RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507538.1

RASGEF1B-205, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 3

Gene RASGEF1B, Length 691 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-205ENST00000507538 UBE2BP63146 152 aa11.11□□□□□ -0.63
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RASGEF1B-205ENST00000507538 NMUP48645 174 aa11.1□□□□□ -0.63
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RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa11.06□□□□□ -0.64
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RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
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