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.56□□□□□ -1.52
ITGA3-213ENST00000512553 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.56□□□□□ -1.52
ITGA3-213ENST00000512553 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
ITGA3-213ENST00000512553 A0A087X002 238 aa5.55□□□□□ -1.52
ITGA3-213ENST00000512553 M0R378 163 aa5.55□□□□□ -1.52
ITGA3-213ENST00000512553 YPEL4Q96NS1 127 aa5.55□□□□□ -1.52
ITGA3-213ENST00000512553 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.54□□□□□ -1.52
ITGA3-213ENST00000512553 PRYO14603 147 aa5.54□□□□□ -1.52
ITGA3-213ENST00000512553 PLNP26678 52 aa5.54□□□□□ -1.52
ITGA3-213ENST00000512553 PRLHP81277 87 aa5.54□□□□□ -1.52
ITGA3-213ENST00000512553 CBLN2Q8IUK8 224 aa5.54□□□□□ -1.52
ITGA3-213ENST00000512553 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.54□□□□□ -1.52
ITGA3-213ENST00000512553 TMEM238C9JI98 176 aa5.53□□□□□ -1.52
ITGA3-213ENST00000512553 SCO1O75880 301 aa5.53□□□□□ -1.52
ITGA3-213ENST00000512553 LEPROTL1O95214 131 aa5.53□□□□□ -1.52
ITGA3-213ENST00000512553 HERVK_113P61574 105 aa5.53□□□□□ -1.52
ITGA3-213ENST00000512553 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.53□□□□□ -1.52
ITGA3-213ENST00000512553 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.53□□□□□ -1.52
ITGA3-213ENST00000512553 A0A0U1RQV1 116 aa5.52□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 TSPAN13O95857 204 aa5.52□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 BOD1L2Q8IYS8 172 aa5.52□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.52□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 SMIM13P0DJ93 91 aa5.51□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 NMUP48645 174 aa5.51□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.51□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa5.51□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 LINC00337Q8N6G1 96 aa5.51□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 HIGD2AQ9BW72 106 aa5.51□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 A0A0U1RRA0 63 aa5.5□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa5.5□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 H0Y8G0 127 aa5.5□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 LEPROTO15243 131 aa5.5□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 TRGC2P03986 189 aa5.5□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.5□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 FAM19A2Q8N3H0 131 aa5.5□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.5□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 LPAP08519 4548 aa5.5□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 SERF1AO75920 110 aa5.49□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 DPM2O94777 84 aa5.49□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 Q8NDZ9 215 aa5.49□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 KCNQ1DNQ9H478 68 aa5.49□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.49□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 CBY1Q9Y3M2 126 aa5.49□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.48□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.48□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 J3QQQ9 107 aa5.48□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 NCR3O14931 201 aa5.48□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 SPRR1AP35321 89 aa5.48□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 C4orf48Q5BLP8 95 aa5.48□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.48□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 SPRR4Q96PI1 79 aa5.48□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 IGKCP01834 107 aa5.47□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
ITGA3-213ENST00000512553 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa5.46□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 TPRXLQ17RH7 258 aa5.46□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 NDUFC2O95298 119 aa5.45□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 FABP4P15090 132 aa5.45□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 DDTP30046 118 aa5.45□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 LINC00310P59036 64 aa5.44□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.44□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.44□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.44□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.43□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 SPINK1P00995 79 aa5.43□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 LINC00483Q53H64 154 aa5.43□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 SMCR5Q8TEV8 140 aa5.43□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 CDIP1Q9H305 208 aa5.43□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 COLCA2A8K830 154 aa5.42□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 B5MCH6 92 aa5.42□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 E9PLD3 99 aa5.42□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 Q6ZRX8 168 aa5.42□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 DAND5Q8N907 189 aa5.42□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.42□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa5.41□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 C5orf52A6NGY3 159 aa5.41□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 IGLV6-57P01721 117 aa5.41□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 Q8NBF4 154 aa5.41□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 PMCHL2Q9BQD1 86 aa5.41□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa5.4□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 TIMM17BO60830 172 aa5.4□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.4□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.4□□□□□ -1.54
ITGA3-213ENST00000512553 A0A0J9YXY3 114 aa5.39□□□□□ -1.55
ITGA3-213ENST00000512553 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
ITGA3-213ENST00000512553 AKR1D1P51857 326 aa5.39□□□□□ -1.55
ITGA3-213ENST00000512553 PET117Q6UWS5 81 aa5.39□□□□□ -1.55
ITGA3-213ENST00000512553 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa5.39□□□□□ -1.55
ITGA3-213ENST00000512553 COPS9Q8WXC6 57 aa5.39□□□□□ -1.55
ITGA3-213ENST00000512553 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms